生物學(xué)必知三大數(shù)據(jù)庫之一-NCBI
美國國家生物技術(shù)信息中心
摘自：https://wenku.baidu.com/view/f86d817165ce0508763213df.html
它的使命包括四項任務(wù)：
1 建立關(guān)于分子生物學(xué)匿辩，生物化學(xué)唆阿，和遺傳學(xué)知識的存儲和分析的自動系統(tǒng)
2 實行關(guān)于用于分析生物學(xué)重要分子和復(fù)合物的結(jié)構(gòu)和功能的基于計算機的信息處理的叹哭，先進方法的研究
3 加速生物技術(shù)研究者和醫(yī)藥治療人員對數(shù)據(jù)庫和軟件的使用
4 全世界范圍內(nèi)的生物技術(shù)信息收集的合作努力
1 Literature 文獻
books（書庫）
不斷收集生物醫(yī)學(xué)方面的書籍MeSH（醫(yī)學(xué)主題詞表）
是NLM美國國家醫(yī)學(xué)圖書館為PubMed用于索引文章赚导。NLM Catalog
為藏書超過130萬冊的美國國立衛(wèi)生圖書館(NLM)記錄設(shè)立目錄信息，包括雜志笔咽、圖書茬暇、手稿、計算機軟件敢课、錄音文件和其它電子資源阶祭。Pubmed
一個免費的搜尋引擎，提供生物醫(yī)學(xué)方面的論文搜尋以及摘要直秆。Pubmed Central
美國國家醫(yī)學(xué)圖書館目錄PubMed 公共醫(yī)學(xué)中心濒募。
2 Genes（基因）
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ETS
EST數(shù)據(jù)庫收錄了GenBank EST中的所有數(shù)據(jù)和沒有生物學(xué)注釋信息的“單分子識別首次通過(first-pass single-read)”的cDNA序列。EST是從一個隨機選擇的cDNA 克隆進行5’端和3’端單一次測序獲得的短的cDNA 部分序列圾结，代表一個完整基因的一小部分瑰剃，在數(shù)據(jù)庫中其長度一般從20 到7000bp 不等，平均長度為360 ±120bp筝野。EST 來源于一定環(huán)境下一個組織總mRNA 所構(gòu)建的cDNA 文庫培他，因此EST也能說明該組織中各基因的表達水平。
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Gene
數(shù)據(jù)庫為用戶提供基因序列注釋和檢索服務(wù)遗座，還會鏈接到NCBI的Map Viewer、Evidence Viewer俊扳、Model Maker途蒋、BLAST Link (Blink)、protein domains from the Conserved Domain Database(CDD)等數(shù)據(jù)庫資源以及其它與基因相基因Gene 關(guān)的資源馋记。Entrez Gene數(shù)據(jù)庫收錄了來自5300_多個物種的430萬條基因記錄号坡。
GEO DataSets（基因表達文庫數(shù)據(jù)集）
Gene Expression OmnibusDataSetsGEO DataSets 儲存由Gene Expression Omnibus (GEO) repository（資源庫）中得來的基因表達以及分子豐富性的數(shù)據(jù)。GEO profiles（基因表達文庫概況）
數(shù)據(jù)庫(它負責(zé)收錄一個基因在一次試驗中的定量基因表達數(shù)據(jù))HomoloGene
是一個在20種完全測序的真核生物基因組中自動檢索同源基因的系統(tǒng)梯醒，包括直系同源與旁系同源宽堆。HomoloGene的結(jié)果報告包括基因同源性和來自O(shè)MIM、小鼠基因組信息學(xué)(Mouse Genome Informatics, MGI)茸习、斑馬魚信息網(wǎng)絡(luò)(Zebrafish Information Network, ZFIN)畜隶、酵母基因組數(shù)據(jù)庫(Saccharomyces Genome Database, SGD)、直系同源基因簇(Clusters of Orthologous Groups号胚，COG)和果蠅數(shù)據(jù)庫(FlyBase)的基因表型信息籽慢。HomoloGene下載功能能下載HomoloGene中的轉(zhuǎn)錄體、蛋白質(zhì)和基因組序_列信息猫胁，還能下載基因組中特定基因的上游和下游序列箱亿。PopSet
既包含核酸序列數(shù)據(jù)又包含蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)。unigene
意為廣泛通用的基因數(shù)據(jù)庫弃秆，通過電腦對相同基因座（Locus）的收集整理集合形成一個非冗余的基因數(shù)據(jù)庫届惋。
3 Health
ClinVar
整合這些分散的數(shù)據(jù)髓帽、將變異、臨床表型脑豹、實證數(shù)據(jù)以及功能注解與分析等四個方面的信息郑藏，通過專家評審，逐步形成一個標(biāo)準(zhǔn)的晨缴、可信的译秦、穩(wěn)定的遺傳變異臨床表型相關(guān)的數(shù)據(jù)庫dbGaP（基因型和表型數(shù)據(jù)庫）
歸檔、精選击碗、發(fā)布由調(diào)查基因型和表型間相互作用的研究所產(chǎn)生的信息的數(shù)據(jù)分庫GTR（基因檢測注冊表）
MedGen
組織與人類醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)相關(guān)的信息OMIM（孟德爾人類遺傳仓病）
持續(xù)更新關(guān)于人類基因和遺傳紊亂的數(shù)據(jù)庫
