R數(shù)據(jù)可視化16:啞鈴圖

什么是啞鈴圖(Dumbbell Chart)

啞鈴圖(Dumbbell Chart)就像它的名字一樣裳扯,長(zhǎng)得像一個(gè)啞鈴铜秆。當(dāng)然當(dāng)你有多個(gè)節(jié)點(diǎn)的時(shí)候誓琼,它們還有點(diǎn)像DNA油湖,所以也有人把這種圖形稱為DNA圖巍扛。
啞鈴圖是一種很好的可視化方式,比如你想要表征不同指標(biāo)的不同組的情況你可以用多個(gè)“啞鈴”表示乏德。另外撤奸,你想要表示某一組在外界刺激后的變化情況也可以用這種方式。

我們來(lái)看兩個(gè)例子。第一個(gè)例子中比較了成年人和青少年在使用視頻游戲設(shè)備方面的差異胧瓜。很直觀的可以看到青少年比成年人頻率更高矢棚,同時(shí)在不同設(shè)備的使用頻率也能看到明顯差異。
第二個(gè)例子贷痪,分別顯示了最低價(jià)格幻妓,中間的價(jià)格和最高價(jià)格蹦误,可以看到不同項(xiàng)目的花費(fèi)差異劫拢。

那么在生物研究中我們可以用于表示哪些數(shù)據(jù)呢?
最簡(jiǎn)單的强胰,當(dāng)然是有多個(gè)指標(biāo)的時(shí)候舱沧,我們可以用于顯示對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組的差異∨佳螅或者是男女之間的差異等等熟吏。
當(dāng)然,如果你想顯示給予一些刺激玄窝,比如用藥前后指標(biāo)的變化牵寺,這也是一個(gè)選擇。
另外恩脂,現(xiàn)在有很多是多組學(xué)的數(shù)據(jù)帽氓,我們會(huì)統(tǒng)計(jì)志愿者的年齡,或者展示某些生理指標(biāo)的范圍等俩块,所以我們也可以考慮第二個(gè)例子黎休,用啞鈴圖進(jìn)行展示,這樣可能會(huì)比圖標(biāo)看起來(lái)更加直觀一些玉凯,也顯得更加美觀势腮。

怎么做啞鈴圖

使用ggalt包或者plotly包就可以實(shí)現(xiàn)啞鈴圖的制作。我們選擇使用ggalt包(該包基于ggplot2包)漫仆。

1)需要什么格式的數(shù)據(jù)
這次使用一個(gè)不同學(xué)校男女年收入(單位:千美元)的數(shù)據(jù)捎拯。
具體如下:

dat <- read.csv("https://raw.githubusercontent.com/plotly/datasets/master/school_earnings.csv")
head(dat)
     School Women Men Gap
1       MIT    94 152  58
2  Stanford    96 151  55
3   Harvard   112 165  53
4    U.Penn    92 141  49
5 Princeton    90 137  47
6   Chicago    78 118  40

一共統(tǒng)計(jì)了21所美國(guó)高校,包括哈佛盲厌、斯坦福署照、MIT等。

2)如何作圖

library(ggplot2)
library(ggalt)

ggplot(aes(x=Women,xend=Men,y=School),data=dat)+
  geom_dumbbell(colour_x = "#FFB6C1",colour_xend = "#4169E1",size_x = 2,size_xend = 2,size=0.5,color="gray")+
  theme_light()+
  theme(panel.grid.minor.x =element_blank(),
        )+
  xlab("Annual Salary (in thousands)")
  

image.png

當(dāng)然還可以狸眼,進(jìn)一步修改藤树,比如:添加一個(gè)外環(huán)

library(ggplot2)
library(ggalt)

ggplot(aes(x=Women,xend=Men,y=School),data=dat)+
  geom_dumbbell(colour_x = "#FFB6C1",colour_xend = "#4169E1",size_x = 2,size_xend = 2,size=0.5,color="gray")+
  geom_point(aes(x=Women,y=School,size=Women),alpha=0.5,color="#FFB6C1")+
  geom_point(aes(x=Men,y=School,size=Men),alpha=0.5,color="#4169E1")+
  theme_light()+
  theme(panel.grid.minor.x =element_blank(),
        legend.position = c("none")
        )+
  xlab("Annual Salary (in thousands)")

又比如再加入Gap的人數(shù):

library(ggplot2)
library(ggalt)

ggplot(aes(x=Women,xend=Men,y=School),data=dat)+
  geom_dumbbell(colour_x = "#FFB6C1",colour_xend = "#4169E1",size_x = 2,size_xend = 2,size=0.5,color="gray")+
  geom_point(aes(x=Women,y=School,size=Women),alpha=0.5,color="#FFB6C1")+
  geom_point(aes(x=Men,y=School,size=Men),alpha=0.5,color="#4169E1")+
  geom_point(aes(x=Gap,y=School),color="#9ACD32",shape=2)+
  theme_light()+
  theme(panel.grid.minor.x =element_blank(),
        legend.position = c("none")
        )+
  xlab("Annual Salary (in thousands)")

也可以換一個(gè)風(fēng)格:

library(ggplot2)
library(ggalt)

ggplot(aes(x=Women,xend=Men,y=School),data=dat)+
  geom_dumbbell(colour_x = "#8B8B7A",colour_xend = "#9ACD32",size_x = 2,size_xend = 2,size=0.5,color="gray",dot_guide = T)+
  theme_light()+
  theme(panel.grid.minor.x =element_blank(),
        panel.grid = element_blank(),
        legend.position = c("none")
        )+
  xlab("Annual Salary (in thousands)")

還可以加入平均值:

library(ggplot2)
library(ggalt)

dat$mean<-apply(dat[,2:3],1,mean)
ggplot(aes(x=Women,xend=Men,y=School),data=dat)+
  geom_dumbbell(colour_x = "#4682B4",colour_xend = "#CD2626",size_x = 3,size_xend = 3,size=0.5,color="gray",dot_guide = T)+
  geom_point(aes(x=mean,y=School),color="#EE7621",size=3)+
  theme_light()+
  theme(panel.grid.minor.x =element_blank(),
        panel.grid = element_blank(),
        legend.position = c("none")
        )+
  xlab("Annual Salary (in thousands)")

然后可以用AI添加一下圖例哦

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