病毒正二十面體對稱結(jié)構(gòu):病毒學(xué)常見概念 I

我對病毒學(xué)的喜愛,受先生影響忧换。雖拜先生門下恬惯,但這些年與先生相處時間并不多。有時匆匆見一面亚茬,先生無意間提及的一個病毒學(xué)概念酪耳,我都會花不少時間去查閱資料,以加深印象刹缝。正如今天我要談的病毒正二十面體對稱結(jié)構(gòu)碗暗,大概是8年前無意間聽先生提及的。

正如我在簡書的前文《病毒的形態(tài)是啥樣子梢夯?》中提到的言疗,“微觀的病毒世界形態(tài)各異、光怪陸離”颂砸。而病毒的正二十面體對稱結(jié)構(gòu)是占比最高的結(jié)構(gòu)噪奄,具有這種結(jié)構(gòu)的病毒死姚,典型的有細(xì)小病毒、圓環(huán)病毒勤篮、星狀病毒都毒、杯狀病毒、小RNA病毒等等碰缔;而看似不是正二十面體對稱账劲,但實際卻是的病毒有腺病毒、非洲豬瘟病毒手负、黃病毒涤垫、皰疹病毒等等。

正二十面體對稱結(jié)構(gòu)竟终,有些人會誤認(rèn)為是正二十面體蝠猬。實際上,“正二十面體對稱結(jié)構(gòu)”和“正二十面體”是不同概念统捶。我們只能說病毒是正二十面體對稱榆芦,而不能說是正二十面體。我認(rèn)為喘鸟,“正二十面體對稱”概念的提出匆绣,可能也僅僅是將病毒的空間結(jié)構(gòu)模型化而已。

空間幾何里什黑,正二十面體有12個頂點崎淳,每個頂點有五個平面匯集而成,而每個平面又有多個(或一個)亞單位構(gòu)成愕把,我們認(rèn)為有幾個亞單位拣凹,病毒的T值就是幾。這樣就引出了一個非常重要的概念恨豁,即T值嚣镜,T就是triangulation,病毒結(jié)構(gòu)越復(fù)雜橘蜜,T值越大菊匿,病毒看起來就越像一個球形。例如计福,圓環(huán)病毒的T值僅為1跌捆,而皰疹病毒的T值為16。病毒蛋白的亞單位個數(shù) = T值×60象颖,例如圓環(huán)病毒的衣殼亞單位個數(shù)為1×60 = 60佩厚;口蹄病病毒的衣殼亞單位個數(shù)為3×60 = 180。這里還有一個概念力麸,就是假T值可款,例如口蹄疫病毒,因為雖然口蹄疫病毒的T值是3克蚂,但這個3是由VP1, VP2和VP3三個不同的蛋白構(gòu)成的闺鲸,因此稱之為假T值。

以上提及到比較簡單的病毒埃叭,如細(xì)小病毒摸恍、圓環(huán)病毒、星狀病毒赤屋、杯狀病毒立镶,其本身看起來就是一個正二十面體對稱結(jié)構(gòu)。但是復(fù)雜一些的正二十面體對稱結(jié)構(gòu)病毒类早,最外層實際上包裹著脂質(zhì)囊膜(如黃病毒媚媒、非洲豬瘟病毒、皰疹病毒等)或是由多個正二十面體層組成(如呼腸孤病毒)涩僻。

病毒經(jīng)過若干年的進(jìn)化缭召,一定是朝著結(jié)構(gòu)更穩(wěn)定的方向進(jìn)化。正二十面體對稱結(jié)構(gòu)恰好是結(jié)構(gòu)學(xué)比較穩(wěn)定的一種形態(tài)逆日,這種形態(tài)能夠更好地保護(hù)核酸基因組嵌巷。當(dāng)然了,另一大類病毒結(jié)構(gòu)室抽,即螺旋對稱結(jié)構(gòu)搪哪,也有類似作用,我們以后找機(jī)會討論坪圾。

我不是杰出的病毒學(xué)家晓折,也沒發(fā)表過驚艷的病毒學(xué)論文。但神年,這并不代表我不熱愛病毒學(xué)已维。2020-03-26

F. Liu

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