【r<-芯片處理】入門GEO表達芯片數(shù)據(jù)分析該讀一讀的一些文章

剛參加完生信技能樹TCGA挖掘培訓(xùn)回來吩跋，里面內(nèi)容有不少涉及GEO數(shù)據(jù)分析方面寞射。下面整理一些非常值得一讀都一些文章，幫助初學(xué)者掌握一些基本概念锌钮，基本流程桥温。一旦你理解并學(xué)會使用R了，那么進行自定義地分析就不難了梁丘。

Bioconductor分析基因芯片數(shù)據(jù)
如何使用GEOquery和limma完成芯片數(shù)據(jù)的差異表達分析

基因芯片（Affymetrix）分析1：芯片質(zhì)量分析
基因芯片（Affymetrix）分析2：芯片數(shù)據(jù)預(yù)處理
基因芯片（Affymetrix）分析3：獲取差異表達基因
基因芯片（Affymetrix）分析4：GO和KEGG分析
基因芯片（Affymetrix）分析5：聚類分析
使用oligo軟件包處理芯片數(shù)據(jù)

最后給一個模擬差異分析的示例 https://github.com/ShixiangWang/MessageBoard/issues/13

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