一蹈矮、GDC Data Transfer Tool下載
- GDC Data Transfer Tool是TCGA官方基于python開發(fā)的下載程序，在TCGA官網(wǎng)GDC部分可以找到：https://portal.gdc.cancer.gov
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根據(jù)自己的操作系統(tǒng)下載
二灶轰、運(yùn)行GDC Data Transfer Tool（Windows操作系統(tǒng)）
- 將下載下來的壓縮包進(jìn)行解壓縮冤荆，得到gdc-client.exe辽话。將MANIFEST.txt文件和gdc-client.exe放在一個文件夾下扔役。
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在該文件夾空白處帆喇，點(diǎn)擊鼠標(biāo)右鍵同時按鍵盤的shift鍵
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點(diǎn)擊 在此處打開命令窗口，進(jìn)入終端
- 輸入gdc-client download -m MANIFEST.txt （注：-m 后加的是下載好的manifest文件亿胸，需要改成自己的文件名坯钦。還可以在后方加--latest，表示最新文件數(shù)據(jù)侈玄，下載臨床數(shù)據(jù)的時候比較方便）,按Enter鍵葫笼，開始下載。
gdc-client download -m MANIFEST.txt
#or
gdc-client download -m MANIFEST.txt --latest
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開始下載的界面：
- 有時候網(wǎng)絡(luò)不好下載會中斷拗馒，可以重新進(jìn)入終端輸入相同命令，該程序支持?jǐn)帱c(diǎn)下載溯街，會繼續(xù)從下載中斷的地方往后下載诱桂。
