Plant Biotechnology Journal:應(yīng)用DAP-seq技術(shù)助力揭示GhRCD1調(diào)節(jié)GhbHLH12–GhMYB44–GhHMA1轉(zhuǎn)錄級(jí)聯(lián)反應(yīng)促進(jìn)棉花對(duì)鎘的耐受機(jī)制

鎘(Cd2+)是環(huán)境中最常見(jiàn)的有害重金屬之一,嚴(yán)重威脅作物生產(chǎn)力和質(zhì)量以及食品安全窝撵。Cd2+容易被植物從土壤中吸收,并通過(guò)可食用的植物器官和谷物進(jìn)入食物鏈襟铭,對(duì)食品質(zhì)量碌奉、糧食安全和公共安全構(gòu)成威脅。

植物修復(fù)是減少土壤污染的有效途徑之一寒砖。棉花作為一種重要的非食用經(jīng)濟(jì)作物赐劣,與糧食作物(小麥、水稻和玉米)哩都、油料作物(花生和大豆)和蔬菜(豆類(lèi)魁兼、黃瓜和番茄)相比,在修復(fù)土壤Cd2+污染方面具有天然優(yōu)勢(shì)漠嵌,避免了Cd2+進(jìn)入食物鏈的風(fēng)險(xiǎn)璃赡。因此,探究棉花響應(yīng)鎘脅迫的調(diào)控機(jī)制至關(guān)重要献雅。

2024年1月16日碉考,中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所李付廣研究員團(tuán)隊(duì)的研究成果,發(fā)表在Plant Biotechnology Journal期刊上IF=13.8)挺身,文章題目是“GhRCD1 promotes cotton tolerance to

cadmium by regulating the GhbHLH12-GhMYB44-GhHMA1 transcriptional cascade” 侯谁。該研究使用DNA親和純化測(cè)序(DAP-seq)等分子相互作用研究方法,發(fā)現(xiàn)了調(diào)節(jié)棉花Cd2+耐受性的分子級(jí)聯(lián)反應(yīng)章钾,揭示了GhRCD1通過(guò)調(diào)控GhbHLH12-GhMYB44-GhHMA1轉(zhuǎn)錄級(jí)聯(lián)通路響應(yīng)鎘脅迫的分子機(jī)制墙贱,為培育耐鎘棉花新品種和通過(guò)植物修復(fù)手段降低鎘污染提供了新思路。

1.突變ghrcd1 基因降低棉花Cd2+耐受性

為探究Cd2+對(duì)棉花毒性的分子機(jī)制贱傀,作者通過(guò)T-DNA插入得到對(duì)Cd2+敏感的突變體ghrcd1惨撇。Cd2+處理后,通過(guò)表型觀(guān)察府寒,RT-qPCR分析魁衙,PI染色报腔,葉綠體結(jié)構(gòu)觀(guān)察,SPAD分析等實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)剖淀,ghrcd1幼苗比WT植株表現(xiàn)出更低的Cd2+耐受性纯蛾,這表明,抑制GhRCD1表達(dá)會(huì)降低棉花Cd2+耐受性纵隔,GhRCD1在棉花應(yīng)對(duì)鎘脅迫時(shí)具有正向調(diào)節(jié)作用翻诉。

2.敲除棉花GhRCD1基因,降低棉花Cd2+耐受性

為了進(jìn)一步研究GhRCD1在棉花耐鎘脅迫中的作用捌刮,作者構(gòu)建了KO-GhRCD1株系和OE-GhRCD1株系碰煌。Cd2+處理后,通過(guò)表型觀(guān)察绅作,PI染色拄查,葉綠體結(jié)構(gòu)觀(guān)察,SPAD分析等實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)棚蓄,與WT相比堕扶,KO-GhRCD1Cd2+耐受性更低,OE-GhRCD1的Cd2+耐受性更高梭依。這些結(jié)果表明GhRCD1能減弱Cd2+對(duì)棉花的毒性稍算。

