#!/bin/bash
if [ $# !=3 ];then
echo $0 <gtf> <fasta> <refOut>"
if
extract_splice_sites.py $1 >splice_sites.txt
extract_exons.py $1 >exons.txt
hisat2-build --exon exons.txtt --ss splice_sites.txt $2 $3
hasit2 build index
?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯(lián)系作者
- 文/潘曉璐 我一進店門深滚，熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來奕谭，“玉大人，你說我怎么就攤上這事痴荐⊙” “怎么了？”我有些...
- 文/不壞的土叔 我叫張陵蹬昌，是天一觀的道長混驰。 經(jīng)常有香客問我，道長，這世上最難降的妖魔是什么栖榨？ 我笑而不...
- 正文 為了忘掉前任昆汹，我火速辦了婚禮，結果婚禮上婴栽，老公的妹妹穿的比我還像新娘满粗。我一直安慰自己，他們只是感情好愚争，可當我...
- 文/花漫 我一把揭開白布映皆。 她就那樣靜靜地躺著，像睡著了一般轰枝。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪捅彻。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上，一...
- 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼澈驼，長吁一口氣：“原來是場噩夢啊……” “哼！你這毒婦竟也來了筛武？” 一聲冷哼從身側響起缝其，我...
- 正文 年R本政府宣布快鱼，位于F島的核電站，受9級特大地震影響，放射性物質發(fā)生泄漏抹竹。R本人自食惡果不足惜线罕，卻給世界環(huán)境...
- 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望窃判。 院中可真熱鬧钞楼，春花似錦、人聲如沸袄琳。這莊子的主人今日做“春日...
- 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽唆樊。三九已至宛琅，卻和暖如春，著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間逗旁，已是汗流浹背嘿辟。 一陣腳步聲響...
推薦閱讀更多精彩內容
- 問題描述： Error:Could not find com.android.tools.build:gradle...
- https://stackoverflow.com/questions/39676939/how-does-str...
- 朕最近又開始調研ionic了舌缤，半年沒用發(fā)現(xiàn)ionic cli已經(jīng)升級了箕戳，在執(zhí)行ionic cordova buil...
- Error:Timeout waiting to lock cp_proj class cache for bui...
