1.MultiQC安裝
pip install multiqc
1.PNG
2.從網(wǎng)上下載fastq文件
prefetch SRR9111834
prefetch SRR6232298
3.將下載的文件轉(zhuǎn)換成fastq格式
fastq-dump --gzip --split-files SRR9111834.sra
fastq-dump --gzip --split-files SRR6232298.sra
2.PNG
4.用fastqc評(píng)價(jià)
fastqc SRR6232298_1.fastq.gz SRR6232298_2.fastq.gz SRR9111834_1.fastq.gz SRR9111834_2.fastq.gz
1.PNG
5.multiqc報(bào)告解讀
multiqc .
1.PNG
最后結(jié)果如下:
1.PNG
2.PNG
3.PNG
4.PNG
5.PNG
6.PNG
7.PNG
8.PNG
9.PNG
10.PNG
11.PNG