3.GhRCD1GhbHLH12在體外和體內(nèi)均存在相互作用

作者使用GhRCD1為誘餌蛋白,對(duì)棉花應(yīng)激響應(yīng)蛋白庫(kù)進(jìn)行Y2H篩選役拴,結(jié)果發(fā)現(xiàn)GhbHLH12轉(zhuǎn)錄因子與GhRCD1存在相互作用糊探。而后通過(guò)BiFC、GST pull down和LCI實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證了這一結(jié)果河闰。這些結(jié)果表明GhRCD1與GhbHLH12在體外和體內(nèi)都能與GhbHLH12相互作用科平。

4.GhbHLH12表達(dá)增強(qiáng)棉花Cd2+耐受性

為探究GhbHLH12是否參與了棉花應(yīng)對(duì)Cd2+脅迫的反應(yīng),作者構(gòu)建了棉花的OE-GhbHLH12株系和GhbHLH1-RNAi株系姜性。Cd2+處理后瞪慧,GhbHLH1-RNAi的Cd2+耐受性增加,OE-GhbHLH12的Cd2+耐受性降低部念。為確定GhbHLH12在調(diào)節(jié)Cd2+耐受性中是否有基因依賴(lài)性弃酌,作者敲除GhbHLH12得到KO-GhbHLH12株系,Cd2+處理后儡炼,KO-GhbHLH12植株比對(duì)照植株具有更高的耐受性妓湘。這些結(jié)果說(shuō)明,抑制GhbHLH12表達(dá)增強(qiáng)了棉花的Cd2+耐受性乌询。

5.GhRCD1減弱GhbHLH12對(duì)GhMYB44的轉(zhuǎn)錄抑制作用榜贴,提高棉花Cd2+耐受性

為探究GhbHLH12抑制棉花Cd2+耐受性的機(jī)制,作者對(duì)WT幼苗進(jìn)行了RNA-seq和DAP-seq聯(lián)合分析妹田。DAP-seq結(jié)果顯示GhbHLH12在GhMYB44的啟動(dòng)子區(qū)域有顯著富集唬党,而后鹃共,Y1H和EMSA實(shí)驗(yàn)證實(shí)了GhbHLH12蛋白和GhMYB44的結(jié)合基序G-box相互作用。LUC/REN報(bào)告實(shí)驗(yàn)表明GhbHLH12抑制GhMYB44的轉(zhuǎn)錄初嘹,而GhRCD1可以減弱GhbHLH12對(duì)GhMYB44的抑制作用,EMSA結(jié)果也表明GhRCD1減弱了GhbHLH12與GhMYB44的結(jié)合沮趣,結(jié)合RT-qPCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果屯烦,說(shuō)明GhRCD1和GhbHLH12分別是Cd2+耐受性的正負(fù)調(diào)節(jié)因子房铭,并且在Cd2+脅迫下,轉(zhuǎn)錄調(diào)控存在復(fù)雜的相互作用缸匪。

6.GhMYB44表達(dá)增強(qiáng)棉花Cd2+耐受性

為探究GhMYB44響應(yīng)Cd2+脅迫的機(jī)制,作者構(gòu)建了GhMYB44-OE1/5株系和GhMYB44-SRDX1/6株系凌蔬。Cd2+處理后,與WT相比砂心,GhMYB44-OE表現(xiàn)出更高的Cd2+耐受性懈词,而SRDX-GhMYB44-1/6植株表現(xiàn)出更低的耐受性辩诞。這表明GhMYB44表達(dá)增強(qiáng)了棉花的Cd2+耐受性。隨后作者采用VIGS技術(shù)沉默對(duì)照和KO-GhbHLH12株系中的GhMYB44基因译暂,結(jié)果表明GhMYB44在GhbHLH12的下游發(fā)揮作用。

