如何在linux中安裝軟件
1. 什么是conda?
Conda 是一個開源的軟件包管理系統(tǒng)和環(huán)境管理系統(tǒng),用于安裝多個版本的軟件包及其依賴關(guān)系届谈,并在它們之間輕松切換。
Conda 是為Python程序創(chuàng)建的艰山,適用于 Linux程剥,OS X 和Windows,也可以打包和分發(fā)其他軟件搂擦。
2. 下載conda(miniconda是conda的精華版)
- 百度/谷歌搜索“miniconda 清華”(是清華的conda鏡像網(wǎng)站)
- 找到與服務(wù)器匹配的版本(要先用uname -a 命令查看服務(wù)器是多少位的)
- 復制下載鏈接
登錄服務(wù)器哗脖,用 wget 命令 + 下載鏈接(這里不僅要粘上下載鏈接,還有路徑也要有的才避,否則就像下圖)
錯誤的.png
這樣才是正確的下載成功界面
正確的.png
3. 安裝miniconda
用 bash 命令進行安裝 ,即bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
image.png
根據(jù)提示進行首昔,每一步操作,要繼續(xù)按enter鍵巧骚,或yes或no
安裝成功.png
4. 激活conda
用source ~/.bashrc 來激活
然后命令行輸入conda巨税,出現(xiàn)滿屏的信息說明成功了
激活成功.png
5. 開始使用conda
- 查看當前服務(wù)器上安裝的所有軟件列表
conda list
- 搜索conda軟件
conda search fastqc
鏡像未配置好草添,出現(xiàn)失敗
搜索失敗.png
重新配置鏡像,在進行搜索就可以了
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
全選復制粘貼回車
重新配置鏡像后成功搜索.png
安裝軟件
conda install fastqc -y
卸載軟件
conda remove fastqc -y