利用Tbtools提取Fasta序列

1.打開軟件--Fasttools----》Fast Extract(recommended)

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2. 建立基因組索引

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3. 設(shè)置輸出數(shù)據(jù)路徑

4.設(shè)置輸入數(shù)據(jù)扣汪，\t f分開。

示例：MSU

image.png

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LOC_Os10g33000
ATGGTGGAAGAAAGAGAAAGCTTCGAGAGTCAGTGGGCGCCCTCCGATGTGACAGAAGAT
AATCTGAAGGAGATGGTGGCGCACGGCGTTCTTCCAGCGAAGGAGATCATCGGGTGGCGA
CCGGCATTTGGCGAAGCATTCCCGACTCCCGATACGCATGAAATCGTGGTATTTGCTCAC
TTCTTCTATGGCGGATTTTCTCTTCCAACCTCAAGATTTTTCCGGGGCATTCTGAACTTC
TACGGGATTAGCTTGCATCATCTGAATCCAAACTCCATAGTGCATATTGCCAATTTTATC
CACGCCTGCGAAGCTTTTCTGGGCATTAGGCCTCATTTTGCCTTGTTCCGCCGCATCTTC

提取的數(shù)據(jù)：

Chr10 17276945 17279876
ATGGTGGAAGAAAGAGAAAGCTTCGAGAGTCAGTGGGCGCCCTCCGATGTGACAGAAGAT
AATCTGAAGGAGATGGTGGCGCACGGCGTTCTTCCAGCGAAGGAGATCATCGGGTGGCGA
CCGGCATTTGGCGAAGCATTCCCGACTCCCGATACGCATGAAATCGTGGTATTTGCTCAC
TTCTTCTATGGCGGATTTTCTCTTCCAACCTCAAGATTTTTCCGGGGCATTCTGAACTTC
TACGGGATTAGCTTGCATCATCTGAATCCAAACTCCATAGTGCATATTGCCAATTTTATC
CACGCCTGCGAAGCTTTTCTGGGCATTAGGCCTCATTTTGCCTTGTTCCGCCGCATCTTC

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