ssGBLUP經(jīng)過10多年的發(fā)展杯矩,已經(jīng)普遍開始應(yīng)用在動物育種中。
以前的多步法
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基因組評估
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問題:
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表型的測量
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BLUP會低估基因組選擇趨勢
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一步法(ssGBLUP)
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展開的內(nèi)容
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基因型的點估計問題
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假設(shè)基因型被視為特征
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使用 BLUP預(yù)測個體的基因組(Gengler's method)
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例如:
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增強(qiáng)基因型
Gengler 等人。 (2007) 構(gòu)思了一種代數(shù)方法來處理這些點估計宪拥。
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缺失數(shù)據(jù)在經(jīng)典處理
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fancy- 填充
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一步法是 將沒有基因型動物作為缺失值處理
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推斷基因型
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另一種不推斷基因型茉贡,因為我們需要的是個體育種值
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所有動物的協(xié)方差
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兩個創(chuàng)建ssGBLUP的想法
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第一種:
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聯(lián)合分布
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轉(zhuǎn)為所有個體的協(xié)方差
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H的逆很容易求出:
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理解H矩陣
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H矩陣的例子
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更復(fù)雜的例子
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H矩陣的一些特點
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ssGBLUP的混合方程組
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目前ssGBLUP的拓展模型
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