··· shell
wget http://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.10.0/sratoolkit.2.10.0-ubuntu64.tar.gz
?
解壓軟件
```shell
tar xzvf sratoolkit.2.10.0-ubuntu64.tar.gz
轉(zhuǎn)到這個目錄下涩哟，并查看里面的文件
cd sratoolkit.2.10.0-ubuntu64
打開程序所在目錄
cd bin
配置環(huán)境變量
echo "export PATH=\$PATH:\$HOME/local/app/sratoolkit.2.10.0-ubuntu64/bin" >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
轉(zhuǎn)到 lecture 文件夾下
mkdir -p ~/edu/lec4
cd ~/edu/lec4
建立prefetch命令
sudo apt install sra-toolkit
獲取文件
prefetch SRR1553610
文件存儲位置
ls ~/ncbi
使用find工具查看
find ~ncbi
cat *.fastq | grep @SRR | wc -l
