為什么要閱讀文獻

剛進入一個領域纺蛆，或者接手新課題的時候吐葵，需要研究人員能快速地從整體上把握該領域的發(fā)展歷史以及目前的進展，從而更好地制訂研究計劃桥氏。除了閱讀權(quán)威的教材以及請教相關人士温峭，閱讀文獻是主要的途徑之一。作為一位科研工作者或者是學生字支，閱讀文獻是掌握相關領域脈絡以及追蹤最新話題的一個基本功凤藏。跟傳統(tǒng)教材相比，文獻的更新速度快堕伪、內(nèi)容簡短揖庄，并且可以根據(jù)個人的關注點，針對性的組織內(nèi)容欠雌。然而蹄梢，大量的文獻對日常管理以及追蹤造成了一定的負擔。本文就針對文獻的收集富俄、管理以及追蹤發(fā)表一些個人的看法禁炒。

文獻的種類

本文初步將非教材類的、相關人士進行撰寫的文章定義為文獻蛙酪，主要包括以下4類。

第一類：中文博士及碩士畢業(yè)論文

這類文獻有以下的特點翘盖。第一桂塞，內(nèi)容詳盡。具體到實驗的操作流程馍驯，試劑的配置阁危、組成和廠家玛痊，都會詳細記錄；第二狂打，有一定的系統(tǒng)性擂煞。優(yōu)秀的博士及碩士畢業(yè)論文，往往對相關領域能有較為全面的描述趴乡，并且在參考文獻部分也會列出許多核心文章对省，因此，可以快速了解行業(yè)概況晾捏，并且為后續(xù)深入挖掘提供了很好的參考蒿涎；第三，較簡單惦辛。通過閱讀劳秋，可以了解到常用的核心詞匯是什么，常見的試驗方法以及當前存在的問題和解決方案都有哪些胖齐。并且玻淑，都是用中文寫的，對英語小白簡直不能更友善呀伙。

第二類：中文綜述

綜述一般由領域大牛撰寫补履，描述了領域的進展進程，目前存在的問題以及常見的解決方案区匠，甚至是可能的發(fā)展方向干像。相對于第一類文獻，權(quán)威性更高并且囊括的內(nèi)容更全驰弄，因此十分適合快速了解行業(yè)概況麻汰。從中文綜述下手，同樣為了照顧英文小白戚篙。

第三類：英文綜述

畢竟國內(nèi)期刊的數(shù)量有限且高品質(zhì)較少五鲫，因此，需要得到更多的信息岔擂，看英文文獻是必不可少的位喂。與此同時，許多國內(nèi)大牛也會選擇在頂級英文期刊發(fā)表論文乱灵，所以英文閱讀無障礙的情況下塑崖，盡量選擇英文文獻。然而痛倚，這在某些行業(yè)并不適用规婆，例如需要了解的課題是針對天朝的研究，那恭喜你，中文文獻就夠用了抒蚜。

第四類：英文研究性論文

當決定研究方向以及具體研究對象之后掘鄙，就需要參考別人是如何開展項目的，從而制訂出自己的研究計劃嗡髓，這時就需要閱讀英文研究性論文操漠。閱讀這類論文需要注意以下幾點。第一饿这，并不是所有的試驗方法都是可靠的浊伙。一開始看文獻的時候可能無法分辨其可靠性，這時可以不必過于關注研究的細節(jié)蛹稍，當積累一定的閱讀量之后吧黄，再重新挑選可靠的論文作為參考的模板。但必須要記得唆姐，盡信書不如無書拗慨，要對他人的結(jié)論有一定的懷疑態(tài)度。下文中也會提到一些文獻篩選的方法奉芦，心急的同學可以直接閱讀赵抢；第二，要清楚自身的研究目標声功，不要被帶亂節(jié)奏烦却。當文獻看多了之后，就會接觸到很多新的概念先巴，產(chǎn)生許多新的想法其爵。如果課題研究時間允許，可以將這些新的想法整合到方案之中伸蚯，反之摩渺，則要懂得取舍，在結(jié)果為導向的當今社會剂邮，沒有產(chǎn)出就是滅亡摇幻，盡善盡美也得考慮情況；第三挥萌，并不是越多越好绰姻。這部分涉及到一些閱讀技巧，下文再詳細說明引瀑。但要記住狂芋，不要把自己埋在文海中不能自拔，美好的生活還有詩和遠方和吃吃吃憨栽。

文獻的收集

清楚了文獻的類型帜矾，接下來就是如何收集辆影。文獻的來源有很多，經(jīng)過前輩整理的或者是權(quán)威人士推薦的黍特。但這兩類來源并不是一直都有，這就需要研究人員從各大文獻數(shù)據(jù)庫獲取相關文獻锯蛀。

