linux學(xué)習(xí)100篇12:Linux安裝R以及依賴庫(kù)出現(xiàn)的一些問(wèn)題及解決方法

1.安裝R
在 /etc/apt/sources中添加源

sudo vim /etc/apt/sources.list

在sources.list文件的最后一行為系統(tǒng)添加相應(yīng)的鏡像源

#(19.04)
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu disco-cran35/
# (18.10)
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu cosmic-cran35/
#(18.04;LTS)
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/
#(16.04; LTS)
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/
#(14.04; LTS)
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu trusty-cran35/

更新軟件源列表

sudo apt-get update

執(zhí)行如下命令安裝R語(yǔ)言:

sudo apt-get install r-base

系統(tǒng)會(huì)提示“您希望繼續(xù)執(zhí)行嗎? [y/n]" ,可以直接從鍵盤(pán)輸人y,然后按Enter鍵就可以了娇斩。只要遇到提問(wèn),都在鍵盤(pán)輸人y后按Enter鍵即可胶逢。

舊版本的R安裝時(shí)屏幕會(huì)顯示“--在此連線階段時(shí)請(qǐng)選用CRAN的鏡子--”,并彈出一個(gè)白色背景的豎條形窗口,窗口標(biāo)題是HTTPS CRAN mirros,標(biāo)題下面列出了很多國(guó)家的鏡像列表,可以選擇位于China的鏡像,例如谎仲,選擇China( Bejing)[https],然后單擊OK按鈕,就可以開(kāi)始安裝舞吭。新版本的不會(huì)顯示幔虏,可能是新版本默認(rèn)設(shè)置為外國(guó)版本(我用的3.6.3版本的是這樣)。安裝過(guò)程需要幾分鐘時(shí)間捂掰,當(dāng)然,安裝過(guò)程所需時(shí)間,也和當(dāng)前網(wǎng)絡(luò)速度有關(guān)系敢会。安裝結(jié)束后,輸入“R”啟動(dòng)R。

2.安裝依賴庫(kù)
為了完成可視化分析功能尘颓,需要為R安裝一些依賴庫(kù),包括RMySQL走触、ggplot2、devtools和recharts疤苹。啟動(dòng)R進(jìn)人R命令提示符狀態(tài),執(zhí)行如下命令安裝RMySQL:

> install.packages('RMySQL')

安裝可能會(huì)出現(xiàn)以下錯(cuò)誤:

Configure could not find suitable mysql/mariadb client library. Try installing:
 * deb: libmariadbclient-dev | libmariadb-client-lgpl-dev (Debian, Ubuntu)
 * rpm: mariadb-connector-c-devel | mariadb-devel | mysql-devel (Fedora, CentOS, RHEL)
 * csw: mysql56_dev (Solaris)
 * brew: mariadb-connector-c (OSX)
If you already have a mysql client library installed, verify that either
mariadb_config or mysql_config is on your PATH. If these are unavailable
you can also set INCLUDE_DIR and LIB_DIR manually via:
R CMD INSTALL --configure-vars='INCLUDE_DIR=... LIB_DIR=...'

如下圖所示:


image.png

我們需要安裝所欠缺的組件互广,也就是*deb:(紅色橫線)后面所顯示的組件。執(zhí)行下面命令安裝:

sudo apt-get install libmariadb-client-lgpl-dev

然后再重新執(zhí)行如下命令安裝RMySQL:

> install.packages('RMySQL')

執(zhí)行如下命令安裝繪圖包ggplot2:

> install.packages('ggplot2')

接下來(lái)繼續(xù)運(yùn)行下面命令安裝devtools:

> install.packages('devtools')

安裝時(shí)可能也會(huì)出現(xiàn)類(lèi)似的錯(cuò)誤:

Configuration failed because openssl was not found. Try installing:
 * deb: libssl-dev (Debian, Ubuntu, etc)
 * rpm: openssl-devel (Fedora, CentOS, RHEL)
 * csw: libssl_dev (Solaris)
 * brew: openssl@1.1 (Mac OSX)
If openssl is already installed, check that 'pkg-config' is in your
PATH and PKG_CONFIG_PATH contains a openssl.pc file. If pkg-config
is unavailable you can set INCLUDE_DIR and LIB_DIR manually via:
R CMD INSTALL --configure-vars='INCLUDE_DIR=... LIB_DIR=...'
--------------------------------------------------------------------
ERROR: configuration failed for package ‘openssl’

Configuration failed because libxml-2.0 was not found. Try installing:
 * deb: libxml2-dev (Debian, Ubuntu, etc)
 * rpm: libxml2-devel (Fedora, CentOS, RHEL)
 * csw: libxml2_dev (Solaris)
If libxml-2.0 is already installed, check that 'pkg-config' is in your
PATH and PKG_CONFIG_PATH contains a libxml-2.0.pc file. If pkg-config
is unavailable you can set INCLUDE_DIR and LIB_DIR manually via:
R CMD INSTALL --configure-vars='INCLUDE_DIR=... LIB_DIR=...'

