《利用Python進行數(shù)據(jù)分析·第2版》第4章 NumPy基礎:數(shù)組和矢量計算

本文是跟隨學習舶沛,原文鏈接在《利用Python進行數(shù)據(jù)分析·第2版》第1章 準備工作
為避免原鏈接失效嘱蛋,特轉載一份保存拥褂。中間可能會根據(jù)學習情況略有改動撑蒜。
第1章 準備工作
第2章 Python語法基礎一睁,IPython和Jupyter
第3章 Python的數(shù)據(jù)結構又活、函數(shù)和文件
第4章 NumPy基礎:數(shù)組和矢量計算
第5章 pandas入門
第6章 數(shù)據(jù)加載兽泄、存儲與文件格式
第7章 數(shù)據(jù)清洗和準備
第8章 數(shù)據(jù)規(guī)整:聚合矮台、合并和重塑
第9章 繪圖和可視化
第10章 數(shù)據(jù)聚合與分組運算
第11章 時間序列
第12章 pandas高級應用
第13章 Python建模庫介紹
第14章 數(shù)據(jù)分析案例
附錄A NumPy高級應用
附錄B 更多關于IPython的內(nèi)容(完)

NumPy(Numerical Python的簡稱)是Python數(shù)值計算最重要的基礎包乏屯。大多數(shù)提供科學計算的包都是用NumPy的數(shù)組作為構建基礎根时。

NumPy的部分功能如下:

  • ndarray,一個具有矢量算術運算和復雜廣播能力的快速且節(jié)省空間的多維數(shù)組辰晕。
  • 用于對整組數(shù)據(jù)進行快速運算的標準數(shù)學函數(shù)(無需編寫循環(huán))蛤迎。
  • 用于讀寫磁盤數(shù)據(jù)的工具以及用于操作內(nèi)存映射文件的工具。
  • 線性代數(shù)含友、隨機數(shù)生成以及傅里葉變換功能替裆。
  • 用于集成由C、C++窘问、Fortran等語言編寫的代碼的A C API辆童。

由于NumPy提供了一個簡單易用的C API,因此很容易將數(shù)據(jù)傳遞給由低級語言編寫的外部庫惠赫,外部庫也能以NumPy數(shù)組的形式將數(shù)據(jù)返回給Python把鉴。這個功能使Python成為一種包裝C/C++/Fortran歷史代碼庫的選擇,并使被包裝庫擁有一個動態(tài)的儿咱、易用的接口庭砍。

NumPy本身并沒有提供多么高級的數(shù)據(jù)分析功能,理解NumPy數(shù)組以及面向數(shù)組的計算將有助于你更加高效地使用諸如pandas之類的工具混埠。因為NumPy是一個很大的題目怠缸,我會在附錄A中介紹更多NumPy高級功能,比如廣播岔冀。

對于大部分數(shù)據(jù)分析應用而言凯旭,我最關注的功能主要集中在:

  • 用于數(shù)據(jù)整理和清理、子集構造和過濾使套、轉換等快速的矢量化數(shù)組運算罐呼。
  • 常用的數(shù)組算法,如排序侦高、唯一化嫉柴、集合運算等。
  • 高效的描述統(tǒng)計和數(shù)據(jù)聚合/摘要運算奉呛。
  • 用于異構數(shù)據(jù)集的合并/連接運算的數(shù)據(jù)對齊和關系型數(shù)據(jù)運算计螺。
  • 將條件邏輯表述為數(shù)組表達式(而不是帶有if-elif-else分支的循環(huán))。
  • 數(shù)據(jù)的分組運算(聚合瞧壮、轉換登馒、函數(shù)應用等)。咆槽。

雖然NumPy提供了通用的數(shù)值數(shù)據(jù)處理的計算基礎陈轿,但大多數(shù)讀者可能還是想將pandas作為統(tǒng)計和分析工作的基礎,尤其是處理表格數(shù)據(jù)時。pandas還提供了一些NumPy所沒有的領域特定的功能麦射,如時間序列處理等蛾娶。

筆記:Python的面向數(shù)組計算可以追溯到1995年,Jim Hugunin創(chuàng)建了Numeric庫潜秋。接下來的10年蛔琅,許多科學編程社區(qū)紛紛開始使用Python的數(shù)組編程,但是進入21世紀峻呛,庫的生態(tài)系統(tǒng)變得碎片化了罗售。2005年,Travis Oliphant從Numeric和Numarray項目整了出了NumPy項目钩述,進而所有社區(qū)都集合到了這個框架下莽囤。

NumPy之于數(shù)值計算特別重要的原因之一,是因為它可以高效處理大數(shù)組的數(shù)據(jù)切距。這是因為:

  • NumPy是在一個連續(xù)的內(nèi)存塊中存儲數(shù)據(jù),獨立于其他Python內(nèi)置對象惨远。NumPy的C語言編寫的算法庫可以操作內(nèi)存谜悟,而不必進行類型檢查或其它前期工作。比起Python的內(nèi)置序列北秽,NumPy數(shù)組使用的內(nèi)存更少葡幸。
  • NumPy可以在整個數(shù)組上執(zhí)行復雜的計算贺氓,而不需要Python的for循環(huán)蔚叨。

要搞明白具體的性能差距,考察一個包含一百萬整數(shù)的數(shù)組辙培,和一個等價的Python列表:

In [7]: import numpy as np

In [8]: my_arr = np.arange(1000000)

In [9]: my_list = list(range(1000000))

各個序列分別乘以2:

In [10]: %time for _ in range(10): my_arr2 = my_arr * 2
CPU times: user 20 ms, sys: 50 ms, total: 70 ms
Wall time: 72.4 ms

In [11]: %time for _ in range(10): my_list2 = [x * 2 for x in my_list]
CPU times: user 760 ms, sys: 290 ms, total: 1.05 s
Wall time: 1.05 s

基于NumPy的算法要比純Python快10到100倍(甚至更快)蔑水,并且使用的內(nèi)存更少。

4.1 NumPy的ndarray:一種多維數(shù)組對象

NumPy最重要的一個特點就是其N維數(shù)組對象(即ndarray)扬蕊,該對象是一個快速而靈活的大數(shù)據(jù)集容器搀别。你可以利用這種數(shù)組對整塊數(shù)據(jù)執(zhí)行一些數(shù)學運算,其語法跟標量元素之間的運算一樣尾抑。

要明白Python是如何利用與標量值類似的語法進行批次計算歇父,我先引入NumPy,然后生成一個包含隨機數(shù)據(jù)的小數(shù)組:

In [12]: import numpy as np

# Generate some random data
In [13]: data = np.random.randn(2, 3)

In [14]: data
Out[14]: 
array([[-0.2047,  0.4789, -0.5194],
       [-0.5557,  1.9658,  1.3934]])

然后進行數(shù)學運算:

In [15]: data * 10
Out[15]: 
array([[ -2.0471,   4.7894,  -5.1944],
       [ -5.5573,  19.6578,  13.9341]])

In [16]: data + data
Out[16]: 
array([[-0.4094,  0.9579, -1.0389],
       [-1.1115,  3.9316,  2.7868]])

第一個例子中再愈,所有的元素都乘以10榜苫。第二個例子中,每個元素都與自身相加翎冲。

筆記:在本章及全書中垂睬,我會使用標準的NumPy慣用法import numpy as np。你當然也可以在代碼中使用from numpy import *,但不建議這么做羔飞。numpy的命名空間很大肺樟,包含許多函數(shù),其中一些的名字與Python的內(nèi)置函數(shù)重名(比如min和max)逻淌。

ndarray是一個通用的同構數(shù)據(jù)多維容器么伯,也就是說,其中的所有元素必須是相同類型的卡儒。每個數(shù)組都有一個shape(一個表示各維度大小的元組)和一個dtype(一個用于說明數(shù)組數(shù)據(jù)類型的對象):

In [17]: data.shape
Out[17]: (2, 3)

In [18]: data.dtype
Out[18]: dtype('float64')

本章將會介紹NumPy數(shù)組的基本用法田柔,這對于本書后面各章的理解基本夠用。雖然大多數(shù)數(shù)據(jù)分析工作不需要深入理解NumPy骨望,但是精通面向數(shù)組的編程和思維方式是成為Python科學計算牛人的一大關鍵步驟硬爆。

