在pyradiomics軟件的使用過(guò)程中收奔,我們經(jīng)常使用的命令是:
pyradiomics fpath.csv -o feature.csv -f csv --param exampleCT.yaml
在這個(gè)命令中给僵,fpath.csv
是記錄圖像與ROI路徑的文件,需要我們自己制作锋谐。對(duì)于不熟悉編程的pyradiomics用戶(hù)來(lái)說(shuō)遍尺,借助windows自帶的功能來(lái)制作,是最好的選擇涮拗。制作的流程如下:
- 打開(kāi)一個(gè)空白的excel表格乾戏,設(shè)置表頭分別為Image與Mask的數(shù)據(jù)列。
image.png
-
找到原始數(shù)據(jù)文件三热,1)選中所有的文件鼓择,2)拷貝所有數(shù)據(jù)的路徑(僅適用于windows10的操作系統(tǒng),win7需要就漾,選中圖像呐能,按住
shift
鍵,點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵抑堡,出現(xiàn)copy as path)摆出,3)粘貼到Image列下面。
image.png
image.png 同2的操作首妖,將ROI的文件路徑添加到Mask列下面偎漫,確保每一行與Image是一一對(duì)應(yīng)的。
image.png
- 將excel表格另存為以逗號(hào)為分割符的
.csv
文件悯搔。
image.png