常用的中文數(shù)據(jù)庫有中國知網(wǎng)（CNKI）灭衷、萬維等，研究生論文及中文綜述大多可以在這些數(shù)據(jù)庫中找到旁涤，因為筆者沒怎么看過中文資料翔曲，所以就不詳細介紹了。一般高校都購買了相關數(shù)據(jù)庫劈愚，通過校內(nèi)網(wǎng)可以直接下載瞳遍，如果沒有買也沒關系，各種論壇各種求菌羽，比如小木蟲的文獻板塊掠械，或者找老板和其他學校的同學幫忙下。

常用的英文數(shù)據(jù)庫有google scholar注祖、pubmed猾蒂、web of science、各種雜志社的官方網(wǎng)站等是晨。其中google scholar要翻墻肚菠，web of science需要通過校內(nèi)網(wǎng)登錄，而且筆者是苦逼的生物汪罩缴，因此這里著重介紹一下pubmed和雜志社官方網(wǎng)站的使用蚊逢，其余的途徑大家自行摸索。

Pubmed是NCBI旗下的文獻數(shù)據(jù)庫箫章，通過整合MEDLINE烙荷，生命科學雜志以及在線電子書出版商等多種途徑，實現(xiàn)一站式搜索炉抒。登錄之后的界面是這樣子的奢讨。

可以通過搜索關鍵詞，全標題焰薄，作者（能夠得到某個課題組的相關著作拿诸，一般同一實驗室較優(yōu)秀文章的通訊作者都是大老板）等內(nèi)容得到相關信息。這里筆者以lncRNA為關鍵詞進行示范塞茅，詳細的入門信息可以閱讀左下角using pubmed-> pubmed quick start guide ,其余的模塊也可以點進去看一下亩码。

縱向來看，搜索結(jié)果包括三列野瘦。第一列忠烛，可以限定文獻的類型。例如于宙，可以限定文章類型為Reviews荚坞，是否為全文免費下載Free full text（下載問題下文再提），出版年限等等询张；第二列，就是搜索的結(jié)果。這里需要注意的是上方的Format史辙，可以調(diào)整每個記錄所顯示的信息，一般不建議在搜索結(jié)果里面直接閱讀摘要佩伤，除非內(nèi)容很少的情況下聊倔。還有搜索結(jié)果的排序方式，默認是按照發(fā)表時間生巡，最新的排在最前面耙蔑；第三列，是對搜索結(jié)果的一些統(tǒng)計信息孤荣，比如那個柱狀圖反應了文章數(shù)量逐年的變化情況甸陌，可以點擊某個區(qū)間得到一定年限的文獻，還有跟搜索關鍵詞相關的一些內(nèi)容盐股。

同樣的第三列往下拉邀层，這里顯示了在圖注中搜索關鍵詞的結(jié)果。有時候看圖比看文字更加直觀遂庄，當成為老司機之后可以多留意這方面的信息寥院，或者當不知道如何呈現(xiàn)實驗結(jié)果的時候也可以在這里找到靈感。

往下是titles with your search terms涛目，這里需要注意的是秸谢，默認的搜索范圍是全文，所以關鍵詞可能出現(xiàn)在文章的正文而不是題目中霹肝，而這個區(qū)域就將搜索范圍限定在了文章的標題估蹄。

在往下的是find relative data，因為pubmed是文獻的數(shù)據(jù)庫沫换，而NCBI除了文獻還有基因臭蚁、蛋白以及測序得到的SRA等其他數(shù)據(jù)庫，在這里可以轉(zhuǎn)到NCBI的其他數(shù)據(jù)庫進行搜索讯赏。既然我們是找文獻的垮兑，所以就不用轉(zhuǎn)過去了。

還有下方的Search details漱挎，這是搜索引擎所使用的搜索規(guī)則系枪，主要用來限定多個關鍵詞之間是同時出現(xiàn)還是單獨出現(xiàn)，以及出現(xiàn)的地方是在標題磕谅、摘要或者是正文等等私爷。其中雾棺，雙引號內(nèi)就是搜索的關鍵詞，Pubmed會自動根據(jù)關鍵詞進行擴展衬浑，例如這里就擴展了long noncoding rna等捌浩，如果需要精確匹配，可以點擊搜索欄下的advanced工秩，有小驚喜哦嘉栓。這里有個技巧，可以將多個單詞輸入在雙引號內(nèi)再進行搜索拓诸，就可以進行精確匹配，不然Pubmed會將每個單詞都拆開來麻昼，視為一個搜索條件奠支。而AND OR用來限定關鍵詞的是否同時出現(xiàn)，方括號內(nèi)限定搜索的范圍是文章的哪一部分抚芦。更多的搜索規(guī)則有興趣的同學可以問度娘倍谜，這里就不詳細介紹。（題外話：所有搜索引擎都有自己的搜索規(guī)則叉抡，掌握一些相關內(nèi)容可以更快搜索到想要的文件的尔崔，例如，bingo可以通過filetype限定文件類型褥民，搜索PDF簡直不能更快）