筆記:當你在本書中看到“數(shù)組”、“NumPy數(shù)組”擎鸠、"ndarray"時缀磕,基本上都指的是同一樣東西,即ndarray對象劣光。

創(chuàng)建ndarray

創(chuàng)建數(shù)組最簡單的辦法就是使用array函數(shù)袜蚕。它接受一切序列型的對象(包括其他數(shù)組),然后產(chǎn)生一個新的含有傳入數(shù)據(jù)的NumPy數(shù)組绢涡。以一個列表的轉換為例:

In [19]: data1 = [6, 7.5, 8, 0, 1]

In [20]: arr1 = np.array(data1)

In [21]: arr1
Out[21]: array([ 6. ,  7.5,  8. ,  0. ,  1. ])

嵌套序列(比如由一組等長列表組成的列表)將會被轉換為一個多維數(shù)組:

In [22]: data2 = [[1, 2, 3, 4], [5, 6, 7, 8]]

In [23]: arr2 = np.array(data2)

In [24]: arr2
Out[24]: 
array([[1, 2, 3, 4],
       [5, 6, 7, 8]])

因為data2是列表的列表牲剃,NumPy數(shù)組arr2的兩個維度的shape是從data2引入的⌒劭桑可以用屬性ndim和shape驗證:

In [25]: arr2.ndim
Out[25]: 2

In [26]: arr2.shape
Out[26]: (2, 4)

除非特別說明(稍后將會詳細介紹)凿傅,np.array會嘗試為新建的這個數(shù)組推斷出一個較為合適的數(shù)據(jù)類型。數(shù)據(jù)類型保存在一個特殊的dtype對象中数苫。比如說聪舒,在上面的兩個例子中,我們有:

In [27]: arr1.dtype
Out[27]: dtype('float64')

In [28]: arr2.dtype
Out[28]: dtype('int64')

除np.array之外文判,還有一些函數(shù)也可以新建數(shù)組过椎。比如,zeros和ones分別可以創(chuàng)建指定長度或形狀的全0或全1數(shù)組戏仓。empty可以創(chuàng)建一個沒有任何具體值的數(shù)組疚宇。要用這些方法創(chuàng)建多維數(shù)組,只需傳入一個表示形狀的元組即可:

In [29]: np.zeros(10)
Out[29]: array([ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.])

In [30]: np.zeros((3, 6))
Out[30]: 
array([[ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.,  0.,  0.]])

In [31]: np.empty((2, 3, 2))
Out[31]: 
array([[[ 0.,  0.],
        [ 0.,  0.],
        [ 0.,  0.]],
       [[ 0.,  0.],
        [ 0.,  0.],
        [ 0.,  0.]]])

注意:認為np.empty會返回全0數(shù)組的想法是不安全的赏殃。很多情況下(如前所示)敷待,它返回的都是一些未初始化的垃圾值。

arange是Python內(nèi)置函數(shù)range的數(shù)組版:

In [32]: np.arange(15)
Out[32]: array([ 0,  1,  2,  3,  4,  5,  6,  7,  8,  9, 10, 11, 12, 13, 14])

表4-1列出了一些數(shù)組創(chuàng)建函數(shù)仁热。由于NumPy關注的是數(shù)值計算榜揖,因此勾哩,如果沒有特別指定,數(shù)據(jù)類型基本都是float64(浮點數(shù))举哟。

image

ndarray的數(shù)據(jù)類型

dtype(數(shù)據(jù)類型)是一個特殊的對象思劳,它含有ndarray將一塊內(nèi)存解釋為特定數(shù)據(jù)類型所需的信息:

In [33]: arr1 = np.array([1, 2, 3], dtype=np.float64)

In [34]: arr2 = np.array([1, 2, 3], dtype=np.int32)

In [35]: arr1.dtype
Out[35]: dtype('float64')

In [36]: arr2.dtype
Out[36]: dtype('int32')

dtype是NumPy靈活交互其它系統(tǒng)的源泉之一。多數(shù)情況下妨猩,它們直接映射到相應的機器表示潜叛,這使得“讀寫磁盤上的二進制數(shù)據(jù)流”以及“集成低級語言代碼(如C、Fortran)”等工作變得更加簡單壶硅。數(shù)值型dtype的命名方式相同:一個類型名(如float或int)威兜,后面跟一個用于表示各元素位長的數(shù)字。標準的雙精度浮點值(即Python中的float對象)需要占用8字節(jié)(即64位)庐椒。因此椒舵,該類型在NumPy中就記作float64。表4-2列出了NumPy所支持的全部數(shù)據(jù)類型约谈。

筆記:記不住這些NumPy的dtype也沒關系笔宿,新手更是如此。通常只需要知道你所處理的數(shù)據(jù)的大致類型是浮點數(shù)棱诱、復數(shù)措伐、整數(shù)、布爾值军俊、字符串,還是普通的Python對象即可捧存。當你需要控制數(shù)據(jù)在內(nèi)存和磁盤中的存儲方式時(尤其是對大數(shù)據(jù)集)粪躬,那就得了解如何控制存儲類型。

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你可以通過ndarray的astype方法明確地將一個數(shù)組從一個dtype轉換成另一個dtype:

In [37]: arr = np.array([1, 2, 3, 4, 5])

In [38]: arr.dtype
Out[38]: dtype('int64')

In [39]: float_arr = arr.astype(np.float64)

In [40]: float_arr.dtype
Out[40]: dtype('float64')

在本例中昔穴,整數(shù)被轉換成了浮點數(shù)镰官。如果將浮點數(shù)轉換成整數(shù),則小數(shù)部分將會被截取刪除:

In [41]: arr = np.array([3.7, -1.2, -2.6, 0.5, 12.9, 10.1])

In [42]: arr
Out[42]: array([  3.7,  -1.2,  -2.6,   0.5,  12.9,  10.1])

In [43]: arr.astype(np.int32)
Out[43]: array([ 3, -1, -2,  0, 12, 10], dtype=int32)

如果某字符串數(shù)組表示的全是數(shù)字吗货,也可以用astype將其轉換為數(shù)值形式:

In [44]: numeric_strings = np.array(['1.25', '-9.6', '42'], dtype=np.string_)

In [45]: numeric_strings.astype(float)
Out[45]: array([  1.25,  -9.6 ,  42.  ])

注意:使用numpy.string_類型時泳唠,一定要小心,因為NumPy的字符串數(shù)據(jù)是大小固定的宙搬,發(fā)生截取時笨腥,不會發(fā)出警告。pandas提供了更多非數(shù)值數(shù)據(jù)的便利的處理方法勇垛。

如果轉換過程因為某種原因而失敗了(比如某個不能被轉換為float64的字符串)脖母,就會引發(fā)一個ValueError。這里闲孤,我比較懶谆级,寫的是float而不是np.float64;NumPy很聰明,它會將Python類型映射到等價的dtype上肥照。

數(shù)組的dtype還有另一個屬性:

In [46]: int_array = np.arange(10)

In [47]: calibers = np.array([.22, .270, .357, .380, .44, .50], dtype=np.float64)

In [48]: int_array.astype(calibers.dtype)
Out[48]: array([ 0.,  1.,  2.,  3.,  4.,  5.,  6.,  7.,  8.,  9.])

你還可以用簡潔的類型代碼來表示dtype:

In [49]: empty_uint32 = np.empty(8, dtype='u4')

In [50]: empty_uint32
Out[50]: 
array([         0, 1075314688,          0, 1075707904,          0,
       1075838976,          0, 1072693248], dtype=uint32)

筆記:調(diào)用astype總會創(chuàng)建一個新的數(shù)組(一個數(shù)據(jù)的備份)脚仔,即使新的dtype與舊的dtype相同。

NumPy數(shù)組的運算

數(shù)組很重要舆绎,因為它使你不用編寫循環(huán)即可對數(shù)據(jù)執(zhí)行批量運算鲤脏。NumPy用戶稱其為矢量化(vectorization)。大小相等的數(shù)組之間的任何算術運算都會將運算應用到元素級:

In [51]: arr = np.array([[1., 2., 3.], [4., 5., 6.]])

In [52]: arr
Out[52]: 
array([[ 1.,  2.,  3.],
       [ 4.,  5.,  6.]])

In [53]: arr * arr
Out[53]: 
array([[  1.,   4.,   9.],
       [ 16.,  25.,  36.]])

In [54]: arr - arr
Out[54]: 
array([[ 0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  0.]])