7.棉花應(yīng)對(duì)Cd2+脅迫的GhMYB44–GhHMAs轉(zhuǎn)錄級(jí)聯(lián)反應(yīng)

為探究棉花中GhMYB44提高Cd2+耐受性的作用機(jī)制外永,作者利用DAP-seq技術(shù)找到GhMYB44的10207個(gè)潛在結(jié)合位點(diǎn),其中61.42%位于基因間區(qū)伯顶,22.31%位于啟動(dòng)子區(qū)。GO分析顯示砾淌,靶基因顯著富集在脅迫應(yīng)答(GhWRKY13GhWRKY51)和金屬離子結(jié)合和運(yùn)輸(GhHMA1啦撮、GhHMA2GhHMA5)通路。為研究GhMYB44是否通過(guò)GhHMA1GhHMA5在Cd2+轉(zhuǎn)運(yùn)中發(fā)揮調(diào)控作用汪厨,作者通過(guò)Y1H赃春、EMSA實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了GhMYB44特異性結(jié)合GhHMAGhHMA5的G-box(CATGTG)順式作用元件。LUC/REN報(bào)告實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明劫乱,GhMYB44可以直接激活GhHMA1GhHMA5的轉(zhuǎn)錄來(lái)調(diào)控Cd2+的轉(zhuǎn)運(yùn)织中。RT-qPCR分析表明Cd2+誘導(dǎo)GhHMA1GhHMA5的上調(diào)在很大程度上取決于GhMYB44和KO-bHLH12的存在和功能锥涕。

為進(jìn)一步探究GhHMA1和GhHMA5在Cd2+耐受機(jī)制中的生物功能,作者采用VIGS技術(shù)沉默棉花中的GhHMA1GhHMA5基因狭吼,生成沉默品系层坠,Cd2+處理后,沉默品系對(duì)Cd2+表現(xiàn)出更高的敏感性刁笙。結(jié)果表明GhMYB44-GhHMA1/5信號(hào)級(jí)聯(lián)反應(yīng)正向調(diào)控棉花的Cd2+耐受性破花。

8.GhMYB44GhPYL8協(xié)同調(diào)節(jié)ABA介導(dǎo)的Cd2+耐受性

為研究GhMYB44是否與ABA受體相互作用介導(dǎo)Cd2+耐受性,作者進(jìn)行Y2H測(cè)定發(fā)現(xiàn)GhMYB44與ABA受體GhPYL8相互作用疲吸。隨后通過(guò)BiFC和蛋白pull-down實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了這一結(jié)果座每。為研究GhPYL8的生理功能,作者構(gòu)建了OE-GhPYL8-1/3/6株系摘悴,Cd2+處理后峭梳,與WT相比,OE - GhPYL8對(duì)Cd2+的耐受性更高蹂喻。這些結(jié)果表明GhMYB44可以與GhPYL8相互作用來(lái)調(diào)節(jié)ABA介導(dǎo)的Cd2+耐受性葱椭。

小結(jié):

本研究揭示了一個(gè)調(diào)控級(jí)聯(lián)反應(yīng),即GhRCD1GhbHLH12–GhMYB44–GhHMA1口四,闡明了棉花耐Cd2+遺傳調(diào)控的分子機(jī)制挫以,為棉花耐Cd2+優(yōu)良品種的開(kāi)發(fā)奠定了基礎(chǔ),預(yù)示著棉花植物修復(fù)的新時(shí)代窃祝。