如下圖:


image.png

同樣的卧土,我們安裝*deb后面所缺少的組件即可凸椿,可能需要安裝以下四個(gè)組件:

sudo apt-get install libssl-dev
sudo apt-get install libssh2-1-dev
sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev
sudo apt-get install libxml2-dev

最后在R命令提示符下,再執(zhí)行如下命令安裝taiyun/ recharts :

> devtools::install_github('taiyun/recharts')

是的娄昆,還是會(huì)可能出現(xiàn)錯(cuò)誤:

> devtools::install_github('taiyun/recharts')
錯(cuò)誤: Failed to install 'unknown package' from GitHub:
  Failed to connect to api.github.com port 443: 拒絕連接

安裝R時(shí)我們說(shuō)到新版本的R可能是默認(rèn)使用外國(guó)的鏡像隘庄,我們只需使用以下命令設(shè)置CRAN使用清華大學(xué)鏡像即可:

options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")))

接著重新安裝taiyun/ recharts :

> devtools::install_github('taiyun/recharts')

至此囤官,R可視化分析的安裝工作完成。

參考鏈接:https://blog.csdn.net/m0_37601622/article/details/93135920

https://blog.csdn.net/qq_41858657/article/details/104707330
————————————————
版權(quán)聲明:本文為CSDN博主「Wingkin-」的原創(chuàng)文章颤霎,遵循CC 4.0 BY-SA版權(quán)協(xié)議媳谁,轉(zhuǎn)載請(qǐng)附上原文出處鏈接及本聲明。
原文鏈接:https://blog.csdn.net/Wing_kin666/article/details/106020600

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末友酱,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市晴音,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌缔杉,老刑警劉巖锤躁,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,126評(píng)論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異或详,居然都是意外死亡系羞,警方通過(guò)查閱死者的電腦和手機(jī)郭计,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,254評(píng)論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門(mén),熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來(lái)椒振,“玉大人昭伸,你說(shuō)我怎么就攤上這事「苋耍” “怎么了勋乾?”我有些...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 152,445評(píng)論 0 341
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀的道長(zhǎng)嗡善。 經(jīng)常有香客問(wèn)我,道長(zhǎng)学歧,這世上最難降的妖魔是什么罩引? 我笑而不...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 55,185評(píng)論 1 278
  • 正文 為了忘掉前任,我火速辦了婚禮枝笨,結(jié)果婚禮上袁铐,老公的妹妹穿的比我還像新娘。我一直安慰自己横浑,他們只是感情好剔桨,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,178評(píng)論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開(kāi)白布。 她就那樣靜靜地躺著徙融,像睡著了一般洒缀。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上欺冀,一...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 48,970評(píng)論 1 284
  • 那天树绩,我揣著相機(jī)與錄音,去河邊找鬼隐轩。 笑死饺饭,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛,可吹牛的內(nèi)容都是我干的职车。 我是一名探鬼主播瘫俊,決...
    沈念sama閱讀 38,276評(píng)論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開(kāi)眼,長(zhǎng)吁一口氣:“原來(lái)是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼悴灵!你這毒婦竟也來(lái)了扛芽?” 一聲冷哼從身側(cè)響起,我...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 36,927評(píng)論 0 259
  • 序言:老撾萬(wàn)榮一對(duì)情侶失蹤称勋,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎胸哥,沒(méi)想到半個(gè)月后,有當(dāng)?shù)厝嗽跇?shù)林里發(fā)現(xiàn)了一具尸體赡鲜,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,400評(píng)論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡空厌,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 35,883評(píng)論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年庐船,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片嘲更。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 37,997評(píng)論 1 333
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡筐钟,死狀恐怖,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出赋朦,到底是詐尸還是另有隱情篓冲,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 33,646評(píng)論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布宠哄,位于F島的核電站壹将,受9級(jí)特大地震影響,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏毛嫉。R本人自食惡果不足惜诽俯,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,213評(píng)論 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望承粤。 院中可真熱鬧暴区,春花似錦、人聲如沸辛臊。這莊子的主人今日做“春日...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 30,204評(píng)論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)彻舰。三九已至伐割,卻和暖如春,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間淹遵,已是汗流浹背口猜。 一陣腳步聲響...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 31,423評(píng)論 1 260
  • 我被黑心中介騙來(lái)泰國(guó)打工, 沒(méi)想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留透揣,地道東北人济炎。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,423評(píng)論 2 352
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像辐真,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親须尚。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,722評(píng)論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容