ARGs
畜禽廢物和處理過的廢水中可能存在抗微生物藥物耐藥性刷允，可擴(kuò)散到農(nóng)田
畜禽糞便福铅、奶牛場瀉湖廢水和處理過的廢水是已知的抗生素抗性基因(ARGs)钧唐、耐抗生素細(xì)菌(ARB)和毒力因子基因(VFGs)的蓄水池溪烤，將它們應(yīng)用于農(nóng)田可能會對公共衛(wèi)生構(gòu)成嚴(yán)重威脅县昂。然而，它們對農(nóng)田的傳播以及對氮循環(huán)等重要地球化學(xué)途徑的影響尚未得到共同研究棍弄。在這項(xiàng)研究中望薄，我們進(jìn)行了鳥槍宏基因組測序和分析，以檢測來自美國西海岸集中動物飼養(yǎng)作業(yè)(CAFOs)和城市污水處理廠收集的不同牲畜糞便/瀉湖和處理廢水中微生物群落呼畸、ARGs痕支、VFG和N循環(huán)基因的多樣性和組成∫鄹基于InvSimpson的多變量分析顯示采转，不同微生物組的細(xì)菌類群多樣性指數(shù)差異不顯著(P?=?0.05)，但豬糞與其他微生物組源的ARG機(jī)制存在差異瞬痘。對比抗性組譜分析顯示，微生物組樣品中的ARGs屬于4個(gè)核心抗性類別:氨基糖苷類(40-55?%)板熊、四環(huán)素類(30-45?%)框全、β -內(nèi)酰胺類(20-35?%)、大環(huán)內(nèi)酯類(18-30?%)和>50?%干签，24個(gè)微生物組所含的VFG分別與脆弱擬桿菌(Bacteroidetes fragilis)和產(chǎn)氣腸桿菌(Enterobacter aerogenes)兩種細(xì)菌有親緣關(guān)系津辩。基于Spearman相關(guān)的網(wǎng)絡(luò)分析顯示，轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因和調(diào)節(jié)基因喘沿、外排泵和參與多粘菌素耐藥基因闸度、氨基糖苷類、β -內(nèi)酰胺類和大環(huán)內(nèi)酯類基因與VFGs和厚壁菌門蚜印、候選菌門莺禁、放線菌門和擬桿菌門等細(xì)菌類群之間存在共現(xiàn)模式。代謝重建宏基因組組裝基因組(MAGs)分析顯示窄赋，最常見的耐藥機(jī)制與碳青霉烯耐藥哟冬、多藥耐藥(MDR)和外排泵有關(guān)。擬桿菌是參與奶牛場瀉湖廢水中異相硝酸鹽還原(DNRA)的主要類群忆绰。這項(xiàng)研究表明浩峡，來自這些來源的廢物的傳播會增加ARG、ARB和VFG向農(nóng)業(yè)土地的傳播错敢，對土壤和人類健康產(chǎn)生負(fù)面影響翰灾。
highlight
不同菌群的細(xì)菌多樣性差異不顯著。
不同微生物組的ARGs和VFG差異顯著稚茅。
氨基糖苷類预侯、四環(huán)素類、β -內(nèi)酰胺類和大環(huán)內(nèi)酯類為主要ARGs峰锁。
耐藥機(jī)制與碳青霉烯類萎馅、耐多藥和外排泵有關(guān)。
擬桿菌涉及乳品瀉湖廢水中的脫氧核糖核酸虹蒋。
