【plink --epistasis】解決Error: --epistasis requires at least two cases and two controls.

plink --fast-epistasis 只能分析二分類的表型

plink --epistasis 可以分析多分類或者連續(xù)性的表型

需要準備

1馋记、將vcf文件轉(zhuǎn)換為ped、map或者bed杖剪、bim、fam文件

2、表型文件

具體參考：[https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/13813946.html]

可能會遇到報錯：

Error: --epistasis requires at least two cases and two controls.

這可能是因為表型文件和ped文件中的FID與IID沒有完全對應济瓢，表型文件與ped文件中的FID與IID完全對應之后這個問題就解決了

?著作權歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請聯(lián)系作者
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