一 研究背景
表觀遺傳時(shí)鐘悲关，或DNA甲基化年齡襟锐，已被證明與年齡高度相關(guān)撤逢。同時(shí)有研究在結(jié)直腸癌中觀察到表觀遺傳年齡加速，即DNA甲基化年齡與個(gè)體年齡差異粮坞。然而蚊荣，表觀遺傳年齡加速與結(jié)直腸癌腫瘤分子特征、臨床特征和患者預(yù)后的關(guān)系尚未得到系統(tǒng)的研究莫杈。此外妇押，結(jié)直腸癌(CRC)在美國(guó)是第三大癌癥死亡原因。結(jié)直腸癌具有高度異質(zhì)性姓迅，其5年生存率隨腫瘤分期的不同而有很大差異敲霍。年齡是預(yù)測(cè)CRC和其他常見復(fù)雜疾病(包括心臟病、中風(fēng)和阿爾茨海默病)風(fēng)險(xiǎn)和預(yù)后的重要因素丁存。
所以今天小編推薦的在這篇文章中作者將目光聚焦在關(guān)于表觀遺傳年齡加速與癌癥結(jié)局之間關(guān)系上肩杈，發(fā)現(xiàn)表觀遺傳年齡加速與CRC腫瘤分子特征相關(guān)，是CRC總生存期解寝、年齡和腫瘤分期的重要預(yù)測(cè)因子扩然，以及結(jié)合結(jié)腸組織的表觀遺傳年齡和腫瘤分子特征可以改善CRC的預(yù)后預(yù)測(cè)。
標(biāo)題：Association of Epigenetic Clock with Consensus Molecular Subtypes and Overall Survival of Colorectal Cancer
雜志：Cancer Epidemiology Biomarkers Prevention???IF：4.142??發(fā)表時(shí)間：2019.10
二 主要方法和數(shù)據(jù)
1. ???數(shù)據(jù)：從TCGA下載結(jié)腸組織DNA甲基化數(shù)據(jù)和389例CRC樣本及38例匹配正常樣本的臨床信息聋伦。這些癌癥的CMS分配是由CRC亞型協(xié)會(huì)進(jìn)行的一項(xiàng)大規(guī)模研究獲得的夫偶。CMS分類系統(tǒng)基于包括TCGA在內(nèi)的18個(gè)基因表達(dá)數(shù)據(jù)集，將每個(gè)CRC分成四種分子亞型:CMS1 (MSI-immune)觉增、CMS2 (Canonical)兵拢、CMS3 (metabolymal)、CMS4 (Mesenchymal)或Unknown逾礁。
2.????DNA甲基化年齡和表觀遺傳年齡加速
作者使用Horvath模型計(jì)算DNA甲基化年齡说铃，簡(jiǎn)單來(lái)說這個(gè)模型使用353 CpG位點(diǎn)的beta值來(lái)計(jì)算DNA甲基化年齡，公式如下：
3.????最后作者使用K-M曲線，log-rank檢驗(yàn)腻扇，cox風(fēng)險(xiǎn)比例回歸模型等方法進(jìn)行預(yù)后分析
三 結(jié)果展示
1.??????DNA甲基化年齡與正常結(jié)腸組織的實(shí)際年齡相關(guān)债热，但與癌癥組織無(wú)關(guān)
作者首先研究了DNA甲基化年齡與實(shí)際年齡的關(guān)系，作者在有匹配正常組織的38個(gè)患者正常組織中發(fā)現(xiàn)實(shí)際年齡與DNA甲基化年齡高度相關(guān)幼苛，而在癌癥組織中這種相關(guān)性卻消失了窒篱。
2.??????表觀遺傳年齡加速與CMS有關(guān)
在345例既有甲基化信息又有CMS信息的CRC患者中，77.4%為白色人種舶沿，46.1%為女性墙杯，53.9%為男性。在單變量分析中暑椰，作者觀察到CMS的顯著相關(guān)性與表觀遺傳年齡加速有關(guān)（表1），作者將表觀年齡多因素分析的結(jié)果展示在表2中荐绝，可以看出表觀遺傳年齡加速與CMS有關(guān)一汽。
3.表觀遺傳年齡加速與cms特異性生存存在著多種關(guān)聯(lián)
作者接下來(lái)評(píng)估了表觀遺傳年齡加速與患者生存的關(guān)系。在表3中可以觀察到在單變量分析中低滩，表觀遺傳年齡加速與死亡率無(wú)顯著相關(guān)性召夹。而年齡和腫瘤等級(jí)則是顯著的。接下啦恕沫，作者進(jìn)行分層分析來(lái)研究年齡监憎，腫瘤等級(jí)與cms分型以及表觀年齡加速與生存的關(guān)系。同時(shí)對(duì)每個(gè)cms亞型分析其與表觀年齡之間的關(guān)系婶溯，并進(jìn)行了多因素矯正分析（表4）鲸阔。
4.??????年齡的減緩或加速與總的CRC生存率相關(guān)
上述分析表明了表觀遺傳年齡加速與整體CRC生存的復(fù)雜關(guān)系，作者考慮到于CRC的分子異質(zhì)性和潛在的非線性進(jìn)一步研究表觀遺傳年齡加速與總體生存的關(guān)系迄委。在后續(xù)的研究中褐筛，作者將患者根據(jù)表觀遺傳年齡加速的不同分為兩組，分別為表觀年齡減緩與表觀年齡加速叙身，然后進(jìn)行了生存分析（圖4）渔扎，進(jìn)一步使用cox風(fēng)險(xiǎn)比例回歸模型進(jìn)行多因素矯正（表5）。
四.結(jié)論
作者對(duì)表觀遺傳年齡加速與癌癥結(jié)局的研究最終發(fā)現(xiàn)表觀遺傳年齡加速與CRC腫瘤分子特征相關(guān)信轿，是CRC總生存期晃痴、年齡和腫瘤分期的重要預(yù)測(cè)因子，同時(shí)結(jié)合結(jié)腸組織的表觀遺傳年齡和腫瘤分子特征也許可以改善CRC的預(yù)后預(yù)測(cè)财忽。
五.參考文獻(xiàn)
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