今天學(xué)會(huì)了安裝miniconda饺窿，并在conda中安裝fastqc等軟件漓穿，還新創(chuàng)建了多種conda環(huán)境涛菠。
“Say hello to linux”
感謝生信星球 .
Stay hungry. Stay foolish
思維導(dǎo)圖鎮(zhèn)樓https://mubu.com/doc/rakxZnBq
學(xué)習(xí)小組Day3筆記--劉沛東.png
Miniconda-linux appstore
#下載軟件
wget 下載鏈接
#安裝軟件
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
#激活軟件
source ~/.bashrc
#添加清華鏡像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
#查看軟件列表
conda list
#搜索軟件
conda search 軟件名
#安裝軟件
conda install 軟件名 -y #-y自動(dòng)安裝
#卸載軟件
conda remove 軟件名 -y
Conda-environment
#查看conda 環(huán)境
conda info --envs
#添加新環(huán)境 ##conda create -n 環(huán)境名 software1 software2 -y
conda create -n RNA-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
#激活新環(huán)境 ##conda activate name (此時(shí)會(huì)發(fā)現(xiàn)用戶名前多了RNAseq）
conda activate RNA-seq
#退出當(dāng)前環(huán)境
conda deactivate
#卸載環(huán)境
conda remove -n 環(huán)境命名 --all
written by lpdmed
say hello to linux
2020-07-19