數(shù)組與標量的算術運算會將標量值傳播到各個元素:

In [55]: 1 / arr
Out[55]: 
array([[ 1.    ,  0.5   ,  0.3333],
       [ 0.25  ,  0.2   ,  0.1667]])

In [56]: arr ** 0.5
Out[56]: 
array([[ 1.    ,  1.4142,  1.7321],
       [ 2.    ,  2.2361,  2.4495]])

大小相同的數(shù)組之間的比較會生成布爾值數(shù)組:

In [57]: arr2 = np.array([[0., 4., 1.], [7., 2., 12.]])

In [58]: arr2
Out[58]: 
array([[  0.,   4.,   1.],
       [  7.,   2.,  12.]])

In [59]: arr2 > arr
Out[59]:
array([[False,  True, False],
       [ True, False,  True]], dtype=bool)

不同大小的數(shù)組之間的運算叫做廣播(broadcasting)亿蒸,將在附錄A中對其進行詳細討論凑兰。本書的內(nèi)容不需要對廣播機制有多深的理解。

基本的索引和切片

NumPy數(shù)組的索引是一個內(nèi)容豐富的主題边锁,因為選取數(shù)據(jù)子集或單個元素的方式有很多姑食。一維數(shù)組很簡單。從表面上看茅坛,它們跟Python列表的功能差不多:

In [60]: arr = np.arange(10)

In [61]: arr
Out[61]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])

In [62]: arr[5]
Out[62]: 5

In [63]: arr[5:8]
Out[63]: array([5, 6, 7])

In [64]: arr[5:8] = 12

In [65]: arr
Out[65]: array([ 0,  1,  2,  3,  4, 12, 12, 12,  8,  9])

如上所示音半,當你將一個標量值賦值給一個切片時(如arr[5:8]=12)挪钓,該值會自動傳播(也就說后面將會講到的“廣播”)到整個選區(qū)夯巷。跟列表最重要的區(qū)別在于,數(shù)組切片是原始數(shù)組的視圖累奈。這意味著數(shù)據(jù)不會被復制斥铺,視圖上的任何修改都會直接反映到源數(shù)組上彻桃。

作為例子,先創(chuàng)建一個arr的切片:

In [66]: arr_slice = arr[5:8]

In [67]: arr_slice
Out[67]: array([12, 12, 12])

現(xiàn)在晾蜘,當我修改arr_slice中的值邻眷,變動也會體現(xiàn)在原始數(shù)組arr中:

In [68]: arr_slice[1] = 12345

In [69]: arr
Out[69]: array([    0,     1,     2,     3,     4,    12, 12345,    12,     8,   
  9])

切片[ : ]會給數(shù)組中的所有值賦值:

In [70]: arr_slice[:] = 64

In [71]: arr
Out[71]: array([ 0,  1,  2,  3,  4, 64, 64, 64,  8,  9])

如果你剛開始接觸NumPy,可能會對此感到驚訝(尤其是當你曾經(jīng)用過其他熱衷于復制數(shù)組數(shù)據(jù)的編程語言)剔交。由于NumPy的設計目的是處理大數(shù)據(jù)肆饶,所以你可以想象一下,假如NumPy堅持要將數(shù)據(jù)復制來復制去的話會產(chǎn)生何等的性能和內(nèi)存問題岖常。

注意:如果你想要得到的是ndarray切片的一份副本而非視圖驯镊,就需要明確地進行復制操作,例如arr[5:8].copy()竭鞍。

對于高維度數(shù)組板惑,能做的事情更多。在一個二維數(shù)組中偎快,各索引位置上的元素不再是標量而是一維數(shù)組:

In [72]: arr2d = np.array([[1, 2, 3], [4, 5, 6], [7, 8, 9]])

In [73]: arr2d[2]
Out[73]: array([7, 8, 9])

因此洒放,可以對各個元素進行遞歸訪問,但這樣需要做的事情有點多滨砍。你可以傳入一個以逗號隔開的索引列表來選取單個元素往湿。也就是說妖异,下面兩種方式是等價的:

In [74]: arr2d[0][2]
Out[74]: 3

In [75]: arr2d[0, 2]
Out[75]: 3

圖4-1說明了二維數(shù)組的索引方式。軸0作為行领追,軸1作為列他膳。

image

在多維數(shù)組中,如果省略了后面的索引绒窑,則返回對象會是一個維度低一點的ndarray(它含有高一級維度上的所有數(shù)據(jù))棕孙。因此,在2×2×3數(shù)組arr3d中:

In [76]: arr3d = np.array([[[1, 2, 3], [4, 5, 6]], [[7, 8, 9], [10, 11, 12]]])

In [77]: arr3d
Out[77]: 
array([[[ 1,  2,  3],
        [ 4,  5,  6]],
       [[ 7,  8,  9],
        [10, 11, 12]]])

arr3d[0]是一個2×3數(shù)組:

In [78]: arr3d[0]
Out[78]: 
array([[1, 2, 3],
       [4, 5, 6]])

標量值和數(shù)組都可以被賦值給arr3d[0]:

In [79]: old_values = arr3d[0].copy()

In [80]: arr3d[0] = 42

In [81]: arr3d
Out[81]: 
array([[[42, 42, 42],
        [42, 42, 42]],
       [[ 7,  8,  9],
        [10, 11, 12]]])

In [82]: arr3d[0] = old_values

In [83]: arr3d
Out[83]: 
array([[[ 1,  2,  3],
        [ 4,  5,  6]],
       [[ 7,  8,  9],
        [10, 11, 12]]])

相似的些膨,arr3d[1,0]可以訪問索引以(1,0)開頭的那些值(以一維數(shù)組的形式返回):

In [84]: arr3d[1, 0]
Out[84]: array([7, 8, 9])

雖然是用兩步進行索引的蟀俊,表達式是相同的:

In [85]: x = arr3d[1]

In [86]: x
Out[86]: 
array([[ 7,  8,  9],
       [10, 11, 12]])

In [87]: x[0]
Out[87]: array([7, 8, 9])

注意,在上面所有這些選取數(shù)組子集的例子中订雾,返回的數(shù)組都是視圖肢预。

切片索引

ndarray的切片語法跟Python列表這樣的一維對象差不多:

In [88]: arr
Out[88]: array([ 0,  1,  2,  3,  4, 64, 64, 64,  8,  9])

In [89]: arr[1:6]
Out[89]: array([ 1,  2,  3,  4, 64])

對于之前的二維數(shù)組arr2d,其切片方式稍顯不同:

In [90]: arr2d
Out[90]: 
array([[1, 2, 3],
       [4, 5, 6],
       [7, 8, 9]])

In [91]: arr2d[:2]
Out[91]: 
array([[1, 2, 3],
       [4, 5, 6]])

可以看出洼哎,它是沿著第0軸(即第一個軸)切片的烫映。也就是說,切片是沿著一個軸向選取元素的噩峦。表達式arr2d[:2]可以被認為是“選取arr2d的前兩行”锭沟。

你可以一次傳入多個切片,就像傳入多個索引那樣:

In [92]: arr2d[:2, 1:]
Out[92]: 
array([[2, 3],
       [5, 6]])

像這樣進行切片時识补,只能得到相同維數(shù)的數(shù)組視圖族淮。通過將整數(shù)索引和切片混合,可以得到低維度的切片凭涂。

例如瞧筛,我可以選取第二行的前兩列:

In [93]: arr2d[1, :2]
Out[93]: array([4, 5])

相似的,還可以選擇第三列的前兩行:

In [94]: arr2d[:2, 2]
Out[94]: array([3, 6])

圖4-2對此進行了說明导盅。注意,“只有冒號”表示選取整個軸揍瑟,因此你可以像下面這樣只對高維軸進行切片:

In [95]: arr2d[:, :1]
Out[95]: 
array([[1],
       [4],
       [7]])

image

自然白翻,對切片表達式的賦值操作也會被擴散到整個選區(qū):

In [96]: arr2d[:2, 1:] = 0

In [97]: arr2d
Out[97]: 
array([[1, 0, 0],
       [4, 0, 0],
       [7, 8, 9]])

布爾型索引

<meta charset="utf-8">

來看這樣一個例子,假設我們有一個用于存儲數(shù)據(jù)的數(shù)組以及一個存儲姓名的數(shù)組(含有重復項)绢片。在這里滤馍,我將使用numpy.random中的randn函數(shù)生成一些正態(tài)分布的隨機數(shù)據(jù):

