采用生物信息學(xué)方法篩選和分析白癜風(fēng)差異表達(dá)基因【3】

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2.皮膚組織樣本收集:

2019年1 - 6月于新疆維吾爾自治區(qū)維吾爾醫(yī)醫(yī)院收集8例漢族尋常型白癜風(fēng)患者皮損及非皮損皮膚組織標(biāo)本乳怎,男1例沧卢,女7例狡逢,年齡10 ~ 25(15.25 ± 5.12)歲壤躲,發(fā)病年齡9 ~ 18(13.13 ± 2.85)歲刷后。4例為進(jìn)展期(皮損正在進(jìn)展或6個(gè)月內(nèi)出現(xiàn)新皮損)撕彤,4例為穩(wěn)定期(6個(gè)月內(nèi)皮損大小/數(shù)量未增加)须肆。4例皮損組織取自小腿虫溜,3例取自前臂游桩,1例來自頸部牲迫;8例非皮損組織均取自臀部。所有患者在納入本研究前3個(gè)月以上未接受任何全身或局部治療借卧。本研究經(jīng)新疆維吾爾自治區(qū)維吾爾醫(yī)醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)(倫理審批編號(hào):LCEC[2016]001)盹憎,所有患者均簽署了知情同意書。

3.實(shí)時(shí)定量PCR驗(yàn)證DEG mRNA的表達(dá):

使用RNAiso-Plus試劑盒[寶生物工程(大連)有限公司]提取8例白癜風(fēng)患者皮損及非皮損組織中的總RNA铐刘。采用cDNA合成試劑盒[寶生物工程(大連)有限公司]將RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA陪每。以1 μg cDNA為底物,應(yīng)用SYBR Green試劑(美國ThermoFisher Scientific公司)镰吵,在ABI 7300 Real-Time PCR系統(tǒng)(美國Applied Biosystems公司)上行實(shí)時(shí)定量PCR檢測檩禾,引物序列見表1。以甘油醛-3-磷酸脫氫酶(GAPDH)為內(nèi)參捡遍,用2-??Ct方法計(jì)算DEG mRNA的相對表達(dá)量锌订,其中?Ct=目的基因Ct值-內(nèi)參Ct值,??Ct=白癜風(fēng)組?Ct值-對照組?Ct值画株。

?

表1

實(shí)時(shí)定量PCR中引物序列

承接下一篇:采用生物信息學(xué)方法篩選和分析白癜風(fēng)差異表達(dá)基因【4】

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