2020-003 鏡像也有可能出問題

鏡像也有可能出問題

本文基于windows绑青,所有類似<your_user_name>的字段需要自行進(jìn)行替換。

在使用python和R時(shí)屋群,經(jīng)常需要安裝包闸婴,包的官方服務(wù)器在國外,我們一般選擇配置國內(nèi)鏡像來解決下載速度問題芍躏。

國內(nèi)鏡像最常用的是清華的tuna鏡像:

image-20200719101931008

可以看出邪乍,清華鏡像提供了計(jì)算機(jī)領(lǐng)域的常用安裝包下載以及常用鏡像。

我的anaconda和R就使用了清華鏡像。

anaconda

修改或新建C:\Users\<your_user_name>\.condarc

內(nèi)容為:

channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
channel_alias: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/pro
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

R

修改C:\Program Files\R\R-3.6.1\etc\Rprofile.site

options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(BioC_mirror="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/bioconductor")
options(url.method='libcurl')
options(download.file.method = 'libcurl')

這里還修改了下載包的網(wǎng)絡(luò)協(xié)議庇楞,不然win上下載包可能出現(xiàn)問題榜配。

anaconda syncing

周五上午我用conda安裝包的時(shí)候,出現(xiàn)了如下錯(cuò)誤:

Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.
Collecting package metadata (repodata.json): failed

后面還有很長吕晌,就不放了蛋褥,觀察一下具體error是OpenSSL.SSL.WantReadError。conda之前一直都沒有問題睛驳,怎么突然出問題烙心,百度了這個(gè)錯(cuò)誤,網(wǎng)上居然也沒有特別相關(guān)的內(nèi)容柏靶,一臉懵逼弃理。之后我就隨緣式的打開了清華鏡像網(wǎng)站。

QQ截圖20200717104650

咦屎蜓,syncing痘昌,這個(gè)就有點(diǎn)意思了,看來極有可能是因?yàn)檫@個(gè)鏡像目前正在同步炬转,所以不能使用辆苔。那么我就要考慮使用原始的國外鏡像。

臨時(shí)修改我的配置文件

default_channels:
  - https://repo.continuum.io/pkgs/main
  - https://repo.continuum.io/pkgs/free
  - https://repo.continuum.io/pkgs/r

repo.continuum.io是anaconda官方鏡像扼劈,修改之后再conda安裝就好了驻啤。

如果不想這么麻煩,而且知道包具體在哪個(gè)channel的話荐吵,可以使用

conda install <package_name> --channel https://repo.continuum.io/pkgs/main

不過如果conda在使用該指定channel找不到包的時(shí)候骑冗,會自動繼續(xù)查找default_channels里的channel,當(dāng)清華正在同步時(shí)先煎,依舊會出現(xiàn)error贼涩。

后來發(fā)現(xiàn)十幾分鐘后syncing就結(jié)束了,之后的默認(rèn)安裝一切正常薯蝎,看來我不該起這么早工作遥倦。

CRAN syncing

今天上午,我又隨緣的打開了清華鏡像網(wǎng)站占锯,突然看到R的鏡像cran正在syncing

QQ截圖20200719094510

不如測試下R安裝會出現(xiàn)什么問題袒哥,沒想到居然成功了,然后再打開清華鏡像網(wǎng)站消略,發(fā)現(xiàn)同步已經(jīng)結(jié)束堡称,真的巧。

如果你沒這么巧又急著安裝包的話艺演,可以指定鏡像:

install.packages('<package_name',repos='https://cloud.r-project.org/')

r-project是官方鏡像却紧,直接打開cloud.r-project.org可以看到鏡像列表婿失,選擇一個(gè)國內(nèi)其他鏡像也可。R在安裝包時(shí)如果指定了鏡像啄寡,在該鏡像嘗試失敗時(shí)不會嘗試repos里的已存鏡像豪硅,和python有些不同。

感想

同步鏡像一般發(fā)生在凌晨挺物,結(jié)束在早上懒浮,如果你碰巧起了個(gè)大早又要安裝包,有可能遇到我這種問題识藤。希望我的推文能夠幫助到你砚著。

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