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是什么
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是一個(gè)基于R shiny
的網(wǎng)頁工具棚辽,能夠完成常見的統(tǒng)計(jì)分析及數(shù)據(jù)可視化款筑。
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的開發(fā)初衷
作為R
語言的重度使用者棚放,自從習(xí)慣用R
以后倦春,我就很少用那些破解版的付費(fèi)軟件蜒茄,如SPSS
梅垄、OriginLab
等厂捞。我們課題組相對(duì)比較大,總是有同學(xué)在找各種軟件的破解包來進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析或者是繪圖队丝。使用盜版(破解)軟件有些不足之處靡馁,比如說破解的版本經(jīng)常無法使用,或者說在投稿的時(shí)候因?yàn)槠平獍孳浖绊懙轿恼碌然谩O啾戎拢?code>R作為一個(gè)完全開源免費(fèi)的軟件臭墨,在生命科學(xué)領(lǐng)域正在大放異彩,囊括了從統(tǒng)計(jì)分析到數(shù)據(jù)可視化的各種功能膘盖,不乏CNS
級(jí)別的文章都使用R
進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和繪圖胧弛。但是要從頭學(xué)習(xí)一個(gè)語言是比較困難的,雖然R
的學(xué)習(xí)曲線相對(duì)來說不是很陡峭侠畔,但是對(duì)于我們農(nóng)學(xué)口的研究生來說结缚,要拿出大把的時(shí)間學(xué)習(xí)R
也是比較困難的。很感謝我的導(dǎo)師软棺,從我本科畢業(yè)開始就讓我往生信方向走红竭,從那時(shí)候開始學(xué)習(xí)R
,現(xiàn)在也快兩年半了喘落,算不上精通R
茵宪,我認(rèn)為我只是熟悉R
。在研三這個(gè)特殊的時(shí)期瘦棋,我突然決定以R shiny
為基礎(chǔ)開發(fā)一個(gè)網(wǎng)頁版工具稀火,供實(shí)驗(yàn)室的同學(xué)使用,如果能夠幫助到其他學(xué)校/研究所的同學(xué)兽狭,那我將倍感榮幸憾股。
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目前預(yù)計(jì)功能模塊有30個(gè)左右,總代碼量達(dá)到1.5~2.0W行箕慧。由于目前完全是我一個(gè)人在開發(fā)服球,臨近畢業(yè)需要寫畢業(yè)論文+做實(shí)驗(yàn),所以進(jìn)度較慢颠焦,預(yù)計(jì)一周能夠更新1-2個(gè)功能模塊斩熊;一個(gè)人開發(fā),免不了代碼不規(guī)范伐庭、代碼冗余粉渠,暫時(shí)的目標(biāo)是搭建好一個(gè)基本的可使用的框架分冈,更多細(xì)節(jié)留在后面慢慢調(diào)試。
目前
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托管在阿里云服務(wù)器上霸株,由于服務(wù)器內(nèi)存只有2G雕沉,訪問的時(shí)候加載時(shí)間大概是10秒左右,還請(qǐng)耐心等待去件。如果遇到報(bào)錯(cuò)或者是有任何的建議意見坡椒,歡迎聯(lián)系我們:
訪問Tools4You
瀏覽器訪問網(wǎng)址http://shinyapp.top:3838/Tools4You/,手機(jī)端暫不兼容尤溜。
訪問連接成功后便是如下界面:
主要分為3個(gè)大的功能模塊:
常用小工具
:分組求均值倔叼,數(shù)據(jù)正態(tài)性檢驗(yàn),方差齊性檢驗(yàn)等宫莱;統(tǒng)計(jì)&分析
:常見的統(tǒng)計(jì)分析方法丈攒;數(shù)據(jù)可視化
:生命科學(xué)研究中常見的圖形。
點(diǎn)開每個(gè)大的功能模塊下會(huì)有具體的功能模塊授霸。
t
檢驗(yàn)
使用流程:
上傳數(shù)據(jù)
:目前只支持.csv
格式文件的上傳巡验,檢驗(yàn)先下載示例數(shù)據(jù),按照示例數(shù)據(jù)的格式整理數(shù)據(jù)绝葡,然后上傳分析深碱;選擇統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的置信度
腹鹉,通常是0.99或者0.55藏畅,默認(rèn)的是0.99;下方的
單尾/雙尾
和方差相等
通常都是默認(rèn)值功咒;配對(duì)數(shù)據(jù)
:如果數(shù)據(jù)是配對(duì)的愉阎,選擇是
,否則就是默認(rèn)否
力奋;誤差棒數(shù)據(jù)
:選擇柱狀圖誤差棒是用標(biāo)準(zhǔn)誤
還是標(biāo)準(zhǔn)差
榜旦,默認(rèn)是標(biāo)準(zhǔn)差
;下載參數(shù)設(shè)置
:下載統(tǒng)計(jì)分析結(jié)果的文件格式景殷,默認(rèn)的是'Excel'文件溅呢,圖片下載格式默認(rèn)的是PDF
,下面是圖片的長(zhǎng)度和寬度設(shè)置猿挚;繪圖參數(shù)設(shè)置
:坐標(biāo)軸及圖片名稱等咐旧,需要注意的是,如果沒有輸入在那個(gè)分組上標(biāo)注顯著性绩蜻,則默認(rèn)在兩個(gè)柱子上都標(biāo)注顯著性铣墨;將所有參數(shù)設(shè)置完成后,點(diǎn)擊
點(diǎn)擊提交
即可办绝;如果需要調(diào)整某個(gè)參數(shù)伊约,則在調(diào)整完參數(shù)后再次點(diǎn)擊
點(diǎn)擊提交
姚淆;完成后下載對(duì)應(yīng)的表格結(jié)果和圖片即可。
注:展示的圖片長(zhǎng)寬和下載的圖片長(zhǎng)款是沒有關(guān)系的屡律,如果需要更進(jìn)一步的細(xì)節(jié)修改腌逢,可以使用AI
等軟件進(jìn)行調(diào)整,也可以在后續(xù)我們更新相關(guān)模塊后進(jìn)行細(xì)調(diào)整超埋。
t
檢驗(yàn)結(jié)果解讀
這是t檢驗(yàn)
的結(jié)果上忍,從左到右分別表示:分組名稱、重復(fù)數(shù)量纳本、和窍蓝、均值、標(biāo)準(zhǔn)差繁成、標(biāo)準(zhǔn)誤吓笙、P 值和顯著性。
這個(gè)是導(dǎo)出的繪圖結(jié)果巾腕,基本能用面睛。