2020-10-25 學習小組Day3 筆記 --趙小草

如何在linux中安裝軟件

1. 什么是conda?

Conda 是一個開源的軟件包管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng),用于安裝多個版本的軟件包及其依賴關(guān)系届谈,并在它們之間輕松切換。
Conda 是為Python程序創(chuàng)建的艰山,適用于 Linux程剥,OS X 和Windows,也可以打包和分發(fā)其他軟件搂擦。

2. 下載conda(miniconda是conda的精華版)

  • 百度/谷歌搜索“miniconda 清華”(是清華的conda鏡像網(wǎng)站)
  • 找到與服務(wù)器匹配的版本(要先用uname -a 命令查看服務(wù)器是多少位的)
  • 復制下載鏈接
  • 登錄服務(wù)器哗脖,用 wget 命令 + 下載鏈接(這里不僅要粘上下載鏈接,還有路徑也要有的才避,否則就像下圖)


    錯誤的.png

    這樣才是正確的下載成功界面


    正確的.png

3. 安裝miniconda

用 bash 命令進行安裝 ,即bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh


image.png

根據(jù)提示進行首昔,每一步操作,要繼續(xù)按enter鍵巧骚,或yes或no


安裝成功.png

4. 激活conda

用source ~/.bashrc 來激活
然后命令行輸入conda巨税,出現(xiàn)滿屏的信息說明成功了


激活成功.png

5. 開始使用conda

  • 查看當前服務(wù)器上安裝的所有軟件列表 conda list
  • 搜索conda軟件 conda search fastqc
    鏡像未配置好草添,出現(xiàn)失敗
    搜索失敗.png

    重新配置鏡像,在進行搜索就可以了

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
全選復制粘貼回車

重新配置鏡像后成功搜索.png

  • 安裝軟件conda install fastqc -y

  • 卸載軟件conda remove fastqc -y

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末,一起剝皮案震驚了整個濱河市,隨后出現(xiàn)的幾起案子,更是在濱河造成了極大的恐慌驾胆,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 219,539評論 6 508
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件,死亡現(xiàn)場離奇詭異,居然都是意外死亡远搪,警方通過查閱死者的電腦和手機,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 93,594評論 3 396
  • 文/潘曉璐 我一進店門癞季,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來,“玉大人,你說我怎么就攤上這事嗜湃〖玳牛” “怎么了?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 165,871評論 0 356
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵,是天一觀的道長褒翰。 經(jīng)常有香客問我贮懈,道長,這世上最難降的妖魔是什么优训? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 58,963評論 1 295
  • 正文 為了忘掉前任朵你,我火速辦了婚禮,結(jié)果婚禮上揣非,老公的妹妹穿的比我還像新娘抡医。我一直安慰自己,他們只是感情好,可當我...
    茶點故事閱讀 67,984評論 6 393
  • 文/花漫 我一把揭開白布忌傻。 她就那樣靜靜地躺著大脉,像睡著了一般。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪水孩。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上镰矿,一...
    開封第一講書人閱讀 51,763評論 1 307
  • 那天,我揣著相機與錄音俘种,去河邊找鬼秤标。 笑死,一個胖子當著我的面吹牛宙刘,可吹牛的內(nèi)容都是我干的苍姜。 我是一名探鬼主播,決...
    沈念sama閱讀 40,468評論 3 420
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼悬包,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼衙猪!你這毒婦竟也來了?” 一聲冷哼從身側(cè)響起玉罐,我...
    開封第一講書人閱讀 39,357評論 0 276
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤屈嗤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎,沒想到半個月后吊输,有當?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體饶号,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 45,850評論 1 317
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內(nèi)容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 38,002評論 3 338
  • 正文 我和宋清朗相戀三年季蚂,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了茫船。 大學時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片。...
    茶點故事閱讀 40,144評論 1 351
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡扭屁,死狀恐怖算谈,靈堂內(nèi)的尸體忽然破棺而出,到底是詐尸還是另有隱情料滥,我是刑警寧澤然眼,帶...
    沈念sama閱讀 35,823評論 5 346
  • 正文 年R本政府宣布,位于F島的核電站葵腹,受9級特大地震影響高每,放射性物質(zhì)發(fā)生泄漏。R本人自食惡果不足惜践宴,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 41,483評論 3 331
  • 文/蒙蒙 一鲸匿、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望。 院中可真熱鬧阻肩,春花似錦带欢、人聲如沸。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 32,026評論 0 22
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽吁朦。三九已至,卻和暖如春渡贾,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間喇完,已是汗流浹背。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 33,150評論 1 272
  • 我被黑心中介騙來泰國打工剥啤, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道東北人不脯。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 48,415評論 3 373
  • 正文 我出身青樓府怯,卻偏偏與公主長得像,于是被迫代替她去往敵國和親防楷。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子牺丙,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 45,092評論 2 355