GROC-SVs安裝步驟，主要參考“SV檢測(cè)軟件使用總結(jié)”（http://www.reibang.com/p/92a35984d439）
首先按照博主的方法進(jìn)行安裝凑懂，步驟如下
conda create -n grocsvs python=2.7
source activate grocsvs
git clone https://github.com/grocsvs/grocsvs.git
cd grocsvs
#修改setup.py
pip install .
但是并未成功，一直報(bào)錯(cuò)“ImportError: No module named main”摆碉。
于是用conda安裝了python2.7
conda create -c conda-forge -y --prefix /yourpath/bin/py27
source activate /yourpath/bin/py27
conda install python=2.7.17
安裝成功之后，再次進(jìn)行g(shù)rocsvs的安裝
source activate /yourpath/bin/py27
cd /yourpath/bin/grocsvs
pip install .
但仍然報(bào)錯(cuò)“ImportError: No module named main”巷帝。查詢之后發(fā)現(xiàn)是pip的原因扫夜。
下載pip重新安裝
具體參考https://blog.csdn.net/Random_R/article/details/104824633
source activate /yourpath/bin/py27
wget https://files.pythonhosted.org/packages/11/b6/abcb525026a4be042b486df43905d6893fb04f05aac21c32c638e939e447/pip-9.0.1.tar.gz
tar -zxvf pip-9.0.1.tar.gz
cd pip-9.0.1/
python setup.py build
python setup.py install
安裝好之后，重新安裝grocsvs
cd /yourpath/bin/grocsvs
pip install .
報(bào)錯(cuò)是由于pygraphviz安裝不成功堕阔，原因可以看（http://www.reibang.com/p/92a35984d439），所以對(duì)setup.py進(jìn)行修改
cd /yourpath/bin/grocsvs
cat setup.py > setup_old.py
vim setup.py
remove pygraphviz
pip install .
至此grocsvs安裝成功超陆。
運(yùn)行
module load miniconda
source activate /yourpath/bin/py27
grocsvs grocsvs/examples/tumor_normal.configuration.json
