Cell-type–specific || 單細(xì)胞文章新范式

  • 組織器官圖譜
  • 某一細(xì)胞類型異質(zhì)性
  • 細(xì)胞類型特異性分析

單細(xì)胞技術(shù)帶給我們的精度可見一斑沽一。最近注意到單細(xì)胞的文章題目有的朝著Cell type–specific(細(xì)胞類型特異性)發(fā)展了熊咽。之前的圖譜是聚類后注釋出細(xì)胞類型或者亞型,現(xiàn)在是分析每個亞型有什么別的特點(diǎn)潦匈。細(xì)胞能有什么特點(diǎn)呢阱高?

什么是細(xì)胞類型,不就是基因選擇性表達(dá)的結(jié)果嗎茬缩?而基因的選擇表達(dá)受到一系列的轉(zhuǎn)錄調(diào)控赤惊,在這個意義上,細(xì)胞命運(yùn)背后的驅(qū)動力在于各自轉(zhuǎn)錄因子表達(dá)的程序化及其靶標(biāo)基因凰锡。有的細(xì)胞類型里面是不是有其特異的轉(zhuǎn)錄因子呢未舟?有圈暗。而細(xì)胞類型一旦形成,他又需要通過表觀遺傳機(jī)制來記憶并把其身份傳遞給子代細(xì)胞处面。那么厂置,有的細(xì)胞類型里面是不是有特異的表觀遺傳現(xiàn)象?有魂角。

所以昵济,所謂的細(xì)胞類型特異的,指的是什么野揪?

  • 基因
  • 轉(zhuǎn)錄因子
  • 表觀遺傳

細(xì)胞類型特異性來自基因調(diào)控和表達(dá)模式的特異性访忿,最后落腳在了基因上。

來看斯稳,小哥哥給你們化的簡筆畫:

舉幾個例子:

Cell-type-specific analysis of alternative polyadenylation using single-cell transcriptomics data

Cell-Type-Specific Complement Expression in the Healthy and Diseased Retina

Cell type–specific genetic regulation of gene expression across human tissues

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