做兩個(gè)物種的ortholog
找兩個(gè)物種的進(jìn)化關(guān)系岳枷,如果距離遠(yuǎn)的話就把e值放大一些(根據(jù)文獻(xiàn))
BLAST
所謂BLAST既是:basic local alignment search tool 局部序列比對(duì)基本檢索工具。
在NCBI上分為多種捺弦,常用的有N-BLAST(核苷酸序列比對(duì)檢索)和P-BLAST(蛋白比對(duì)檢索)醒第。此外還有primer Blast等。
BLAST的作用顧名思義竟纳,就是用于各種核苷酸序列慨代,蛋白質(zhì)序列等在數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)與已知數(shù)據(jù)的比對(duì)檢索更哄,可以找出相似的序列芋齿,用于蛋白質(zhì)和核酸等的功能結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)分析