寫在前面
很多時候，我們做完轉(zhuǎn)錄組煤辨，會想著看看樣品與樣品之間的表達(dá)相關(guān)性如何裳涛？依此，可以看看是否存在異常樣品众辨，也或許可以找到一些生物學(xué)相關(guān)問題端三。常常，我會使用 R 語言的 Corr 函數(shù)鹃彻，然后用 pheatmap 出個圖郊闯。當(dāng)然，這個兩行命令就解決了蛛株。但是呢 pheatmap 出的熱圖調(diào)整起來還是麻煩团赁。為了偷懶，我決定花點(diǎn)時間谨履，在 TBtools 中直接寫一個欢摄。因?yàn)檫@個功能比較簡單，其實(shí)就是讀取表達(dá)量矩陣笋粟，計算樣品間相關(guān)系數(shù)怀挠，用系數(shù)矩陣?yán)L制熱圖析蝴。
Expression Corr Calc
感覺就是十來分鐘的事情，真的太簡單绿淋。打界面麻煩了點(diǎn)闷畸，不過我也有些好的組件，所以吞滞，其實(shí)也簡單佑菩。結(jié)果如下，
從界面來看冯吓，使用更簡單倘待，只需要給一個基因表達(dá)量矩陣即可。
點(diǎn)擊 Start 之后组贺，可以看到輸出的 相關(guān)系數(shù)矩陣凸舵。
方便起見，同步輸出 Heatmap失尖，如下
接下來就是按照熱圖常見操作啊奄，做個微調(diào)，得到圖稿如下
看起來不錯掀潮，當(dāng)然其實(shí)就是調(diào)用 TBtools 的 Heatmap菇夸，所以你可以做各種各樣的微調(diào).....
寫在最后
Emmm，又是一個簡單的小工具仪吧。事實(shí)上庄新，我很久以前也有想過寫這個，但是呢....用不上薯鼠。這次寫的原因簡單择诈，我覺得原有的方式出來的熱圖，不是我要的效果出皇，因?yàn)椴粔蚝每础?br> 但是羞芍，TBtools 出的熱圖，好看郊艘！而且荷科，細(xì)節(jié)容易調(diào)整。
