同學(xué)你好途事,你有一艘生信航母待查收

作者:白介素2
某同學(xué):小張小張,我想查一下某某某雨让,你有沒(méi)有數(shù)據(jù)庫(kù)給我用下呀?
我: 我沒(méi)有關(guān)注你這個(gè)領(lǐng)域哎忿等,你要不要栖忠。。。


image.png

同學(xué):^^^^^^(看來(lái)你生信學(xué)的也不怎么樣嘛庵寞,連個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)都提供不了)狸相。
我:(勞資又不是專(zhuān)門(mén)生產(chǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)的)


image.png

導(dǎo)師:小張啊,你那里有沒(méi)有什么新的數(shù)據(jù)庫(kù)可以用捐川,我們看看能不能豐富一下文章的內(nèi)容
我: 最近沒(méi)怎么關(guān)注脓鹃,應(yīng)該。属拾。将谊。沒(méi)有吧
image.png

導(dǎo)師:小張啊,是不是最近游戲玩多了渐白,以后要加強(qiáng)學(xué)習(xí)哈尊浓,不能松懈。

我:(數(shù)據(jù)庫(kù)那么多纯衍,我又不是電腦)


image.png

于是乎栋齿,小張苦心孤詣,大干一場(chǎng)襟诸,終于找到一艘航母瓦堵,從此生信數(shù)據(jù)庫(kù)資源了然于心。包含各類(lèi)數(shù)據(jù)庫(kù)2458個(gè)歌亲,內(nèi)容涵蓋菇用,DNA,RNA,蛋白質(zhì),基因突變陷揪,酶與通路惋鸥,基因組數(shù)據(jù)庫(kù),免疫相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)悍缠,微陣列基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)卦绣,細(xì)胞器數(shù)據(jù)庫(kù),植物數(shù)據(jù)庫(kù)飞蚓,結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)滤港,及分析工具,可謂是應(yīng)用盡有呀趴拧!

廣而告之

說(shuō)一個(gè)事溅漾,鑒于簡(jiǎn)書(shū)平臺(tái)在信息傳播方面有不足之處,應(yīng)粉絲要求著榴,白介素2的個(gè)人微信平臺(tái)已經(jīng)開(kāi)啟樟凄,繼續(xù)聊臨床與科研的故事,R語(yǔ)言兄渺,數(shù)據(jù)挖掘,文獻(xiàn)閱讀等內(nèi)容。當(dāng)然也不要期望過(guò)高挂谍,微信平臺(tái)目前的定位是作為自己的讀書(shū)筆記叔壤,如果對(duì)大家有幫助最好。如果感興趣口叙, 可以?huà)叽a關(guān)注下炼绘。


qrcode_for_gh_9eaa04438675_258.jpg

image.png

我們就展示下大家感興趣的微陣列和基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)吧:
image.png

image.png

怎么樣,是不是那么多新鮮的面龐妄田,
image.png

原來(lái)還有那么多我們不知道的俺亮,如果說(shuō)此前你擁有的是一架戰(zhàn)機(jī),那么這一次疟呐,你將得到一艘航空母艦脚曾。 這艘航母收納了來(lái)自Nucleic Acids Research,BioMed Central 中的數(shù)據(jù)庫(kù)資源启具,還包含Pubmed中篩選出的數(shù)據(jù)庫(kù)本讥。
image.png

于是我就從里面隨便挑了一個(gè)我們熟悉的關(guān)于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的小公舉:GEOmetadb,這是專(zhuān)門(mén)有人設(shè)計(jì)的一個(gè)用于更方便的檢索GEO數(shù)據(jù)的小工具啦鲁冯,雖然咱們還不知道拷沸,早就有人用上啦,不要out奧
image.png

然后薯演,你就可以開(kāi)心的檢索啦撞芍,簡(jiǎn)單易學(xué),方便高效:
image.png

當(dāng)然跨扮,這只是一個(gè)小工具啦序无,于是我又在其中找了一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)兼工具,Allen Brain Atlas 一個(gè)關(guān)于腦的基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)好港,細(xì)胞愉镰,組織,小鼠钧汹,人類(lèi)的數(shù)據(jù)都有奧丈探。
image.png