In [98]: names = np.array(['Bob', 'Joe', 'Will', 'Bob', 'Will', 'Joe', 'Joe'])

In [99]: data = np.random.randn(7, 4)

In [100]: names
Out[100]: 
array(['Bob', 'Joe', 'Will', 'Bob', 'Will', 'Joe', 'Joe'],
      dtype='<U4')

In [101]: data
Out[101]: 
array([[ 0.0929,  0.2817,  0.769 ,  1.2464],
       [ 1.0072, -1.2962,  0.275 ,  0.2289],
       [ 1.3529,  0.8864, -2.0016, -0.3718],
       [ 1.669 , -0.4386, -0.5397,  0.477 ],
       [ 3.2489, -1.0212, -0.5771,  0.1241],
       [ 0.3026,  0.5238,  0.0009,  1.3438],
       [-0.7135, -0.8312, -2.3702, -1.8608]])

假設每個名字都對應data數(shù)組中的一行,而我們想要選出對應于名字"Bob"的所有行。跟算術運算一樣非驮,數(shù)組的比較運算(如==)也是矢量化的。因此曹仗,對names和字符串"Bob"的比較運算將會產(chǎn)生一個布爾型數(shù)組:

In [102]: names == 'Bob'
Out[102]: array([ True, False, False,  True, False, False, False], dtype=bool)

這個布爾型數(shù)組可用于數(shù)組索引:

In [103]: data[names == 'Bob']
Out[103]: 
array([[ 0.0929,  0.2817,  0.769 ,  1.2464],
       [ 1.669 , -0.4386, -0.5397,  0.477 ]])

布爾型數(shù)組的長度必須跟被索引的軸長度一致蜜宪。此外,還可以將布爾型數(shù)組跟切片祥山、整數(shù)(或整數(shù)序列圃验,稍后將對此進行詳細講解)混合使用:

In [103]: data[names == 'Bob']
Out[103]: 
array([[ 0.0929,  0.2817,  0.769 ,  1.2464],
       [ 1.669 , -0.4386, -0.5397,  0.477 ]])

注意:如果布爾型數(shù)組的長度不對,布爾型選擇就會出錯缝呕,因此一定要小心澳窑。

下面的例子斧散,我選取了names == 'Bob'的行,并索引了列:

In [104]: data[names == 'Bob', 2:]
Out[104]: 
array([[ 0.769 ,  1.2464],
       [-0.5397,  0.477 ]])

In [105]: data[names == 'Bob', 3]
Out[105]: array([ 1.2464,  0.477 ])

要選擇除"Bob"以外的其他值照捡,既可以使用不等于符號(!=)颅湘,也可以通過~對條件進行否定:

In [106]: names != 'Bob'
Out[106]: array([False,  True,  True, False,  True,  True,  True], dtype=bool)

In [107]: data[~(names == 'Bob')]
Out[107]:
array([[ 1.0072, -1.2962,  0.275 ,  0.2289],
       [ 1.3529,  0.8864, -2.0016, -0.3718],
       [ 3.2489, -1.0212, -0.5771,  0.1241],
       [ 0.3026,  0.5238,  0.0009,  1.3438],
       [-0.7135, -0.8312, -2.3702, -1.8608]])

~操作符用來反轉條件很好用:

In [108]: cond = names == 'Bob'

In [109]: data[~cond]
Out[109]: 
array([[ 1.0072, -1.2962,  0.275 ,  0.2289],
       [ 1.3529,  0.8864, -2.0016, -0.3718],
       [ 3.2489, -1.0212, -0.5771,  0.1241],
       [ 0.3026,  0.5238,  0.0009,  1.3438],
       [-0.7135, -0.8312, -2.3702, -1.8608]])

選取這三個名字中的兩個需要組合應用多個布爾條件,使用&(和)栗精、|(或)之類的布爾算術運算符即可:

In [110]: mask = (names == 'Bob') | (names == 'Will')

In [111]: mask
Out[111]: array([ True, False,  True,  True,  True, False, False], dtype=bool)

In [112]: data[mask]
Out[112]: 
array([[ 0.0929,  0.2817,  0.769 ,  1.2464],
       [ 1.3529,  0.8864, -2.0016, -0.3718],
       [ 1.669 , -0.4386, -0.5397,  0.477 ],
       [ 3.2489, -1.0212, -0.5771,  0.1241]])

通過布爾型索引選取數(shù)組中的數(shù)據(jù)闯参,將總是創(chuàng)建數(shù)據(jù)的副本,即使返回一模一樣的數(shù)組也是如此悲立。

注意:Python關鍵字and和or在布爾型數(shù)組中無效鹿寨。要使用&與|。

通過布爾型數(shù)組設置值是一種經(jīng)常用到的手段薪夕。為了將data中的所有負值都設置為0脚草,我們只需:

In [113]: data[data < 0] = 0

In [114]: data
Out[114]: 
array([[ 0.0929,  0.2817,  0.769 ,  1.2464],
       [ 1.0072,  0.    ,  0.275 ,  0.2289],
       [ 1.3529,  0.8864,  0.    ,  0.    ],
       [ 1.669 ,  0.    ,  0.    ,  0.477 ],
       [ 3.2489,  0.    ,  0.    ,  0.1241],
       [ 0.3026,  0.5238,  0.0009,  1.3438],
       [ 0.    ,  0.    ,  0.    ,  0.    ]])

通過一維布爾數(shù)組設置整行或列的值也很簡單:

In [115]: data[names != 'Joe'] = 7

In [116]: data
Out[116]: 
array([[ 7.    ,  7.    ,  7.    ,  7.    ],
       [ 1.0072,  0.    ,  0.275 ,  0.2289],
       [ 7.    ,  7.    ,  7.    ,  7.    ],
       [ 7.    ,  7.    ,  7.    ,  7.    ],
       [ 7.    ,  7.    ,  7.    ,  7.    ],
       [ 0.3026,  0.5238,  0.0009,  1.3438],
       [ 0.    ,  0.    ,  0.    ,  0.    ]])

后面會看到,這類二維數(shù)據(jù)的操作也可以用pandas方便的來做原献。

花式索引

花式索引(Fancy indexing)是一個NumPy術語馏慨,它指的是利用整數(shù)數(shù)組進行索引。假設我們有一個8×4數(shù)組:

In [117]: arr = np.empty((8, 4))

In [118]: for i in range(8):
   .....:     arr[i] = i

In [119]: arr
Out[119]: 
array([[ 0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 1.,  1.,  1.,  1.],
       [ 2.,  2.,  2.,  2.],
       [ 3.,  3.,  3.,  3.],
       [ 4.,  4.,  4.,  4.],
       [ 5.,  5.,  5.,  5.],
       [ 6.,  6.,  6.,  6.],
       [ 7.,  7.,  7.,  7.]])

為了以特定順序選取行子集姑隅,只需傳入一個用于指定順序的整數(shù)列表或ndarray即可:

In [120]: arr[[4, 3, 0, 6]]
Out[120]: 
array([[ 4.,  4.,  4.,  4.],
       [ 3.,  3.,  3.,  3.],
       [ 0.,  0.,  0.,  0.],
       [ 6.,  6.,  6.,  6.]])

這段代碼確實達到我們的要求了写隶!使用負數(shù)索引將會從末尾開始選取行:

In [121]: arr[[-3, -5, -7]]
Out[121]: 
array([[ 5.,  5.,  5.,  5.],
       [ 3.,  3.,  3.,  3.],
       [ 1.,  1.,  1.,  1.]])

