上一篇文章【懶人必備】批量完成均值和SD計(jì)算，并以mean±SD的格式批量導(dǎo)出到EXCEL推出后璃搜，有小伙伴希望可以在最后一列增加p值輸出拖吼。
改進(jìn)后的代碼
注意事項(xiàng)
- 本代碼用的是OneWay ANOVA的統(tǒng)計(jì)方法,別的統(tǒng)計(jì)方法需要改代碼
- 由于在樣本量較少的情況下，OneWay ANOVA對(duì)正態(tài)性和方差齊性都不是特別敏感这吻，因此這個(gè)代碼中沒(méi)有做這兩步檢驗(yàn)吊档，直接做了ANOVA
- 目前的代碼沒(méi)有做事后檢驗(yàn)，如果需要事后檢驗(yàn)唾糯，并且批量在各個(gè)數(shù)據(jù)上顯示上標(biāo)字母的話怠硼，請(qǐng)留言
數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
數(shù)據(jù)準(zhǔn)備方式和【懶人必備】批量完成均值和SD計(jì)算，并以mean±SD的格式批量導(dǎo)出到EXCEL中一樣
| group | BW | SGR | CAT | SOD |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 4 | 1.2 | 21 | 2.2 |
| 1 | 5 | 1.4 | 22 | 2.3 |
| 1 | 6 | 1.5 | 23 | 2.5 |
| 2 | 14 | 2.2 | 33 | 3.5 |
| 2 | 15 | 2.4 | 34 | 3.6 |
| 2 | 16 | 2.5 | 35 | 3.7 |
| 3 | 24 | 3.2 | 43 | 4.4 |
| 3 | 25 | 3.4 | 33 | 4.6 |
| 3 | 26 | 3.5 | 45 | 4.8 |
R代碼
#############################################
##
## 批量求均值和SD
##
##-----------------------------------------
## Author : Cdudu
## Data : 2019 8/14
############################################
library(readxl)
# 讀入需要統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù)表
dat<-read_excel('Data.xls')
dat$group<-as.factor(dat$group) #將group轉(zhuǎn)化為因子型移怯，否則會(huì)影響統(tǒng)計(jì)結(jié)果
summary(dat)
# 創(chuàng)建新表用于存放Mean香璃，SD和P值，此處as.character()中向量長(zhǎng)度由組數(shù)決定舟误，
# 例如上表共三組葡秒，再加上p值，需要4行嵌溢，就輸入as.character(1:4)
dat2<-data.frame(t1=as.character(1:4))
for ( i in c(2:5)){ #此處向量根據(jù)應(yīng)變量的列數(shù)決定眯牧，上表應(yīng)變量在2-5列，因此輸入c(2:5)
means<-tapply(dat[[i]],dat$group,mean)
means<-sprintf('%.2f',round(means,2)) #改變數(shù)字可以改變Mean的小數(shù)點(diǎn)位數(shù)
SD<-tapply(dat[[i]],dat$group,sd)
SD<-sprintf('%.2f',round(SD,2)) #改變數(shù)字可以改變SD的小數(shù)點(diǎn)位數(shù)
a<-paste(means,'±',SD)
M.aov<-aov(dat[[i]]~group,data=dat)
aov.sum<-summary(M.aov)
pvalue<-aov.sum[[1]]$`Pr(>F)`[1]
if(pvalue>0.05){a[4]<-'NS'} #a[]中的數(shù)字根據(jù)組數(shù)決定赖草，組數(shù)+1
else if(pvalue>0.01){a[4]<-'*'}
else {a[4]<-'**'}
dat2[i-1]<-a
names(dat2)[i-1]<-names(dat[,i])
}
dat3<-t(dat2) #行列轉(zhuǎn)置
write.csv(dat3,'Mean&SD.csv')
以上就是全部代碼学少，實(shí)際操作中只需要三步操作
1.在創(chuàng)建dat2時(shí)，確定dat2的行數(shù)為處理組數(shù)量+1
dat2<-data.frame(t1=as.character(1:4))
2.在for循環(huán)開(kāi)頭秧骑，輸入應(yīng)變量數(shù)量
for ( i in c(2:5)){
- 在if語(yǔ)句中版确，確定p值在向量a中的存放位置，也就是處理組數(shù)量+1
if(pvalue>0.05){a[4]<-'NS'} #a[]中的數(shù)字根據(jù)組數(shù)決定乎折，組數(shù)+1
else if(pvalue>0.01){a[4]<-'*'}
else {a[4]<-'**'}
結(jié)果展示
如果最后是將dat3輸出到EXCEL绒疗，那么表格如下
| NULL | V1 | V2 | V3 | V4 |
|---|---|---|---|---|
| BW | 3±0.2 | 4±0.3 | 5±0.4 | * |
| SGR | 3±0.2 | 3±0.2 | 3±0.2 | NS |
| CAT | 3±0.2 | 3±0.2 | 3±0.2 | ** |
| SOD | 3±0.2 | 3±0.2 | 3±0.2 | NS |
V1;V2;V3即是3個(gè)試驗(yàn)組，V4是p值展示笆檀，里面的數(shù)值是我瞎編的忌堂。
- NS：p>0.05
- *: 0.05>p>0.01
- **: p<0.01
當(dāng)然也可以將dat2輸出到EXCEL，那么表格如下
| NULL | BW | SGR | CAT | SOD |
|---|---|---|---|---|
| V1 | 3±0.2 | 3±0.2 | 3±0.2 | 3±0.2 |
| V2 | 3±0.2 | 3±0.2 | 3±0.2 | 3±0.2 |
| V3 | 3±0.2 | 3±0.2 | 3±0.2 | 3±0.2 |
| V4 | NS | * | ** | NS |
