生信初入門需要注意的小tips(一)

最近又到了畢業(yè)的高峰期,好多同學(xué)看了網(wǎng)上各種教程,實(shí)操的時(shí)候會(huì)遇到各種bug,其實(shí)這些bug大多數(shù)都是由于我們粗心大意或者不了解生信軟件導(dǎo)致的,bunny今天給大家總結(jié)一下常遇到的小問題耙旦,希望對(duì)大家有幫助

part1 空格雖好脱羡,不要多用哦

Windows系統(tǒng)里,我們可以自由的在文件夾命名時(shí)使用空格免都,但是Linux锉罐、各大語(yǔ)言和各種生信軟件就不這么認(rèn)為了,多一個(gè)空格绕娘,軟件在讀取的時(shí)候就只會(huì)讀到空格前脓规,這時(shí)候問題來了——這個(gè)文件夾根本不存在啊O樟臁G扔摺!這時(shí)候有同學(xué)就開始慌了绢陌,我文件夾不是存在么挨下,為啥報(bào)錯(cuò)啊F晖濉臭笆!

你把那個(gè)空格改成下劃線試試,一準(zhǔn)好使

除了文件夾空格,更多時(shí)候文件里就有空格愁铺,樣本名/OTU/物種/基因/環(huán)境因子啥的鹰霍,只要前面或者后面多一個(gè)空格,軟件就根本認(rèn)不出來了

那有的同學(xué)就要問了:我的肉眼又不是孫悟空的火眼金睛茵乱,空格和制表符咋看出來呢茂洒?

可以用notepad,notepad里的空格和制表符是兩種展示方式似将,如果你看到一個(gè)箭頭获黔,那它就是制表符,如果你看到了一個(gè)點(diǎn)在验,那就是空格了玷氏,看到它出現(xiàn)在制表符前后的時(shí)候,不要猶豫腋舌,刪了它U荡ァ!

Part2 愛我中華块饺,為何出現(xiàn)亂碼

有些同學(xué)說大家都是中國(guó)人赞辩,我的樣本名&文件名當(dāng)然要用中文,可是大多數(shù)的生信軟件它不認(rèn)識(shí)中文呀授艰,只好將中文替換成&*%$等等一些亂七八糟的符號(hào)

所以中文雖然方便辨嗽,做生信分析的時(shí)候最好還是用英文哦



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