變量的最后一個(gè)主角绩社，便是通路。通路一般作為因變量或下游效應(yīng)變量出現(xiàn)腋舌，是一群有順序地傳遞信號(hào)盏触，發(fā)揮協(xié)同或相似功能的明星分子的集合。是實(shí)驗(yàn)論證中块饺，往往也只需要檢測(cè)幾個(gè)代表性的biomarker通路蛋白和磷酸化蛋白的表達(dá)量赞辩，來(lái)表示通路受到影響。
以下9路神仙可獨(dú)當(dāng)一面授艰，也可crosstalk辨嗽，這樣參與科研故事的三個(gè)大戲就已悉數(shù)登場(chǎng)。分子淮腾，藥物糟需，通路，三變量+五恒量谷朝。單個(gè)舞臺(tái)的邏輯框架和層次已經(jīng)達(dá)成洲押，在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中，懂得靠明星通路圆凰，解釋主變量部分HOW的問(wèn)題杈帐，可以跨越3分文章的水平。
通路如何篩猜，在13#陰陽(yáng)兩儀中也有說(shuō)明挑童，我把他也放到這里來(lái)累铅。
篩通路：1.抗體庫(kù)，每個(gè)通路選1-2關(guān)鍵分子（如Wnt選b-Catenin站叼；PI3K/AKT選磷酸化的AKT娃兽；JAK-STAT選磷酸化的STAT3），發(fā)現(xiàn)活性有改變大年，再檢查上下游明星蛋白换薄，有的放矢，但文章中仍要聚焦一條翔试。2.通路芯片轻要，pathway array，包含成百上千個(gè)位點(diǎn)抗體垦缅，通量高冲泥，+WB驗(yàn)證。3.用通路的抑制劑和激活劑壁涎。
第6策通路圓滿凡恍，第一章眾妙之門(mén)便已收官，這一章講述了基礎(chǔ)科研恒量變量勾搭形成舞臺(tái)故事的邏輯和框架怔球。至于怎么誰(shuí)來(lái)唱戲嚼酝，怎么唱的更好，我們且看第二章竟坛。
知識(shí)積累：
信號(hào)作用于細(xì)胞的5種結(jié)局：促進(jìn)代謝闽巩、細(xì)胞分裂、細(xì)胞分化担汤、細(xì)胞死亡或其他-激活某種特定細(xì)胞功能涎跨。
狹義的信號(hào)通路：細(xì)胞外分子信號(hào)經(jīng)細(xì)胞膜傳入細(xì)胞內(nèi)發(fā)揮效應(yīng)的酶促反應(yīng)通路。
信號(hào)通路三信使：第一信使：胞外配體崭歧。第二信使：胞內(nèi)信號(hào)分子隅很。第三信使：轉(zhuǎn)錄因子。
信號(hào)通路的三個(gè)基本構(gòu)成元件：1.配體（細(xì)胞外的分子信號(hào)）和受體（細(xì)胞膜或細(xì)胞內(nèi)率碾，可與配體結(jié)合）叔营。2.蛋白激酶，上游蛋白通過(guò)磷酸化作用于下游蛋白播掷，使下游蛋白構(gòu)象改變审编。3.轉(zhuǎn)錄因子，通路的效應(yīng)器歧匈。
明星通路：
1.(TNF-a和TNF-b→IKK→) NF-KB（促進(jìn)轉(zhuǎn)錄→CyclinD1和c-Myc等），該通路持續(xù)激活會(huì)導(dǎo)致生長(zhǎng)失控砰嘁，抑制細(xì)胞凋亡件炉，促進(jìn)腫瘤轉(zhuǎn)移和血管新生等勘究，比較萬(wàn)金油;
2.（EFGR→）PI3K/AKT(→凋亡相關(guān)蛋白Bad，Caspase9)斟冕，調(diào)節(jié)增殖口糕、分化、凋亡及遷移等表型磕蛇【懊瑁或PI3K/AKT/mTOR（→HIF1a，c-Myc秀撇，F(xiàn)oxO）超棺。（PI3K與PTEN作用相反）
3.（細(xì)胞因子，神經(jīng)遞質(zhì)呵燕，激素→）MAPK→MKK→MKKK→（分支通路還有ERK,JNK,p38MAPK,ERK5等）棠绘，該通路調(diào)節(jié)細(xì)胞的生長(zhǎng)、分化再扭、應(yīng)激和炎癥反應(yīng)等氧苍。
4.（白介2、GM-CSF泛范、GH让虐、EGF、PDGF罢荡、IFN）→JAK-STAT（→調(diào)控下游靶基因）赡突，該通路與增殖、分化柠傍、凋亡有關(guān)系麸俘，也是個(gè)萬(wàn)金油。
5.（TGF-b惧笛、BMP→）TFG-b/SMAD从媚，與EMT調(diào)節(jié)相關(guān)。
6.（跨膜受體FZD→）Wnt（→b-Catenin→TCF/LEF→啟動(dòng)下游靶基因轉(zhuǎn)錄）患整，與EMT調(diào)節(jié)相關(guān)拜效。
7.Notch（→蛋白酶水解→NICD\ICN→結(jié)合CSL→調(diào)節(jié)靶基因表達(dá)），Notch通路的受體配體都是膜蛋白各谚，是細(xì)胞相互靠近接觸后的活化狀態(tài)紧憾。
8.Hh蛋白→Hedgehog→（Smo正向激活 or Ptc抑制Smo的活性）→Gli蛋白家族。與Wnt昌渤、Nocth常cross talk赴穗。
9.膜蛋白受體→Hippo→YAP/TAZ。調(diào)節(jié)細(xì)胞的增殖、分化以及凋亡般眉。與Notch了赵、Wnt、MAPK都有交集甸赃。
