c3d數(shù)據(jù)處理

使用的編程語言和包

編程語言:python
庫:ezc3d
數(shù)據(jù)集:CMU Graphics Lab Motion Capture Database

ezc3d

ezc3d支持c++贴谎,python汞扎,matlab,并且跨平臺擅这,支持windows澈魄、linux和mac,windows和linux上支持直接用anaconda安裝也支持手動編譯仲翎,mac只支持手動編譯痹扇,我win10上安裝了anaconda,所以以下對數(shù)據(jù)的處理我都是在win10上進行的溯香。

數(shù)據(jù)集

在cmu的運動捕捉數(shù)據(jù)網(wǎng)站的FAQs標簽頁下可以直接下載到數(shù)據(jù)庫中所有的打包好的c3d格式的數(shù)據(jù)帘营。

c3d數(shù)據(jù)處理

  1. 導入ezc3d
    from ezc3d import c3d
  2. 讀取文件
    path ='D:\\Work\\c3d_dataset\\allc3d_56789\\subjects\\89\\89_06.c3d'
    c = c3d(path)
  3. 獲取c3d文件中的參數(shù)
    print(c['parameters']['POINT'])
    以下為輸出結果
    {'USED': {'type': 2, 'description': '', 'value': (42,)}, 'TYPE': {'type': 2, 'description': '', 'value': ()}, 'ZERO': {'type': 2, 'description': '', 'value': (1, 0)}, 'CORNERS': {'type': 4, 'description': '', 'value': ()}, 'ORIGIN': {'type': 4, 'description': '', 'value': ()}, 'CHANNEL': {'type': 2, 'description': '', 'value': ()}, 'CAL_MATRIX': {'type': 4, 'description': '', 'value': ()}, 'FRAMES': {'type': 2, 'description': '', 'value': (2751,)}, 'DATA_START': {'type': 2, 'description': '', 'value': (13,)}, 'SCALE': {'type': 4, 'description': '', 'value': (-0.05000000074505806,)}, 'RATE': {'type': 4, 'description': '', 'value': (120.0,)}, 'MOVIE_DELAY': {'type': 4, 'description': '', 'value': (1.5390000343322754,)}, 'X_SCREEN': {'type': -1, 'description': '', 'value': ['+X']}, 'Y_SCREEN': {'type': -1, 'description': '', 'value': ['+Z']}, 'UNITS': {'type': -1, 'description': '', 'value': ['mm']}, 'ANGLE_UNITS': {'type': -1, 'description': '', 'value': ['deg']}, 'SCALAR_UNITS': {'type': -1, 'description': '', 'value': ['mm']}, 'TYPE_GROUPS': {'type': -1, 'description': '', 'value': []}, 'LABELS': {'type': -1, 'description': '', 'value': ['LBWT', 'RBWT', 'LFWT', 'LTHI', 'RFRM', 'RTHI', 'RWRB', 'RWRA', 'STRN', 'T10', 'RFIN', 'RUPA', 'LKNE', 'RKNE', 'LUPA', 'CLAV', 'LELB', 'RSHO', 'LFRM', 'LSHN', 'RSHN', 'LBHD', 'LFHD', 'RBHD', 'RFHD', 'RANK', 'LANK', 'RHEE', 'LHEE', 'LTOE', 'RTOE', 'LMT5', 'RMT5', 'RFWT', 'RELB', 'RBAC', 'LSHO', 'C7', 'LWRA', 'LFIN', 'LWRB', 'RBAC-1']}, 'DESCRIPTIONS': {'type': -1, 'description': '', 'value': ['Left back waist', 'Right back waist', 'Left front waist', 'Left thigh', 'Right forearm', 'Right Thigh', 'Right wrist bar pinkie side', 'Right wrist bar thumb side', 'Sternum', 'Upper back', 'Right hand', 'Right upper arm', 'Left knee', 'Right knee', 'Left upper arm', 'Clavicle', 'Left elbow', 'Right shoulder', 'Left forearm', 'Left shin', 'Right shin offset', 'Left back head', 'Left front head', 'Right back head', 'Right front head', 'Right ankle', 'Left ankle', 'Right heel', 'Left heel', 'Left toe', 'Right toe', 'Left metatarsal five', 'Right metatarsal five', 'Right front waist', 'Right elbow', 'Right back offset marker', 'Left shoulder', 'Back of neck', 'Left wrist bar thumb side', 'Left hand', 'Left wrist bar pinkie side', 'Unknown']}}
    可以看到c['parameters']['POINT']為字典,里面存儲了使用的點數(shù)(USED),幀速率(RATE),幀數(shù)(FRAMES),縮放因子(SCALE),運動捕捉關節(jié)點的名稱(LABELS)逐哈,對關節(jié)點的描述(DESCRIPTIONS)等。

