介紹
anaconda相當(dāng)于linux的一個(gè)軟件倉(cāng)庫(kù)咕宿,也相當(dāng)于一個(gè)環(huán)境管理器,可以使用conda創(chuàng)建不同環(huán)境蜡秽,安裝環(huán)境包府阀,而不影響其他環(huán)境。
下載和安裝
在官網(wǎng)下載anaconda3的安裝腳本:
https://www.anaconda.com/products/individual
安裝也非常簡(jiǎn)單芽突,直接:
bash?Anaconda3-2021.05-Linux-x86_64.sh
然后一路yes即可试浙,我沒(méi)有選擇安裝VSCode,因?yàn)楦杏X(jué)做生信分析沒(méi)有必要安裝
conda環(huán)境管理
conda create -n R4 ? ? ? ? ? ?#?創(chuàng)建名為R4的新環(huán)境
conda?create?-n?py2?python=2.7????????????#?創(chuàng)建python2.7的新環(huán)境
conda env list ? ? ? ? ? ?# 查看環(huán)境列表
source activate R4 ? ? ? ? ? ?#?進(jìn)入R4環(huán)境
conda 設(shè)置清華源:
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
# 設(shè)置搜索時(shí)顯示通道地址
conda config --set show_channel_urls yes
conda clean -i
# 刪除鏡像源
conda config --remove channels https://XXXXXXXXXXXX?
# 查看鏡像源
conda config --show-sources?
conda包管理
conda search r-base ? ? ? ? ? ?#?查找包
conda install r-base=4.0.3 ? ? ? ? ? ?#?安裝R語(yǔ)言版本4.0.3
conda刪除環(huán)境
conda env remove --name 環(huán)境名