初識markdown
優(yōu)雅簡潔的文本記錄體驗
之前就有關注簡述生信的帖子胃夏,進去之后轴或,首先給我的印象就是帖子的格式,我自己也會記一些筆記仰禀,模仿分級記錄照雁、加粗、插入圖片等方式答恶,但只是在word 上去自己生硬的‘造’出類似的格式饺蚊,很丑。今天進入生信星球的學習課程悬嗓,第一次了解到markdown這樣的文本記錄方式污呼,完美契合我想要的記錄筆記的感覺!謝謝花花包竹!
一些簡單的練習
直接進入網(wǎng)站鏈接吧曙求,以我最近在學習的GEO數(shù)據(jù)分析為例,首先感謝映企。
GEO再學習-GSE42872
文中詳細的介紹了如何去下載GSE數(shù)據(jù)集悟狱,以及如何去下載實驗平臺數(shù)據(jù),同時告訴我多數(shù)實驗平臺可以找到對應的R包堰氓,但其實我自也有試過一些沒有對應包的實驗平臺挤渐,走到一半就不行了。其實在進行探針名和基因名匹配時候双絮,有一下幾點問題:
- 探針和基因轉(zhuǎn)換后浴麻,許多
,應該如何去掉
- 對于將探針名和基因名匹配后得到的
囤攀,有些人需要對其進行排序软免,這個地方也是疑問,為什么需要排序焚挠,如何去排序膏萧?
- 進行匹配和,如何將探針名對應到基因表達矩陣中蝌衔,這是我最大的困惑
當然除了這個探針基因名轉(zhuǎn)換外榛泛,還有對于數(shù)據(jù)的,這個也很重要呀噩斟。
就先列舉這兩個問題吧曹锨,當然還有許多疑問,但是
飯要一口一口吃剃允,路要一步一步走
希望和豆豆沛简、花花可以學習到解決問題的辦法齐鲤。
放一段代碼吧,我的師兄說這個管道符號用的好椒楣,我還一臉懵逼给郊,管道?
mutate(genename=rownames(DEG)) %>%
dplyr::arrange(desc(logFC)) %>%
.$genename %>% .[1:50]
加油學習吧撒顿?3笞铩荚板!
配一張圖凤壁,作為結(jié)束。
學習吧