于是我就是隨便找個(gè)基因CCL5挖掘了一下:
image.png

image.png

雖然我也不知道這些挖掘能干嘛,還是大家各自找自己喜歡的數(shù)據(jù)庫(kù)去挖掘吧拔莱,在你的航母上去找你喜歡的戰(zhàn)斗雞吧碗降。
image.png

寫(xiě)在最后:
有可能你利用得當(dāng),反手就是一批課題塘秦。也有可能你知道那么多的數(shù)據(jù)庫(kù)暫時(shí)你得不到特殊的回報(bào)讼渊,但是它有可能在將來(lái)的某些時(shí)候幫上大忙,讓你的科研思路豁然開(kāi)朗尊剔,柳暗花明爪幻。引用下關(guān)東野客的一句話(huà)“每個(gè)人的氣質(zhì)中,都藏著讀過(guò)的書(shū),走過(guò)的路挨稿,愛(ài)過(guò)的人”仇轻。
通過(guò)已有的信息,有心的小伙伴肯定能找到航母所在吧奶甘?
https://www.hsls.pitt.edu/obrc/

本文已投稿至小張聊科研微信平臺(tái)篷店,歡迎大家關(guān)注。

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末臭家,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市疲陕,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌钉赁,老刑警劉巖蹄殃,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,013評(píng)論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異橄霉,居然都是意外死亡窃爷,警方通過(guò)查閱死者的電腦和手機(jī),發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,205評(píng)論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門(mén)姓蜂,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來(lái)按厘,“玉大人,你說(shuō)我怎么就攤上這事钱慢〈” “怎么了?”我有些...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 152,370評(píng)論 0 342
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵束莫,是天一觀(guān)的道長(zhǎng)懒棉。 經(jīng)常有香客問(wèn)我,道長(zhǎng)览绿,這世上最難降的妖魔是什么策严? 我笑而不...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 55,168評(píng)論 1 278
  • 正文 為了忘掉前任,我火速辦了婚禮饿敲,結(jié)果婚禮上妻导,老公的妹妹穿的比我還像新娘。我一直安慰自己怀各,他們只是感情好倔韭,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,153評(píng)論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開(kāi)白布。 她就那樣靜靜地躺著瓢对,像睡著了一般寿酌。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上硕蛹,一...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 48,954評(píng)論 1 283
  • 那天醇疼,我揣著相機(jī)與錄音硕并,去河邊找鬼。 笑死僵腺,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛鲤孵,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播辰如,決...
    沈念sama閱讀 38,271評(píng)論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開(kāi)眼,長(zhǎng)吁一口氣:“原來(lái)是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼贵试!你這毒婦竟也來(lái)了琉兜?” 一聲冷哼從身側(cè)響起,我...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 36,916評(píng)論 0 259
  • 序言:老撾萬(wàn)榮一對(duì)情侶失蹤毙玻,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎豌蟋,沒(méi)想到半個(gè)月后,有當(dāng)?shù)厝嗽跇?shù)林里發(fā)現(xiàn)了一具尸體桑滩,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,382評(píng)論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡梧疲,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 35,877評(píng)論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了运准。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片幌氮。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 37,989評(píng)論 1 333
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖胁澳,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出该互,到底是詐尸還是另有隱情,我是刑警寧澤韭畸,帶...
    沈念sama閱讀 33,624評(píng)論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布宇智,位于F島的核電站,受9級(jí)特大地震影響胰丁,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏随橘。R本人自食惡果不足惜,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,209評(píng)論 3 307
  • 文/蒙蒙 一锦庸、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望机蔗。 院中可真熱鬧,春花似錦酸员、人聲如沸蜒车。這莊子的主人今日做“春日...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 30,199評(píng)論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)酿愧。三九已至,卻和暖如春邀泉,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間嬉挡,已是汗流浹背钝鸽。 一陣腳步聲響...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 31,418評(píng)論 1 260
  • 我被黑心中介騙來(lái)泰國(guó)打工, 沒(méi)想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留庞钢,地道東北人拔恰。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,401評(píng)論 2 352
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像基括,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親颜懊。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,700評(píng)論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容