學(xué)習(xí)小組的最后一天疑苫，舍不得，意猶未盡
測序
今日學(xué)習(xí)了啥
到底啥是測序：測序--核酸DNA分子一級結(jié)構(gòu)的測定纷责。
1.怎么區(qū)分一二三代測序
2.二代測序大體流程
3.NGS組學(xué)都包括哪些分類（粗略）
強烈記錄星球推薦的學(xué)習(xí)鏈接和資料
1.二代測序原理介紹視頻：https://share.weiyun.com/5qojuBY 密碼：bxsry4
2.文章《測序的世界》：http://www.reibang.com/p/101c14c3a1d2 怎么會有這么詳細清楚的解釋捍掺，咋講的這么通俗易懂呢，優(yōu)秀，感謝小澤
3.如果還是看不懂，那么請：搜狗微信—搜索“測序原理” 舌胶，公眾號一般解釋的比較清楚婴程。
1.測序的世界
第一代DNA測序技術(shù)：桑格爾-雙脫氧鏈終止法是最為經(jīng)典的一代測序技術(shù)，至今仍是測序行業(yè)的金標準掷贾，目前一代測序在驗證序列（就是平時送公司測序返回來自己blast的那些）以及驗證基因組組裝完整性方面都是金標準。通量低，成本高蚊丐，一代最長能測1000bp，再多了就要重頭開始一遍導(dǎo)致成本高艳吠；另外它一次只測一條麦备，也就是所謂的通量低。準確性高達99.999%昭娩。
第二代DNA測序技術(shù)(next generation sequencing凛篙，NGS)-循環(huán)陣列合成測序法。
主要平臺有：
1.羅氏454公司的GS FLX sequencer
2.Illumina solexa genome analyzer
3.ABI公司的SOLiD sequencer
二代測序大幅度提高了測序速度栏渺，降低了測序成本（下圖）呛梆，保持了高準確性。缺點是讀長短迈嘹，拼接困難削彬，pcr技術(shù)增加了測序的錯誤率。
第三代測序技術(shù)以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies 的納米孔單分子測序技術(shù)為標志：不需要經(jīng)過PCR擴增秀仲，超長讀長融痛，可達二代測序的100倍以上，實現(xiàn)了對每一條DNA分子的單獨測序神僵。錯誤率比二代要高雁刷，達到10-15%。
一保礼、二沛励、三代基因測序技術(shù)各項參數(shù)對比
2.組學(xué)
1.基因組學(xué)（核酸序列分析）
（1）全基因組測序（WGS）
（2）全外顯子組測序（WES）
（3）簡化基因組測序（RRGS）
①RAD-Seq
②GBS
③2bRAD
④ddGBS（也就是ddRAD）
作用：
（1）基因組作圖（遺傳圖譜责语、物理圖譜、轉(zhuǎn)錄本圖譜）
（2）核苷酸序列分析
（3）基因定位
（4）基因功能分析
其它：
以全基因組測序為目標的結(jié)構(gòu)基因組學(xué)
以基因功能鑒定為目標的功能基因組學(xué)
2.轉(zhuǎn)錄組學(xué)（基因表達分析）
（1）mRNA-Seq
（2）IncRNA-Seq（長鏈非編碼RNA）
（3）sRNA-Seq（主要是miRNA-Seq）
作用：
（1）獲得物種或者組織的轉(zhuǎn)錄本信息
（2）得到轉(zhuǎn)錄本上基因的相關(guān)信息目派，如基因結(jié)構(gòu)功能等
（3）發(fā)現(xiàn)新的基因
（4）基因結(jié)構(gòu)優(yōu)化
（5）發(fā)現(xiàn)可變剪切
（6）發(fā)現(xiàn)基因融合
（7）基因表達差異分析
sRNA
3.蛋白質(zhì)組學(xué)
（1）蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)處理坤候、蛋白及其修飾鑒定
（2）構(gòu)建蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫、相關(guān)軟件的開發(fā)和應(yīng)用
（3）蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)功能預(yù)測 （4）蛋白質(zhì)連鎖圖
4.代謝組
（1）代謝物指紋分析
（2）代謝輪廓分析
其他相關(guān)資料（真好真入門）----由生信星球提供鏈接：
（1）測序技術(shù)原理及常用數(shù)據(jù)格式簡介
（2）DNA 測序技術(shù)的發(fā)展：第三代測序法
（3）測序發(fā)展史：150年的風(fēng)雨歷程
（4） 搜索：【陳巍學(xué)基因】視頻1 （本視頻介紹Illumina測序的化學(xué)原理企蹭，包括：建庫白筹、橋式PCR、邊合成邊測序谅摄、雙端測序徒河、Index序列。）Illumina測序化學(xué)原理
第七天學(xué)習(xí)小組最后一導(dǎo)