一次傳入多個索引數(shù)組會有一點特別。它返回的是一個一維數(shù)組讲仰,其中的元素對應各個索引元組:

In [122]: arr = np.arange(32).reshape((8, 4))

In [123]: arr
Out[123]: 
array([[ 0,  1,  2,  3],
       [ 4,  5,  6,  7],
       [ 8,  9, 10, 11],
       [12, 13, 14, 15],
       [16, 17, 18, 19],
       [20, 21, 22, 23],
       [24, 25, 26, 27],
       [28, 29, 30, 31]])

In [124]: arr[[1, 5, 7, 2], [0, 3, 1, 2]]
Out[124]: array([ 4, 23, 29, 10])

附錄A中會詳細介紹reshape方法慕趴。

最終選出的是元素(1,0)、(5,3)鄙陡、(7,1)和(2,2)冕房。無論數(shù)組是多少維的,花式索引總是一維的趁矾。

這個花式索引的行為可能會跟某些用戶的預期不一樣(包括我在內(nèi))耙册,選取矩陣的行列子集應該是矩形區(qū)域的形式才對。下面是得到該結果的一個辦法:

In [125]: arr[[1, 5, 7, 2]][:, [0, 3, 1, 2]]
Out[125]: 
array([[ 4,  7,  5,  6],
       [20, 23, 21, 22],
       [28, 31, 29, 30],
       [ 8, 11,  9, 10]])

記住毫捣,花式索引跟切片不一樣详拙,它總是將數(shù)據(jù)復制到新數(shù)組中。

數(shù)組轉置和軸對換

轉置是重塑的一種特殊形式培漏,它返回的是源數(shù)據(jù)的視圖(不會進行任何復制操作)。數(shù)組不僅有transpose方法胡本,還有一個特殊的T屬性:

In [126]: arr = np.arange(15).reshape((3, 5))

In [127]: arr
Out[127]: 
array([[ 0,  1,  2,  3,  4],
       [ 5,  6,  7,  8,  9],
       [10, 11, 12, 13, 14]])

In [128]: arr.T
Out[128]: 
array([[ 0,  5, 10],
       [ 1,  6, 11],
       [ 2,  7, 12],
       [ 3,  8, 13],
       [ 4,  9, 14]])

在進行矩陣計算時牌柄,經(jīng)常需要用到該操作,比如利用np.dot計算矩陣內(nèi)積:

In [129]: arr = np.random.randn(6, 3)

In [130]: arr
Out[130]: 
array([[-0.8608,  0.5601, -1.2659],
       [ 0.1198, -1.0635,  0.3329],
       [-2.3594, -0.1995, -1.542 ],
       [-0.9707, -1.307 ,  0.2863],
       [ 0.378 , -0.7539,  0.3313],
       [ 1.3497,  0.0699,  0.2467]])

In [131]: np.dot(arr.T, arr)
Out[131]:
array([[ 9.2291,  0.9394,  4.948 ],
       [ 0.9394,  3.7662, -1.3622],
       [ 4.948 , -1.3622,  4.3437]])

對于高維數(shù)組侧甫,transpose需要得到一個由軸編號組成的元組才能對這些軸進行轉置(比較費腦子):

In [132]: arr = np.arange(16).reshape((2, 2, 4))

In [133]: arr
Out[133]: 
array([[[ 0,  1,  2,  3],
        [ 4,  5,  6,  7]],
       [[ 8,  9, 10, 11],
        [12, 13, 14, 15]]])

In [134]: arr.transpose((1, 0, 2))
Out[134]: 
array([[[ 0,  1,  2,  3],
        [ 8,  9, 10, 11]],
       [[ 4,  5,  6,  7],
        [12, 13, 14, 15]]])

這里珊佣,第一個軸被換成了第二個蹋宦,第二個軸被換成了第一個,最后一個軸不變咒锻。

簡單的轉置可以使用.T冷冗,它其實就是進行軸對換而已。ndarray還有一個swapaxes方法惑艇,它需要接受一對軸編號:

In [135]: arr
Out[135]: 
array([[[ 0,  1,  2,  3],
        [ 4,  5,  6,  7]],
       [[ 8,  9, 10, 11],
        [12, 13, 14, 15]]])

In [136]: arr.swapaxes(1, 2)
Out[136]: 
array([[[ 0,  4],
        [ 1,  5],
        [ 2,  6],
        [ 3,  7]],
       [[ 8, 12],
        [ 9, 13],
        [10, 14],
        [11, 15]]])

swapaxes也是返回源數(shù)據(jù)的視圖(不會進行任何復制操作)蒿辙。

4.2 通用函數(shù):快速的元素級數(shù)組函數(shù)

通用函數(shù)(即ufunc)是一種對ndarray中的數(shù)據(jù)執(zhí)行元素級運算的函數(shù)。你可以將其看做簡單函數(shù)(接受一個或多個標量值滨巴,并產(chǎn)生一個或多個標量值)的矢量化包裝器思灌。

許多ufunc都是簡單的元素級變體,如sqrt和exp:

In [137]: arr = np.arange(10)

In [138]: arr
Out[138]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])

In [139]: np.sqrt(arr)
Out[139]: 
array([ 0.    ,  1.    ,  1.4142,  1.7321,  2.    ,  2.2361,  2.4495,
        2.6458,  2.8284,  3.    ])

In [140]: np.exp(arr)
Out[140]: 
array([    1.    ,     2.7183,     7.3891,    20.0855,    54.5982,
         148.4132,   403.4288,  1096.6332,  2980.958 ,  8103.0839])

這些都是一元(unary)ufunc恭取。另外一些(如add或maximum)接受2個數(shù)組(因此也叫二元(binary)ufunc)泰偿,并返回一個結果數(shù)組:

In [141]: x = np.random.randn(8)

In [142]: y = np.random.randn(8)

In [143]: x
Out[143]: 
array([-0.0119,  1.0048,  1.3272, -0.9193, -1.5491,  0.0222,  0.7584,
       -0.6605])

In [144]: y
Out[144]: 
array([ 0.8626, -0.01  ,  0.05  ,  0.6702,  0.853 , -0.9559, -0.0235,
       -2.3042])

In [145]: np.maximum(x, y)
Out[145]: 
array([ 0.8626,  1.0048,  1.3272,  0.6702,  0.853 ,  0.0222,  0.7584,   
       -0.6605])

這里,numpy.maximum計算了x和y中元素級別最大的元素蜈垮。

雖然并不常見耗跛,但有些ufunc的確可以返回多個數(shù)組。modf就是一個例子攒发,它是Python內(nèi)置函數(shù)divmod的矢量化版本调塌,它會返回浮點數(shù)數(shù)組的小數(shù)和整數(shù)部分:

In [146]: arr = np.random.randn(7) * 5

In [147]: arr
Out[147]: array([-3.2623, -6.0915, -6.663 ,  5.3731,  3.6182,  3.45  ,  5.0077])

In [148]: remainder, whole_part = np.modf(arr)

In [149]: remainder
Out[149]: array([-0.2623, -0.0915, -0.663 ,  0.3731,
0.6182,  0.45  ,  0.0077])

In [150]: whole_part
Out[150]: array([-3., -6., -6.,  5.,  3.,  3.,  5.])

Ufuncs可以接受一個out可選參數(shù),這樣就能在數(shù)組原地進行操作:

In [151]: arr
Out[151]: array([-3.2623, -6.0915, -6.663 ,  5.3731,  3.6182,  3.45  ,  5.0077])

In [152]: np.sqrt(arr)
Out[152]: array([    nan,     nan,     nan,  2.318 ,  1.9022,  1.8574,  2.2378])

In [153]: np.sqrt(arr, arr)
Out[153]: array([    nan,     nan,     nan,  2.318 ,  1.9022,  1.8574,  2.2378])

In [154]: arr
Out[154]: array([    nan,     nan,     nan,  2.318 ,  1.9022,  1.8574,  2.2378])

表4-3和表4-4分別列出了一些一元和二元ufunc晨继。

image
image
image
image
image

4.3 利用數(shù)組進行數(shù)據(jù)處理

NumPy數(shù)組使你可以將許多種數(shù)據(jù)處理任務表述為簡潔的數(shù)組表達式(否則需要編寫循環(huán))烟阐。用數(shù)組表達式代替循環(huán)的做法,通常被稱為矢量化紊扬。一般來說蜒茄,矢量化數(shù)組運算要比等價的純Python方式快上一兩個數(shù)量級(甚至更多),尤其是各種數(shù)值計算餐屎。在后面內(nèi)容中(見附錄A)我將介紹廣播檀葛,這是一種針對矢量化計算的強大手段。

作為簡單的例子腹缩,假設我們想要在一組值(網(wǎng)格型)上計算函數(shù)sqrt(x^2+y^2)屿聋。np.meshgrid函數(shù)接受兩個一維數(shù)組,并產(chǎn)生兩個二維矩陣(對應于兩個數(shù)組中所有的(x,y)對):

