生物信息數(shù)據(jù)分析入門-小結(jié)
出發(fā)點(diǎn)
2014年春節(jié)一疯，我第一次呆在學(xué)校過年灰粮，自以為通過寒假的努力隶校，可以在開學(xué)前掌握生信數(shù)據(jù)分析漏益，完成手上的項(xiàng)目。然而事實(shí)并非如此深胳，生物信息數(shù)據(jù)分析绰疤，看似簡單，實(shí)則水深舞终。差不多4年了轻庆，是時候做個總結(jié)了。大體要整理的相關(guān)內(nèi)容暫時就這么多啦敛劝，其他的后面進(jìn)行修改與增補(bǔ)余爆，認(rèn)為有需要調(diào)整的，隨時與我聯(lián)系夸盟。
大體上蛾方，這將會是一年的工作量。
目錄
高通量測序技術(shù)了解
1.測序原理
1. 測序技術(shù)的發(fā)展-簡史
2. 一代測序技術(shù)原理
3. 二代測序技術(shù)原理
3. 三代測序技術(shù)原理.
4. 四代測序技術(shù)原理？
2.了解高通量測序數(shù)據(jù)分析中的主要文件格式
1.fasta
2.fastq
3.SAM/sam
4. gtf文件/gff文件
5. .....
3.基本數(shù)據(jù)分析邏輯
1.大體概述
2.序列比對
2.讀段計數(shù)
3.表達(dá)量估計
4.差異表達(dá)分析
5.基因**結(jié)構(gòu)**注釋
6.基因**功能**注釋
7.其他分析
4.linux相關(guān)基礎(chǔ)
1.系統(tǒng)安裝
2.常見壓縮格式
3. gz壓縮
2. tar.gz壓縮
3. bz壓縮
5.腳本編程基礎(chǔ)
1.perl語言編程及應(yīng)用
2.R語言的使用
3.python語言編程及應(yīng)用
6.一些常見軟件的快速上手與使用
1.Cytoscape的簡單使用
2.BiNGO的進(jìn)行Gene Ontology分析
3.植物組學(xué)基因功能研究利器-Mapman
4.TBtools的簡介
學(xué)習(xí)到的點(diǎn)….
MarkdownHere插件轉(zhuǎn)換表格的時候转捕，表格的前一行必須空一行…..
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