除了Pubmed季春，其余的數(shù)據(jù)庫也各有特色。Web of science能夠通過影響因子排序消返，并且可以限定領域或者其他條件载弄。Springer以及Wiley等有很多整理好的優(yōu)質(zhì)教材。這里就不一一介紹了撵颊。

然而宇攻，并不是所有文獻都能夠免費下載，這里就提兩個途徑下載收費文獻倡勇。Sci-hub下載文獻逞刷，gen.lib下載外文書籍。具體方式可以問度娘哦~

文獻的追蹤

文獻一直在不斷更新妻熊，半月刊夸浅、月刊、季刊扔役，每次都去數(shù)據(jù)庫搜索十分麻煩题篷，還容易遺漏。如何讓文獻自動送上門呢厅目，筆者推薦使用RSS軟件進行文獻的追蹤番枚。

Windows平臺下可以使用FeedDemon法严，但這個軟件從2013年開始已經(jīng)不再維護更新，然而目前的基礎功能已經(jīng)足夠滿足一般文獻追蹤需求葫笼。下載地址http://feeddemon.com/

Mac平臺下可以使用RSS訂閱器深啤，因為筆者太窮買不起蘋果所以沒用過，以后能使用到再給大家出測評的文章路星。

FeedDemon的界面是這樣子的溯街。

如何建立新的訂閱呢，這里還是以Pubmed為例洋丐，記得先打開FeedDemon呈昔。文獻搜索之后在搜索欄下面有這樣一個按鈕Create RSS。

點擊之后是這樣的友绝。

Number of items displayed是這次顯示的文章數(shù)量堤尾，F(xiàn)eed name是所創(chuàng)建訂閱的名稱，這個可以之后修改迁客。點擊Create RSS郭宝。這時，就會出現(xiàn)下一個界面掷漱。點擊xml進行跳轉(zhuǎn)粘室。

這時，瀏覽器就會跳轉(zhuǎn)到下面的界面卜范。

使用的下拉菜單中可以選擇訂閱器衔统，這里選擇FeedDemon然后點擊立即訂閱，此時海雪，之前打開的FeedDemon就會有反應了缰冤。

一直點擊下一步，就可以完成訂閱喳魏。

訂閱之后棉浸，可以將訂閱源進行分類，修改刺彩，還可以對新內(nèi)容設置篩選條件迷郑，這里就不詳細介紹，各位親們自己研究咯创倔。如果實在不會嗡害，那就給我發(fā)紅包！我手把手教你畦攘！

大部分數(shù)據(jù)庫以及雜志官網(wǎng)都會提供RSS訂閱服務霸妹，但也有些雜志并不提供。遇到這種情況知押，可以自己創(chuàng)建xml格式的訂閱源叹螟，推薦使用Feed43網(wǎng)站鹃骂。網(wǎng)站是免費的，但是是英文罢绽，以后再開文章詳細介紹該網(wǎng)站的使用畏线。除了訂閱文獻，還可以用來訂閱各種博客和論壇的更新良价，就看小伙伴們的需求了寝殴。

文獻的管理

找到需要的文獻后，就需要下載到本地進行閱讀明垢。部分同學喜歡通過構(gòu)建文件夾的方式在本地進行管理蚣常。但是，當文獻數(shù)量過多的時候痊银，就很容易造成丟失抵蚊，并且判斷新下載的文獻是否已經(jīng)存在比較麻煩。因此曼验，這里推薦使用EndNote進行文獻管理。推薦的理由如下：第一粘姜，功能強大鬓照。Endnote的開發(fā)商是web of science的東家Thomson Reuters，所謂背靠大樹好乘涼孤紧，該軟件的設計也是誠意滿滿豺裆；第二，除了文獻管理号显，還能夠進行引文插入臭猜。Endnote支持大量的插入格式，并且與好基友office word完美兼容押蚤；第三蔑歌，下載文獻方便。Endnote與多個數(shù)據(jù)庫完美兼容揽碘，當需要批量下載原文時次屠，不再需要一篇篇的找到下載鏈接。當然雳刺，Endnote對中文數(shù)據(jù)庫的支持是一個弱點劫灶，如果看中文較多可以使用NoteExpress。

接下來介紹Endnote中如何導入文獻掖桦，管理文獻以及進行文獻的交流本昏。還有介紹文獻閱讀的一些技巧。今天暫時更新到這枪汪，小伙伴兒們?nèi)绻信d趣的話敬請期待咯涌穆。