In [155]: points = np.arange(-5, 5, 0.01) # 1000 equally spaced points

In [156]: xs, ys = np.meshgrid(points, points)
In [157]: ys
Out[157]: 
array([[-5.  , -5.  , -5.  , ..., -5.  , -5.  , -5.  ],
       [-4.99, -4.99, -4.99, ..., -4.99, -4.99, -4.99],
       [-4.98, -4.98, -4.98, ..., -4.98, -4.98, -4.98],
       ..., 
       [ 4.97,  4.97,  4.97, ...,  4.97,  4.97,  4.97],
       [ 4.98,  4.98,  4.98, ...,  4.98,  4.98,  4.98],
       [ 4.99,  4.99,  4.99, ...,  4.99,  4.99,  4.99]])

現(xiàn)在藏鹊,對該函數(shù)的求值運算就好辦了润讥,把這兩個數(shù)組當做兩個浮點數(shù)那樣編寫表達式即可:

In [158]: z = np.sqrt(xs ** 2 + ys ** 2)

In [159]: z
Out[159]: 
array([[ 7.0711,  7.064 ,  7.0569, ...,  7.0499,  7.0569,  7.064 ],
       [ 7.064 ,  7.0569,  7.0499, ...,  7.0428,  7.0499,  7.0569],
       [ 7.0569,  7.0499,  7.0428, ...,  7.0357,  7.0428, 7.0499],
       ..., 
       [ 7.0499,  7.0428,  7.0357, ...,  7.0286,  7.0357,  7.0428],
       [ 7.0569,  7.0499,  7.0428, ...,  7.0357,  7.0428,  7.0499],
       [ 7.064 ,  7.0569,  7.0499, ...,  7.0428,  7.0499,  7.0569]])

作為第9章的先導,我用matplotlib創(chuàng)建了這個二維數(shù)組的可視化:

In [160]: import matplotlib.pyplot as plt

In [161]: plt.imshow(z, cmap=plt.cm.gray); plt.colorbar()
Out[161]: <matplotlib.colorbar.Colorbar at 0x7f715e3fa630>

In [162]: plt.title("Image plot of $\sqrt{x^2 + y^2}$ for a grid of values")
Out[162]: <matplotlib.text.Text at 0x7f715d2de748>

見圖4-3盘寡。這張圖是用matplotlib的imshow函數(shù)創(chuàng)建的楚殿。

image

將條件邏輯表述為數(shù)組運算

numpy.where函數(shù)是三元表達式x if condition else y的矢量化版本。假設我們有一個布爾數(shù)組和兩個值數(shù)組:

In [165]: xarr = np.array([1.1, 1.2, 1.3, 1.4, 1.5])

In [166]: yarr = np.array([2.1, 2.2, 2.3, 2.4, 2.5])

In [167]: cond = np.array([True, False, True, True, False])

假設我們想要根據(jù)cond中的值選取xarr和yarr的值:當cond中的值為True時竿痰,選取xarr的值脆粥,否則從yarr中選取砌溺。列表推導式的寫法應該如下所示:

In [168]: result = [(x if c else y)
   .....:           for x, y, c in zip(xarr, yarr, cond)]

In [169]: result
Out[169]: [1.1000000000000001, 2.2000000000000002, 1.3, 1.3999999999999999, 2.5]

這有幾個問題。第一变隔,它對大數(shù)組的處理速度不是很快(因為所有工作都是由純Python完成的)规伐。第二,無法用于多維數(shù)組匣缘。若使用np.where猖闪,則可以將該功能寫得非常簡潔:

In [170]: result = np.where(cond, xarr, yarr)

In [171]: result
Out[171]: array([ 1.1,  2.2,  1.3,  1.4,  2.5])

np.where的第二個和第三個參數(shù)不必是數(shù)組,它們都可以是標量值孵户。在數(shù)據(jù)分析工作中萧朝,where通常用于根據(jù)另一個數(shù)組而產(chǎn)生一個新的數(shù)組。假設有一個由隨機數(shù)據(jù)組成的矩陣夏哭,你希望將所有正值替換為2检柬,將所有負值替換為-2。若利用np.where竖配,則會非常簡單:

In [172]: arr = np.random.randn(4, 4)

In [173]: arr
Out[173]: 
array([[-0.5031, -0.6223, -0.9212, -0.7262],
       [ 0.2229,  0.0513, -1.1577,  0.8167],
       [ 0.4336,  1.0107,  1.8249, -0.9975],
       [ 0.8506, -0.1316,  0.9124,  0.1882]])

In [174]: arr > 0
Out[174]: 
array([[False, False, False, False],
       [ True,  True, False,  True],
       [ True,  True,  True, False],
       [ True, False,  True,  True]], dtype=bool)

In [175]: np.where(arr > 0, 2, -2)
Out[175]: 
array([[-2, -2, -2, -2],
       [ 2,  2, -2,  2],
       [ 2,  2,  2, -2],
       [ 2, -2,  2,  2]])

使用np.where何址,可以將標量和數(shù)組結合起來。例如进胯,我可用常數(shù)2替換arr中所有正的值:

In [176]: np.where(arr > 0, 2, arr) # set only positive values to 2
Out[176]: 
array([[-0.5031, -0.6223, -0.9212, -0.7262],
       [ 2.    ,  2.    , -1.1577,  2.    ],
       [ 2.    ,  2.    ,  2.    , -0.9975],
       [ 2.    , -0.1316,  2.    ,  2.    ]])

傳遞給where的數(shù)組大小可以不相等用爪,甚至可以是標量值。

數(shù)學和統(tǒng)計方法

可以通過數(shù)組上的一組數(shù)學函數(shù)對整個數(shù)組或某個軸向的數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計計算胁镐。sum偎血、mean以及標準差std等聚合計算(aggregation,通常叫做約簡(reduction))既可以當做數(shù)組的實例方法調(diào)用盯漂,也可以當做頂級NumPy函數(shù)使用颇玷。

這里,我生成了一些正態(tài)分布隨機數(shù)據(jù)就缆,然后做了聚類統(tǒng)計:

In [177]: arr = np.random.randn(5, 4)

In [178]: arr
Out[178]: 
array([[ 2.1695, -0.1149,  2.0037,  0.0296],
       [ 0.7953,  0.1181, -0.7485,  0.585 ],
       [ 0.1527, -1.5657, -0.5625, -0.0327],
       [-0.929 , -0.4826, -0.0363,  1.0954],
       [ 0.9809, -0.5895,  1.5817, -0.5287]])

In [179]: arr.mean()
Out[179]: 0.19607051119998253

In [180]: np.mean(arr)
Out[180]: 0.19607051119998253

In [181]: arr.sum()
Out[181]: 3.9214102239996507

mean和sum這類的函數(shù)可以接受一個axis選項參數(shù)帖渠,用于計算該軸向上的統(tǒng)計值,最終結果是一個少一維的數(shù)組:

In [182]: arr.mean(axis=1)
Out[182]: array([ 1.022 ,  0.1875, -0.502 , -0.0881,  0.3611])

In [183]: arr.sum(axis=0)
Out[183]: array([ 3.1693, -2.6345,  2.2381,  1.1486])

這里竭宰,arr.mean(1)是“計算行的平均值”空郊,arr.sum(0)是“計算每列的和”。

其他如cumsum和cumprod之類的方法則不聚合切揭,而是產(chǎn)生一個由中間結果組成的數(shù)組:

In [184]: arr = np.array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7])

In [185]: arr.cumsum()
Out[185]: array([ 0,  1,  3,  6, 10, 15, 21, 28])

在多維數(shù)組中狞甚,累加函數(shù)(如cumsum)返回的是同樣大小的數(shù)組,但是會根據(jù)每個低維的切片沿著標記軸計算部分聚類:

In [186]: arr = np.array([[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8]])

In [187]: arr
Out[187]: 
array([[0, 1, 2],
       [3, 4, 5],
       [6, 7, 8]])

In [188]: arr.cumsum(axis=0)
Out[188]: 
array([[ 0,  1,  2],
       [ 3,  5,  7],
       [ 9, 12, 15]])

In [189]: arr.cumprod(axis=1)
Out[189]: 
array([[  0,   0,   0],
       [  3,  12,  60],
       [  6,  42, 336]])

表4-5列出了全部的基本數(shù)組統(tǒng)計方法廓旬。后續(xù)章節(jié)中有很多例子都會用到這些方法哼审。

image
image

用于布爾型數(shù)組的方法

在上面這些方法中,布爾值會被強制轉換為1(True)和0(False)。因此棺蛛,sum經(jīng)常被用來對布爾型數(shù)組中的True值計數(shù):

