A Panel of Normal即PON 是在Somatic calling中非常重要的參考擅笔，尤其是對于沒有對照的單腫瘤樣本掌逛。
PON的共同特點
盡管我們可以構建各種各樣的PON彰檬，而這些PON都有著如下兩個特點:
- 他們都來自正常的樣本辉巡，這里的normal中的意思是來源于正常的組織叹卷，被認為不含有任何的Somatic 突變正蛙。
- 他們的目的都是為了減少variant calling analysis中的假陽性結果，提高分析的準確性塘幅。
PON的樣本數(shù)量要求
對于多少個樣本可以構成PON昔案，并沒有確切的說法，但GATK論壇給的建議是最少用40個樣本來構建电媳。
PON的注意事項
- normal數(shù)據(jù)的生成所涉及的技術應該盡可能和tumor數(shù)據(jù)產(chǎn)生的情況保持一致（如相同的外顯子芯片踏揣，相同的DNA制備方法，相同的測序技術）匾乓。
- 樣品應該選取年輕和健康的個體捞稿，將感染未確診腫瘤的概率降到最小。
- 應該盡量選取血液樣本拼缝。
PON應用場景（GATK）
SNV 和 INDEL
Copy Number Variant
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