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末掐松,一起剝皮案震驚了整個(gè)濱河市,隨后出現(xiàn)的幾起案子粪小,更是在濱河造成了極大的恐慌大磺,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 206,126評(píng)論 6 481
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件探膊,死亡現(xiàn)場(chǎng)離奇詭異杠愧,居然都是意外死亡,警方通過(guò)查閱死者的電腦和手機(jī)逞壁,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 88,254評(píng)論 2 382
  • 文/潘曉璐 我一進(jìn)店門(mén)流济,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來(lái)绳瘟,“玉大人,你說(shuō)我怎么就攤上這事糖声。” “怎么了琉苇?”我有些...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 152,445評(píng)論 0 341
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵并扇,是天一觀(guān)的道長(zhǎng)抡诞。 經(jīng)常有香客問(wèn)我,道長(zhǎng)俩莽,這世上最難降的妖魔是什么乔遮? 我笑而不...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 55,185評(píng)論 1 278
  • 正文 為了忘掉前任取刃,我火速辦了婚禮,結(jié)果婚禮上坯辩,老公的妹妹穿的比我還像新娘崩侠。我一直安慰自己,他們只是感情好改抡,可當(dāng)我...
    茶點(diǎn)故事閱讀 64,178評(píng)論 5 371
  • 文/花漫 我一把揭開(kāi)白布系瓢。 她就那樣靜靜地躺著,像睡著了一般欠拾。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪骗绕。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上,一...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 48,970評(píng)論 1 284
  • 那天枷邪,我揣著相機(jī)與錄音东揣,去河邊找鬼。 笑死尔觉,一個(gè)胖子當(dāng)著我的面吹牛芥吟,可吹牛的內(nèi)容都是我干的。 我是一名探鬼主播钉稍,決...
    沈念sama閱讀 38,276評(píng)論 3 399
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開(kāi)眼棺耍,長(zhǎng)吁一口氣:“原來(lái)是場(chǎng)噩夢(mèng)啊……” “哼!你這毒婦竟也來(lái)了俊卤?” 一聲冷哼從身側(cè)響起害幅,我...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 36,927評(píng)論 0 259
  • 序言:老撾萬(wàn)榮一對(duì)情侶失蹤以现,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎,沒(méi)想到半個(gè)月后佣赖,有當(dāng)?shù)厝嗽跇?shù)林里發(fā)現(xiàn)了一具尸體无宿,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 43,400評(píng)論 1 300
  • 正文 獨(dú)居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長(zhǎng)有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點(diǎn)故事閱讀 35,883評(píng)論 2 323
  • 正文 我和宋清朗相戀三年蹂午,在試婚紗的時(shí)候發(fā)現(xiàn)自己被綠了豆胸。 大學(xué)時(shí)的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片巷疼。...
    茶點(diǎn)故事閱讀 37,997評(píng)論 1 333
  • 序言:一個(gè)原本活蹦亂跳的男人離奇死亡,死狀恐怖估盘,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情擅编,我是刑警寧澤箫踩,帶...
    沈念sama閱讀 33,646評(píng)論 4 322
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站锦担,受9級(jí)特大地震影響慨削,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜痘煤,卻給世界環(huán)境...
    茶點(diǎn)故事閱讀 39,213評(píng)論 3 307
  • 文/蒙蒙 一猿规、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望宙橱。 院中可真熱鬧,春花似錦环葵、人聲如沸宝冕。這莊子的主人今日做“春日...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 30,204評(píng)論 0 19
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽(yáng)宝剖。三九已至,卻和暖如春扑眉,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間,已是汗流浹背腰素。 一陣腳步聲響...
    開(kāi)封第一講書(shū)人閱讀 31,423評(píng)論 1 260
  • 我被黑心中介騙來(lái)泰國(guó)打工弓千, 沒(méi)想到剛下飛機(jī)就差點(diǎn)兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人计呈。 一個(gè)月前我還...
    沈念sama閱讀 45,423評(píng)論 2 352
  • 正文 我出身青樓,卻偏偏與公主長(zhǎng)得像捌显,于是被迫代替她去往敵國(guó)和親。 傳聞我的和親對(duì)象是個(gè)殘疾皇子理肺,可洞房花燭夜當(dāng)晚...
    茶點(diǎn)故事閱讀 42,722評(píng)論 2 345

推薦閱讀更多精彩內(nèi)容