我的生信入門10 一些基本概念

1.多個(gè)轉(zhuǎn)錄本:

一個(gè)基因產(chǎn)生多個(gè)轉(zhuǎn)錄本通常是由一種原因或者幾種原因?qū)е拢羁赡艿脑蛴兴姆N:

1. Alternative splicing

選擇性剪接(Alternative splicing)是基因的一種表現(xiàn)方式。生物的基因序列中,包含了內(nèi)含子(intron)與外顯子(exon),兩者交互穿插鳍怨,組成基因。其中內(nèi)含子并不表現(xiàn),外顯子才是能夠轉(zhuǎn)錄成mRNA(之后再進(jìn)一步轉(zhuǎn)譯成蛋白質(zhì))的片段客扎。

而選擇性剪接便是利用這樣的特性,將同一基因中的外顯子以不同的組合方式表現(xiàn)罚斗,制造出不同的蛋白質(zhì)徙鱼。比如基因Gene ID: 2668的NM_001190468.1轉(zhuǎn)錄本和NM_199231.2轉(zhuǎn)錄本;

2. Alternative promoter usage

同一個(gè)基因可能由不同的啟動(dòng)子導(dǎo)致產(chǎn)生不同的蛋白質(zhì),比如Gene ID: 2668的NM_000514.4轉(zhuǎn)錄本针姿;

3. Alternative initiation

同一條mRNA中使用不同的翻譯起始密碼子袱吆,通常情況下產(chǎn)生出僅僅在N端有差別的蛋白質(zhì)序列,比如基因Gene ID: 2668的NM_001278098.1轉(zhuǎn)錄本;

4. Ribosomal frameshifting

一種翻譯重編碼機(jī)制距淫,其導(dǎo)致核糖體改變其對(duì)遺傳密碼的讀取绞绒,產(chǎn)生不是由mRNA直接編碼的蛋白質(zhì),或者兩種甚至更多種不同的蛋白質(zhì)榕暇。

2.外顯子蓬衡、內(nèi)含子、mRNA彤枢、CDS撤蟆、ORF區(qū)

基因DNA分為編碼區(qū)和非編碼區(qū),編碼區(qū)也就是轉(zhuǎn)錄區(qū)包含外顯子和內(nèi)含子堂污,一般非編碼區(qū)有基因表達(dá)的調(diào)控功能家肯。外顯子和內(nèi)含子都被轉(zhuǎn)錄到mRNA前體hnRNA中,當(dāng)hnRNA經(jīng)過(guò)剪接后變?yōu)槌墒靘RNA后盟猖。內(nèi)含子被剪除(又叫非編碼RNA)讨衣,外顯子保留,真正編碼蛋白質(zhì)的是外顯子式镐,但不是所有的外顯子都能翻譯成蛋白反镇。因?yàn)榧艚雍髢?nèi)含子組成mRNA后,mRNA包括UTR(非翻譯區(qū))和CDS(蛋白編碼區(qū))娘汞。CDS蛋白質(zhì)編碼區(qū)歹茶,是真正編碼一段蛋白產(chǎn)物的序列。

開放讀碼區(qū)ORF 是從一個(gè)起始密碼子開始到一個(gè)終止密碼子結(jié)束的一段序列,不是所有的讀碼區(qū)都能表達(dá)出蛋白產(chǎn)物惊豺。 CDS和ORF的關(guān)系? CDS必然是ORF燎孟,但是ORF不一定是CDS,因?yàn)椴皇撬械腛RF都能最終表達(dá)產(chǎn)生蛋白產(chǎn)物尸昧。 ORF--translation? CDS----transcription


基因結(jié)構(gòu)


mRNA結(jié)構(gòu) 圖來(lái)自 上校的貓
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