獲取c3d文件的坐標點

point_data = c['data']['points']
point_data的shape為4xNxT问顷,4的前三維存儲xyz坐標昂秃,N表示關節(jié)點點數(shù),T為幀數(shù)杜窄。
可以通過以下代碼獲取第k幀的x肠骆、y、z坐標
frame = point_data[:,:,k]
x = frame[0,:] y = frame[1,:] z = frame[2,:]

繪制關節(jié)點和關節(jié)點連線

x塞耕、y蚀腿、z中是按照c3d參數(shù)中關節(jié)點標簽存儲的對應的關節(jié)點坐標,我們可以通過下圖中的標注確定關節(jié)點之間的連線扫外。


c3dskelonid.PNG
  1. 首先導入用到的庫
    import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
    在jupyter notebook中使用%matplotlib notebook可繪制可交互的圖形

  2. 創(chuàng)建3d figure
    fig = plt.figure()
    ax = fig.gca(projection='3d')

  3. 繪制關節(jié)點及連線
    ax.scatter(x,y,z)
    在本文中只繪制了幾個關節(jié)點的連線莉钙,道理都是一樣的。由于每個文件中存儲關節(jié)點的順序不一定相同筛谚,因此使用關節(jié)點的label進行索引磁玉。
    首先將用到的關節(jié)點和它們在文件中存儲的序號存成字典格式

    used_label = {"RFHD":0, "LFHD":0, "CLAV":0,"STRN":0 }
    label_keys = used_label.keys()
    labels = c1['parameters']['POINT']['LABELS']['value']
    for label in label_keys:
        index = [i for i,x in enumerate(labels) if x.find(label)!=-1]
        used_label[label] = index [0]
    

存儲連線的關節(jié)點標簽并繪制連線

stick_difines_f_head=[
    (used_label['CLAV'],used_label['STRN']),
    (used_label['RFHD'],used_label['CLAV']),
    (used_label['CLAV'],used_label['LFHD'])
]
for i in stick_difines_f_head:
    xx = [x[i[0]],x[i[1]]]
    yy = [y[i[0]],y[i[1]]]
    zz = [z[i[0]],z[i[1]]]
    ax.plot(xx,yy,zz,c='r')

設置坐標軸刻度、xyz軸的比例進行顯示

my_y_ticks = np.arange(0, 1000, 200)
my_z_ticks = np.arange(0, 2000, 200)
ax.set_yticks(my_y_ticks)
ax.set_zticks(my_z_ticks)
ax.get_proj = lambda: np.dot(Axes3D.get_proj(ax), np.diag([0.5, 0.5, 1, 1]))
plt.show()

