TAIR周期性更新的注釋原來不在FTP服務(wù)器上

更新的數(shù)據(jù)怎么用?看下面兩篇


原文如下

今天師弟和我說TAIR上更新了一波擬南芥的最新注釋信息蓬蝶,還把新聞網(wǎng)址發(fā)給了我尘分,然而我打開一看猜惋,咋啥都沒有呀。

神秘操作前

經(jīng)過一波神秘的操作后培愁,我擁有了看到這一片空白背后真相的能力惨奕,也就是TAIR每隔3個月的日常更新,即TAIR更新了他們的最新注釋數(shù)據(jù)

神秘操作后

根據(jù)提供的網(wǎng)址https://zenodo.org/record/2530282#.XDLgk1wzaUk竭钝,簡單說下他們到底更新了那些數(shù)據(jù):

  • ATH_GO_GOSLIM.txt.zip: TAIR和TIGR提供的擬南芥基因?qū)?yīng)的GO注釋
  • Araport11_functional_descriptions_20171231.txt.gz : 基因的功能描述,更新到20171231
  • Locus_Germplasm_Phenotype_20171231.txt.gz: 基因?qū)?yīng)的標(biāo)新
  • Locus_Published_20171231.txt.gz: 基因?qū)?yīng)的文獻(xiàn)
  • gene_aliases_20171231.txt.gz : 基因的別名
  • po_anatomy_gene_arabidopsis_tair.assoc.gz : 解剖學(xué)相關(guān)的植物本體論
  • po_temporal_gene_arabidopsis_tair.assoc.gz : 時間相關(guān)的植物本體論

此外雹洗,我終于明白為啥我之前找到的注釋那么老舊了香罐。

官方舊版
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