軟件文獻https://academic.oup.com/jhered/article/90/4/502/860820
下載直接安裝即可,最新版本version 1.2.02 (16.II.1999),不知道有沒有其他較新軟件可用改化,或者軟件只是基于某個基礎理論供試進行計算的軟件潜沦。
軟件支持GENEPOP 格式
使用Genalex 可將Genalex可讀格式轉(zhuǎn)換為GENEPOP 格式,使用Genalex導出
add date file 導入轉(zhuǎn)換后GENEPOP 格式晒奕,選擇變異模型 闻书,Go 即可
由于SSR位點的數(shù)量及數(shù)量限制選擇不同的 mutation model,
少于20個位點使用 Wilcoxon’s test is the most appropriate
and powerful.
使用TPM
For most mi-crosatellites, the
TPM
(two-phase model)is apparently even more appropriate than
the
SMM
When using microsatellites we recom-
mend the TPM with 95% single-step mu-
tations and 5% multiple-step mutations
不知道對不同突變模型的中文是什么。
SMM one-step stepwise mutation model 逐步突變模型脑慧,或單步突變模型
IAM: infinite allele model 無限等位基因模型魄眉, 或
以下論文
[1]楊勝林,徐龍鑫,楊海兵,李愛萍.中國5個矮馬品種的瓶頸效應分析[J].中國畜牧獸醫(yī),2013,40(01):140-144.
位點多余20 使用 standardized differences test
少于20 使用 Wilcoxon’s test
現(xiàn)在是理解結果文件,結果文件是按不同群體進行劃分內(nèi)容的,一個群體一部分闷袒,群體內(nèi)計算的是不同TEST下的不同模型的一些情況