《水形物語》故事發(fā)生冷戰(zhàn)期間，啞女艾麗莎在政府實驗室里工作，是那里的一名清潔女工难述。一天在實驗室里送來了個特別的試驗體....
獨自生活
艾麗莎早上起來洗漱萤晴、做早飯、到隔壁畫家朋友看望他胁后，之后獨自坐大巴到實驗室上班店读、下班。每天如此日復(fù)一日的生活著....
一天在實驗室迎來了一件神秘的實驗體——被裝在水缸里的生物攀芯。
它之前一直生活在亞馬孫一帶屯断、被當(dāng)?shù)氐耐林暈樯衩鳌５潜幻绹能婈牥l(fā)現(xiàn)侣诺，由警衛(wèi)護送到實驗室殖演。做為研究對象。
邂逅
過幾天后年鸳，突然實驗室的警報響起趴久，一名警衛(wèi)受傷、滿手是血的走出實驗室搔确。艾麗莎和他的朋友塞爾達(dá)被安排去實驗室打掃衛(wèi)生——清除滿地的血跡彼棍。
在發(fā)現(xiàn)警衛(wèi)斷了的手指后，塞爾達(dá)去見負(fù)責(zé)人妥箕。此時獨自留在實驗室的艾麗莎發(fā)現(xiàn)滥酥，之前的大水罐。里面慢慢的出現(xiàn)了個人形的生物畦幢。
相互試探
發(fā)現(xiàn)它后艾麗莎在每天的日常中加入了一個活動——在每天中午一個人偷偷來實驗室和它一起吃飯坎吻。
第一次開它帶來了白水煮蛋。艾麗莎用勺子敲打著雞蛋宇葱、將雞蛋剝好放在水池旁瘦真。
它聽見聲音慢慢浮出水面、試探性的接近黍瞧。最后抓起雞蛋诸尽，潛入水中。
之后艾麗莎又給它帶來了雞蛋印颤。并在他們均不懼怕對方的前提下您机，教會它用手語表達(dá)雞蛋。
如此年局，每天艾麗莎來實驗室陪著它际看。吃飯、聽音樂(艾麗莎偷偷將留聲機帶到實驗室)矢否。
噩耗
在兩人漸漸熟識中仲闽、日子一天天過去。
這時政府方的一位將軍出面僵朗、提出要將該生物解刨用于科學(xué)研究赖欣。
聽到消息的艾麗莎屑彻，慌忙回家，跑到隔壁畫家處顶吮，希望他能協(xié)助自己社牲，將生物救出來。畫家起初是不愿意冒險的悴了，但在艾麗莎的勸說膳沽、又因為畫家在生活中屢屢受挫意識到自己的朋友，畫家決定為艾麗莎鋌而走險让禀。
在一旁默默觀察艾麗莎和它之間互動的研究員，在得到解刨的消息時陨界，是極力反對的巡揍，在反對無效的情況下，研究員決定制造混亂菌瘪，趁著混亂將生物注射死亡腮敌。
拯救獨自生活的它
到了執(zhí)行解刨那天，艾麗莎和畫家實施計劃著將生物救出俏扩。
本打算將生物注射死亡的研究員糜工、不知情的清潔員塞爾達(dá)發(fā)現(xiàn)艾麗莎的計劃后幫助他們逃離實驗室。
艾麗莎將它帶回家中录淡。查了放生的地點和時間捌木。
在等待放生的日子里，艾麗莎和它每日相處嫉戚。得知他具有神奇的治愈能力刨裆，它用水摸過畫家的傷口，傷口治愈了彬檀、它的手在畫家頭上停留帆啃，畫家重新長出頭發(fā)。
兩人的心逐漸靠近窍帝。
別離
在生物被救走后努潘，實驗室專門負(fù)責(zé)它的警衛(wèi)，被將軍要求抓回生物坤学，以此來補救自己的過失疯坤。
警衛(wèi)在壓力下瘋狂的尋找。
日子一天天的接近放生的日期拥峦。眼看著生物身體逐漸衰弱贴膘。到了放生的日子，艾麗莎和畫家一同將生物送到放生的碼頭略号。
也是在今天刑峡，警衛(wèi)找到了知道了艾麗莎救走了生物洋闽、并在艾麗莎的住所得知生物將會被放走，警衛(wèi)急忙趕往碼頭突梦。
艾麗莎在和它告別诫舅，艾麗莎沒辦法在水下生活，只能他自己回到水下宫患。就在這當(dāng)下刊懈，一聲槍響，生物應(yīng)聲倒下娃闲。
警衛(wèi)找到他們開槍射殺了它虚汛、艾麗莎隨后也中了一槍倒下。畫家看到此景皇帮，乘警衛(wèi)不備將其敲暈卷哩。這是生物身上中彈的地方自動愈合。它將警衛(wèi)打倒后属拾。抱著艾麗莎一同跳入水里将谊。
在水下，它吻了艾麗莎渐白。它用自己神奇的治愈力尊浓，將艾麗莎脖子上的三道傷疤變成水下可以呼吸的鰓。
兩人纯衍，在水下一同生活栋齿，離開了帶給他們傷害的現(xiàn)實生活。
兩顆在現(xiàn)實生活中倍受排擠襟诸、在實驗室的接觸褒颈。兩顆孤獨又善良的逐步認(rèn)識、靠近励堡。相互依偎取暖谷丸。
