一. 向量
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向量底瓣，元素，標量區(qū)別
圖引自生信星球
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賦值
給變量定義就是賦值, 注意以最后一次為準产捞！注意以下常用表達
x<-c(1,2,3)#常用的向量定義寫法汹来，意為將x定義為由元素1，2页畦，3組成的向量胖替。
x<-(1:10)#從1-10之間所有的整數(shù)
x<-seq(1,10,by = 0.5)#1-10之間每隔0.5取一個數(shù)（注意這里是逗號不是分號）
x<-rep(1:3,times=2)#1-3 重復2次 -
從向量中提取元素
1.根據(jù)元素位置
這里的x是你剛才賦值的變量名，根據(jù)自己的情況來修改
x[4]#x第4個元素
x[-4]#排除法豫缨，除了第4個元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4個元素
x[-(2:4)]#除了……
x[c(1,5)]#第1個和第5個元素
2.根據(jù)值的大小
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1独令，2，5）中的元素
二. 數(shù)據(jù)框
- 練習時先將doudou.txt和huahua.txt數(shù)據(jù)放在RData文件夾下
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讀取本地數(shù)據(jù)
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#讀取文件好芭，分隔符為Tab(點tab鍵可以出來seq)燃箭，有表頭
a<-read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T)#把這個數(shù)據(jù)框賦給一個變量a -
設置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt')#在示例數(shù)據(jù)里有doudou.txt 注意這里的變量X是一個數(shù)據(jù)框
colnames(X)#查看列名
rownames(X)#查看行名,默認值的行名就是行號，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回數(shù)據(jù)舍败，左上角第一格為空招狸，R會自動補為x,用這個命令來修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列為行名
撤銷嗎: 用剛才的read.table命令重新賦值一遍就可以覆蓋了."變"量看最后一次！） -
數(shù)據(jù)框的導出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#其中sep = ","是分隔符改為逗號邻薯，quote=F表示字符串不加雙引號（默認格式帶有雙引號） 裙戏，而quote函數(shù)如果為TRUE的話則表示要帶雙引號，如果是FALSE厕诡，就像這里的quote=F表示不加雙引 -
變量的保存與重新加載
保存的格式是RData累榜。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存當前所有變量
save(frame1,file="frame1.RData")#保存其中一個變量
load("frame1.RData")#再次使用RData時的加載命令 -
提取元素
這里的X是指的我用過的一個變量名，實際應用要懂得替換木人。剛才讓師姐測試我教程的時候很擔憂你們粗暴地復制我的代碼信柿，最后啥也沒看懂。
X[x,y]#第x行第y列
X[x,]#第x行
X[,y]#第y列（橫著寫）
X[y]#第y列（豎著寫）
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X[a:b]#第a列到第b列
X[c(a,b)]#第a列和第b列
X$列名#也可以提取列（并且支持Tab自動補全醒第，不過只能提取一列渔嚷，優(yōu)秀寫法） -
直接使用數(shù)據(jù)框中的變量
比如要取提取列名case和values的為某兩列作散點圖：
1. 方法1
c <-data.frame(case=paste("S",c(1:50)),values=runif(50))這里的paste是拼接字符串的函數(shù)
plot(c$case,c$values)
但這里說這里這種方法有個缺點：數(shù)據(jù)框名a在代碼中重復出現(xiàn)（此處試驗了下沒有）
2. 方法2（這種方法數(shù)據(jù)框名a在代碼中就不重復出現(xiàn)了）
with(c,{
+ plot(case,values)
x<<-summary(values)#求和并賦值給x,<<的意思是作為全局變量，也就是出了with循環(huán)仍有效稠曼。
})
什么是with循環(huán)? 如下百度感覺很形象
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全局變量含義形病？
函數(shù)內(nèi)部的變量通常為局部變量，可以通過 <<- 賦值霞幅，成為全局變量漠吻，這樣就可以在其他函數(shù)中被調(diào)用。
三.其他注意TIP
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腳本窗口使用
新建腳本司恳，并在里面打代碼/粘貼大神代碼途乃。然后保存到RDATA工作目錄下，打開,注意腳本文件的后綴就是R
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在哪看變量
引自生信星球
image.png 其他潛意識小tip
來自生信星球的大神總結
（1）R的賦值符號不是等號扔傅，而是<-
（2）在Console 控制臺輸入命令耍共，相當于Linux的命令行
（3）R的代碼都是帶括號的烫饼，括號必須是英文的。
（4）顯示工作路徑getwd()
設置工作路徑setwd("C:/Users/kingjie/Desktop/Rdata")
（5）向量是由元素組成的试读，元素可以是數(shù)字或者字符串杠纵。
（6）表格在R語言中改名叫數(shù)據(jù)框_
（7）別只復制代碼，要理解其中的命令钩骇、函數(shù)的意思比藻。函數(shù)或者命令不會用時，除了百度/谷歌搜索以外倘屹，用這個命令查看幫助：?read.table银亲，調(diào)出對應的幫助文檔，翻到example部分研究一下唐瀑。
（8）數(shù)據(jù)類型(兩重點)
向量（vector）,矩陣（Matrix）,數(shù)組（Array）,數(shù)據(jù)框（Data frame）,List
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