In [190]: arr = np.random.randn(100)

In [191]: (arr > 0).sum() # Number of positive values
Out[191]: 42

另外還有兩個方法any和all,它們對布爾型數(shù)組非常有用巩步。any用于測試數(shù)組中是否存在一個或多個True旁赊,而all則檢查數(shù)組中所有值是否都是True:

In [192]: bools = np.array([False, False, True, False])

In [193]: bools.any()
Out[193]: True

In [194]: bools.all()
Out[194]: False

這兩個方法也能用于非布爾型數(shù)組,所有非0元素將會被當做True椅野。

排序

跟Python內(nèi)置的列表類型一樣终畅,NumPy數(shù)組也可以通過sort方法就地排序:

In [195]: arr = np.random.randn(6)

In [196]: arr
Out[196]: array([ 0.6095, -0.4938,  1.24  , -0.1357,  1.43  , -0.8469])

In [197]: arr.sort()

In [198]: arr
Out[198]: array([-0.8469, -0.4938, -0.1357,  0.6095,  1.24  ,  1.43  ])

多維數(shù)組可以在任何一個軸向上進行排序,只需將軸編號傳給sort即可:

In [199]: arr = np.random.randn(5, 3)

In [200]: arr
Out[200]: 
array([[ 0.6033,  1.2636, -0.2555],
       [-0.4457,  0.4684, -0.9616],
       [-1.8245,  0.6254,  1.0229],
       [ 1.1074,  0.0909, -0.3501],
       [ 0.218 , -0.8948, -1.7415]])

In [201]: arr.sort(1)

In [202]: arr
Out[202]: 
array([[-0.2555,  0.6033,  1.2636],
       [-0.9616, -0.4457,  0.4684],
       [-1.8245,  0.6254,  1.0229],
       [-0.3501,  0.0909,  1.1074],
       [-1.7415, -0.8948,  0.218 ]])

頂級方法np.sort返回的是數(shù)組的已排序副本竟闪,而就地排序則會修改數(shù)組本身离福。計算數(shù)組分位數(shù)最簡單的辦法是對其進行排序,然后選取特定位置的值:

In [203]: large_arr = np.random.randn(1000)

In [204]: large_arr.sort()

In [205]: large_arr[int(0.05 * len(large_arr))] # 5% quantile
Out[205]: -1.5311513550102103

更多關于NumPy排序方法以及諸如間接排序之類的高級技術炼蛤,請參閱附錄A妖爷。在pandas中還可以找到一些其他跟排序有關的數(shù)據(jù)操作(比如根據(jù)一列或多列對表格型數(shù)據(jù)進行排序)。

唯一化以及其它的集合邏輯

NumPy提供了一些針對一維ndarray的基本集合運算理朋。最常用的可能要數(shù)np.unique了絮识,它用于找出數(shù)組中的唯一值并返回已排序的結果:

In [206]: names = np.array(['Bob', 'Joe', 'Will', 'Bob', 'Will', 'Joe', 'Joe'])

In [207]: np.unique(names)
Out[207]: 
array(['Bob', 'Joe', 'Will'],
      dtype='<U4')

In [208]: ints = np.array([3, 3, 3, 2, 2, 1, 1, 4, 4])

In [209]: np.unique(ints)
Out[209]: array([1, 2, 3, 4])

拿跟np.unique等價的純Python代碼來對比一下:

In [210]: sorted(set(names))
Out[210]: ['Bob', 'Joe', 'Will']

另一個函數(shù)np.in1d用于測試一個數(shù)組中的值在另一個數(shù)組中的成員資格,返回一個布爾型數(shù)組:

In [211]: values = np.array([6, 0, 0, 3, 2, 5, 6])

In [212]: np.in1d(values, [2, 3, 6])
Out[212]: array([ True, False, False,  True,  True, False,  True], dtype=bool)

NumPy中的集合函數(shù)請參見表4-6嗽上。

image

4.4 用于數(shù)組的文件輸入輸出

NumPy能夠讀寫磁盤上的文本數(shù)據(jù)或二進制數(shù)據(jù)次舌。這一小節(jié)只討論NumPy的內(nèi)置二進制格式,因為更多的用戶會使用pandas或其它工具加載文本或表格數(shù)據(jù)(見第6章)兽愤。

np.save和np.load是讀寫磁盤數(shù)組數(shù)據(jù)的兩個主要函數(shù)彼念。默認情況下,數(shù)組是以未壓縮的原始二進制格式保存在擴展名為.npy的文件中的:

In [213]: arr = np.arange(10)

In [214]: np.save('some_array', arr)

如果文件路徑末尾沒有擴展名.npy浅萧,則該擴展名會被自動加上。然后就可以通過np.load讀取磁盤上的數(shù)組:

In [215]: np.load('some_array.npy')
Out[215]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])

通過np.savez可以將多個數(shù)組保存到一個未壓縮文件中土思,將數(shù)組以關鍵字參數(shù)的形式傳入即可:

In [216]: np.savez('array_archive.npz', a=arr, b=arr)

加載.npz文件時闪湾,你會得到一個類似字典的對象,該對象會對各個數(shù)組進行延遲加載:

In [217]: arch = np.load('array_archive.npz')

In [218]: arch['b']
Out[218]: array([0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9])

如果要將數(shù)據(jù)壓縮,可以使用numpy.savez_compressed:

In [219]: np.savez_compressed('arrays_compressed.npz', a=arr, b=arr)

4.5 線性代數(shù)

線性代數(shù)(如矩陣乘法羽嫡、矩陣分解魂爪、行列式以及其他方陣數(shù)學等)是任何數(shù)組庫的重要組成部分粗井。不像某些語言(如MATLAB)胆剧,通過*對兩個二維數(shù)組相乘得到的是一個元素級的積蚁阳,而不是一個矩陣點積矮燎。因此浅乔,NumPy提供了一個用于矩陣乘法的dot函數(shù)(既是一個數(shù)組方法也是numpy命名空間中的一個函數(shù)):

In [223]: x = np.array([[1., 2., 3.], [4., 5., 6.]])

In [224]: y = np.array([[6., 23.], [-1, 7], [8, 9]])

In [225]: x
Out[225]: 
array([[ 1.,  2.,  3.],
       [ 4.,  5.,  6.]])

In [226]: y
Out[226]: 
array([[  6.,  23.],
       [ -1.,   7.],
       [  8.,   9.]])

In [227]: x.dot(y)
Out[227]: 
array([[  28.,   64.],
       [  67.,  181.]])

x.dot(y)等價于np.dot(x, y):

In [228]: np.dot(x, y)
Out[228]: 
array([[  28.,   64.],
       [  67.,  181.]])

一個二維數(shù)組跟一個大小合適的一維數(shù)組的矩陣點積運算之后將會得到一個一維數(shù)組:

In [229]: np.dot(x, np.ones(3))
Out[229]: array([  6.,  15.])

@符(類似Python 3.5)也可以用作中綴運算符埠忘,進行矩陣乘法:

In [230]: x @ np.ones(3)
Out[230]: array([  6.,  15.])

numpy.linalg中有一組標準的矩陣分解運算以及諸如求逆和行列式之類的東西旨怠。它們跟MATLAB和R等語言所使用的是相同的行業(yè)標準線性代數(shù)庫器一,如BLAS渺贤、LAPACK、Intel MKL(Math Kernel Library请毛,可能有癣亚,取決于你的NumPy版本)等:

In [231]: from numpy.linalg import inv, qr

In [232]: X = np.random.randn(5, 5)

In [233]: mat = X.T.dot(X)

In [234]: inv(mat)
Out[234]: 
array([[  933.1189,   871.8258, -1417.6902, -1460.4005,  1782.1391],
       [  871.8258,   815.3929, -1325.9965, -1365.9242,  1666.9347],
       [-1417.6902, -1325.9965,  2158.4424,  2222.0191, -2711.6822],
       [-1460.4005, -1365.9242,  2222.0191,  2289.0575, -2793.422 ],
       [ 1782.1391,  1666.9347, -2711.6822, -2793.422 ,  3409.5128]])

In [235]: mat.dot(inv(mat))
Out[235]: 
array([[ 1.,  0., -0., -0., -0.],
       [-0.,  1.,  0.,  0.,  0.],
       [ 0.,  0.,  1.,  0.,  0.],
       [-0.,  0.,  0.,  1., -0.],
       [-0.,  0.,  0.,  0.,  1.]])

