腸道微生物在仔豬斷奶過(guò)程中扮演著非常重要的角色，微生物的紊亂可引發(fā)仔豬斷奶后腹瀉趁啸，甚至死亡督惰，因此研究仔豬的腸道微生物的組成至關(guān)重要。2022年2月16日赏胚，青歐生命科學(xué)高等研究院聯(lián)合深圳華大生命科學(xué)研究院、深圳國(guó)家基因庫(kù)以及廣東省農(nóng)科院在Microbiology Spectrum（IF: 7.1712）期刊在線發(fā)表了仔豬腸道微生物基因組的最新研究成果“A bacterial genome and culture collection of gut microbial in weanling piglet”觉阅，實(shí)現(xiàn)了對(duì)仔豬腸道微生物的基因組和功能的全面解析。
支持此項(xiàng)研究的數(shù)據(jù)已存儲(chǔ)于國(guó)家基因庫(kù)生命大數(shù)據(jù)平臺(tái)（CNGBdb）典勇，項(xiàng)目編號(hào)分別為：CNP0002075和CNP0002072?。
*上述數(shù)據(jù)為受控?cái)?shù)據(jù)割笙，如有下載需求請(qǐng)向國(guó)家基因庫(kù)數(shù)據(jù)受控中心(CDA)申請(qǐng)授權(quán)。
研究?jī)?nèi)容
該研究以42頭仔豬作為研究對(duì)象咳蔚，分別采集42份仔豬的糞便以及結(jié)腸、盲腸內(nèi)容物搔驼，采用了宏基因組學(xué)和培養(yǎng)組學(xué)技術(shù)對(duì)這些樣本中的微生物進(jìn)行了全面的宏基因組、基因組及功能解析舌涨，構(gòu)建了266株高質(zhì)量的培養(yǎng)菌參考基因組和482個(gè)宏基因組組裝基因組（MAGs）。這些基因組數(shù)據(jù)可以聚類(lèi)成482個(gè)種囊嘉，隸屬于10個(gè)門(mén)，其中包含了5個(gè)古菌基因組扭粱。
在基因水平對(duì)現(xiàn)有基因集貢獻(xiàn)了大量新的基因，并更新現(xiàn)有基因組的數(shù)據(jù)至10兆琢蛤。功能水平也進(jìn)行了全面解析蜓堕，分別在抗性基因博其、次級(jí)代謝產(chǎn)物進(jìn)行功能表征。泛基因組分析發(fā)現(xiàn)Limosilactobacillus reuteri（羅伊氏乳桿菌）的產(chǎn)Reuterin（羅伊菌素）具有菌株水平的特異性慕淡，并輔以實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證背伴。這些資源和數(shù)據(jù)對(duì)豬腸道微生物全面解析提供了重要基礎(chǔ)，也為仔豬斷奶補(bǔ)充益生菌預(yù)防腹瀉提供了重要的益生菌資源傻寂。
原文鏈接：
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.02417-21
參考文獻(xiàn)：
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信息及圖片來(lái)源：“青歐生命科學(xué)高等研究院”公眾號(hào)