效果如圖驾讲,這張圖我基本把點都連了蚊伞,但是展示的代碼只畫了幾個點和線


骨骼結構.PNG
?著作權歸作者所有,轉載或內容合作請聯(lián)系作者
  • 序言:七十年代末席赂,一起剝皮案震驚了整個濱河市,隨后出現(xiàn)的幾起案子时迫,更是在濱河造成了極大的恐慌颅停,老刑警劉巖,帶你破解...
    沈念sama閱讀 217,734評論 6 505
  • 序言:濱河連續(xù)發(fā)生了三起死亡事件掠拳,死亡現(xiàn)場離奇詭異癞揉,居然都是意外死亡,警方通過查閱死者的電腦和手機碳想,發(fā)現(xiàn)死者居然都...
    沈念sama閱讀 92,931評論 3 394
  • 文/潘曉璐 我一進店門烧董,熙熙樓的掌柜王于貴愁眉苦臉地迎上來,“玉大人胧奔,你說我怎么就攤上這事逊移。” “怎么了龙填?”我有些...
    開封第一講書人閱讀 164,133評論 0 354
  • 文/不壞的土叔 我叫張陵胳泉,是天一觀的道長。 經(jīng)常有香客問我岩遗,道長扇商,這世上最難降的妖魔是什么? 我笑而不...
    開封第一講書人閱讀 58,532評論 1 293
  • 正文 為了忘掉前任宿礁,我火速辦了婚禮案铺,結果婚禮上宿亡,老公的妹妹穿的比我還像新娘铅碍。我一直安慰自己抄瓦,他們只是感情好晴埂,可當我...
    茶點故事閱讀 67,585評論 6 392
  • 文/花漫 我一把揭開白布笆搓。 她就那樣靜靜地躺著挫剑,像睡著了一般鸠蚪。 火紅的嫁衣襯著肌膚如雪肠阱。 梳的紋絲不亂的頭發(fā)上测僵,一...
    開封第一講書人閱讀 51,462評論 1 302
  • 那天街佑,我揣著相機與錄音,去河邊找鬼捍靠。 笑死沐旨,一個胖子當著我的面吹牛,可吹牛的內容都是我干的榨婆。 我是一名探鬼主播希俩,決...
    沈念sama閱讀 40,262評論 3 418
  • 文/蒼蘭香墨 我猛地睜開眼,長吁一口氣:“原來是場噩夢啊……” “哼纲辽!你這毒婦竟也來了颜武?” 一聲冷哼從身側響起璃搜,我...
    開封第一講書人閱讀 39,153評論 0 276
  • 序言:老撾萬榮一對情侶失蹤,失蹤者是張志新(化名)和其女友劉穎鳞上,沒想到半個月后这吻,有當?shù)厝嗽跇淞掷锇l(fā)現(xiàn)了一具尸體,經(jīng)...
    沈念sama閱讀 45,587評論 1 314
  • 正文 獨居荒郊野嶺守林人離奇死亡篙议,尸身上長有42處帶血的膿包…… 初始之章·張勛 以下內容為張勛視角 年9月15日...
    茶點故事閱讀 37,792評論 3 336
  • 正文 我和宋清朗相戀三年唾糯,在試婚紗的時候發(fā)現(xiàn)自己被綠了。 大學時的朋友給我發(fā)了我未婚夫和他白月光在一起吃飯的照片鬼贱。...
    茶點故事閱讀 39,919評論 1 348
  • 序言:一個原本活蹦亂跳的男人離奇死亡移怯,死狀恐怖,靈堂內的尸體忽然破棺而出这难,到底是詐尸還是另有隱情舟误,我是刑警寧澤,帶...
    沈念sama閱讀 35,635評論 5 345
  • 正文 年R本政府宣布姻乓,位于F島的核電站嵌溢,受9級特大地震影響,放射性物質發(fā)生泄漏蹋岩。R本人自食惡果不足惜赖草,卻給世界環(huán)境...
    茶點故事閱讀 41,237評論 3 329
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一處隱蔽的房頂上張望剪个。 院中可真熱鬧秧骑,春花似錦、人聲如沸扣囊。這莊子的主人今日做“春日...
    開封第一講書人閱讀 31,855評論 0 22
  • 文/蒼蘭香墨 我抬頭看了看天上的太陽如暖。三九已至,卻和暖如春忌堂,著一層夾襖步出監(jiān)牢的瞬間盒至,已是汗流浹背。 一陣腳步聲響...
    開封第一講書人閱讀 32,983評論 1 269
  • 我被黑心中介騙來泰國打工士修, 沒想到剛下飛機就差點兒被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留枷遂,地道東北人。 一個月前我還...
    沈念sama閱讀 48,048評論 3 370
  • 正文 我出身青樓棋嘲,卻偏偏與公主長得像酒唉,于是被迫代替她去往敵國和親。 傳聞我的和親對象是個殘疾皇子沸移,可洞房花燭夜當晚...
    茶點故事閱讀 44,864評論 2 354

推薦閱讀更多精彩內容