In [236]: q, r = qr(mat)

In [237]: r
Out[237]: 
array([[-1.6914,  4.38  ,  0.1757,  0.4075, -0.7838],
       [ 0.    , -2.6436,  0.1939, -3.072 , -1.0702],
       [ 0.    ,  0.    , -0.8138,  1.5414,  0.6155],
       [ 0.    ,  0.    ,  0.    , -2.6445, -2.1669],
       [ 0.    ,  0.    ,  0.    ,  0.    ,  0.0002]])

表達式X.T.dot(X)計算X和它的轉置X.T的點積。

表4-7中列出了一些最常用的線性代數(shù)函數(shù)获印。

image

4.6 偽隨機數(shù)生成

numpy.random模塊對Python內(nèi)置的random進行了補充述雾,增加了一些用于高效生成多種概率分布的樣本值的函數(shù)街州。例如,你可以用normal來得到一個標準正態(tài)分布的4×4樣本數(shù)組:

In [238]: samples = np.random.normal(size=(4, 4))

In [239]: samples
Out[239]: 
array([[ 0.5732,  0.1933,  0.4429,  1.2796],
       [ 0.575 ,  0.4339, -0.7658, -1.237 ],
       [-0.5367,  1.8545, -0.92  , -0.1082],
       [ 0.1525,  0.9435, -1.0953, -0.144 ]])

而Python內(nèi)置的random模塊則只能一次生成一個樣本值玻孟。從下面的測試結果中可以看出唆缴,如果需要產(chǎn)生大量樣本值,numpy.random快了不止一個數(shù)量級:

In [240]: from random import normalvariate

In [241]: N = 1000000

In [242]: %timeit samples = [normalvariate(0, 1) for _ in range(N)]
1.77 s +- 126 ms per loop (mean +- std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

In [243]: %timeit np.random.normal(size=N)
61.7 ms +- 1.32 ms per loop (mean +- std. dev. of 7 runs, 10 loops each)

我們說這些都是偽隨機數(shù)黍翎,是因為它們都是通過算法基于隨機數(shù)生成器種子面徽,在確定性的條件下生成的。你可以用NumPy的np.random.seed更改隨機數(shù)生成種子:

In [244]: np.random.seed(1234)

numpy.random的數(shù)據(jù)生成函數(shù)使用了全局的隨機種子匣掸。要避免全局狀態(tài)趟紊,你可以使用numpy.random.RandomState,創(chuàng)建一個與其它隔離的隨機數(shù)生成器:

In [245]: rng = np.random.RandomState(1234)

In [246]: rng.randn(10)
Out[246]: 
array([ 0.4714, -1.191 ,  1.4327, -0.3127, -0.7206,  0.8872,  0.8596,
       -0.6365,  0.0157, -2.2427])

表4-8列出了numpy.random中的部分函數(shù)碰酝。在下一節(jié)中霎匈,我將給出一些利用這些函數(shù)一次性生成大量樣本值的范例。

image
image

4.7 示例:隨機漫步

我們通過模擬隨機漫步來說明如何運用數(shù)組運算送爸。先來看一個簡單的隨機漫步的例子:從0開始铛嘱,步長1和-1出現(xiàn)的概率相等。

下面是一個通過內(nèi)置的random模塊以純Python的方式實現(xiàn)1000步的隨機漫步:

In [247]: import random
   .....: position = 0
   .....: walk = [position]
   .....: steps = 1000
   .....: for i in range(steps):
   .....:     step = 1 if random.randint(0, 1) else -1
   .....:     position += step
   .....:     walk.append(position)
   .....:

圖4-4是根據(jù)前100個隨機漫步值生成的折線圖:

In [249]: plt.plot(walk[:100])

image

不難看出袭厂,這其實就是隨機漫步中各步的累計和墨吓,可以用一個數(shù)組運算來實現(xiàn)。因此纹磺,我用np.random模塊一次性隨機產(chǎn)生1000個“擲硬幣”結果(即兩個數(shù)中任選一個)帖烘,將其分別設置為1或-1,然后計算累計和:

In [251]: nsteps = 1000

In [252]: draws = np.random.randint(0, 2, size=nsteps)

In [253]: steps = np.where(draws > 0, 1, -1)

In [254]: walk = steps.cumsum()

有了這些數(shù)據(jù)之后橄杨,我們就可以沿著漫步路徑做一些統(tǒng)計工作了蚓让,比如求取最大值和最小值:

In [255]: walk.min()
Out[255]: -3

In [256]: walk.max()
Out[256]: 31

現(xiàn)在來看一個復雜點的統(tǒng)計任務——首次穿越時間,即隨機漫步過程中第一次到達某個特定值的時間讥珍。假設我們想要知道本次隨機漫步需要多久才能距離初始0點至少10步遠(任一方向均可)历极。np.abs(walk)>=10可以得到一個布爾型數(shù)組,它表示的是距離是否達到或超過10衷佃,而我們想要知道的是第一個10或-10的索引趟卸。可以用argmax來解決這個問題氏义,它返回的是該布爾型數(shù)組第一個最大值的索引(True就是最大值):

In [257]: (np.abs(walk) >= 10).argmax()
Out[257]: 37

注意锄列,這里使用argmax并不是很高效,因為它無論如何都會對數(shù)組進行完全掃描惯悠。在本例中邻邮,只要發(fā)現(xiàn)了一個True,那我們就知道它是個最大值了克婶。

一次模擬多個隨機漫步

如果你希望模擬多個隨機漫步過程(比如5000個)筒严,只需對上面的代碼做一點點修改即可生成所有的隨機漫步過程丹泉。只要給numpy.random的函數(shù)傳入一個二元元組就可以產(chǎn)生一個二維數(shù)組,然后我們就可以一次性計算5000個隨機漫步過程(一行一個)的累計和了:

In [258]: nwalks = 5000

In [259]: nsteps = 1000

In [260]: draws = np.random.randint(0, 2, size=(nwalks, nsteps)) # 0 or 1

In [261]: steps = np.where(draws > 0, 1, -1)

In [262]: walks = steps.cumsum(1)

In [263]: walks
Out[263]: 
array([[  1,   0,   1, ...,   8,   7,   8],
       [  1,   0,  -1, ...,  34,  33,  32],
       [  1,   0,  -1, ...,   4,   5,   4],
       ..., 
       [  1,   2,   1, ...,  24,  25,  26],
       [  1,   2,   3, ...,  14,  13,  14],
       [ -1,  -2,  -3, ..., -24, -23, -22]])

現(xiàn)在鸭蛙,我們來計算所有隨機漫步過程的最大值和最小值:

In [264]: walks.max()
Out[264]: 138

In [265]: walks.min()
Out[265]: -133

得到這些數(shù)據(jù)之后摹恨,我們來計算30或-30的最小穿越時間。這里稍微復雜些娶视,因為不是5000個過程都到達了30晒哄。我們可以用any方法來對此進行檢查:

In [266]: hits30 = (np.abs(walks) >= 30).any(1)

In [267]: hits30
Out[267]: array([False,  True, False, ..., False,  True, False], dtype=bool)

In [268]: hits30.sum() # Number that hit 30 or -30
Out[268]: 3410

然后我們利用這個布爾型數(shù)組選出那些穿越了30(絕對值)的隨機漫步(行),并調(diào)用argmax在軸1上獲取穿越時間:

In [269]: crossing_times = (np.abs(walks[hits30]) >= 30).argmax(1)

In [270]: crossing_times.mean()
Out[270]: 498.88973607038122

請嘗試用其他分布方式得到漫步數(shù)據(jù)肪获。只需使用不同的隨機數(shù)生成函數(shù)即可寝凌,如normal用于生成指定均值和標準差的正態(tài)分布數(shù)據(jù):

In [271]: steps = np.random.normal(loc=0, scale=0.25,
   .....:                          size=(nwalks, nsteps))

4.8 結論

雖然本書剩下的章節(jié)大部分是用pandas規(guī)整數(shù)據(jù),我們還是會用到相似的基于數(shù)組的計算孝赫。在附錄A中较木,我們會深入挖掘NumPy的特點,進一步學習數(shù)組的技巧寒锚。

作者:SeanCheney
鏈接:http://www.reibang.com/p/a380222a3292
來源:簡書
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