2017年6月，由北京邦菲生物科技有限公司（簡(jiǎn)稱“邦菲生物”）勉吻、北京聚道科技有限公司（GeneDock）、中科院計(jì)算所pFind團(tuán)隊(duì)聯(lián)合研發(fā)的“邦菲云”在線分析平臺(tái)正式投入使用程梦。
“邦菲云” 是國(guó)內(nèi)首家蛋白質(zhì)組學(xué)在線分析平臺(tái)熊锭。 “邦菲云”在線分析平臺(tái)經(jīng)過(guò)大量項(xiàng)目檢驗(yàn)和測(cè)試，運(yùn)行穩(wěn)定可靠礁遣，用戶可根據(jù)自己的需求設(shè)置流程參數(shù)斑芜，基本分析參數(shù)設(shè)置透明化。平臺(tái)支持多樣化的分析類(lèi)型祟霍，滿足文章撰寫(xiě)杏头、生物學(xué)問(wèn)題解釋等各種需求。
“邦菲云”在線分析平臺(tái)特點(diǎn)：
國(guó)內(nèi)首個(gè)具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的蛋白質(zhì)定性定量分析平臺(tái)
“邦菲云”整合了中科院計(jì)算所pFind團(tuán)隊(duì)研發(fā)的具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的蛋白質(zhì)定性定量分析平臺(tái)pFind Studio浅碾，支持來(lái)自Thermo大州，AB Sciex等不同廠商的質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)格式，一鍵式完成蛋白組數(shù)據(jù)定性和定量分析垂谢。和傳統(tǒng)搜庫(kù)軟件相比較厦画，pFind軟件搜索速度更快，鑒定蛋白數(shù)更多滥朱。
可視化界面根暑，生信零基礎(chǔ)操作
“邦菲云”在線分析平臺(tái)平臺(tái)基于SaaS模式架構(gòu)，支持Web端圖形化操作方式徙邻，通過(guò)提供高性能的標(biāo)準(zhǔn)化蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程排嫌，生信零基礎(chǔ)人員亦可便捷地進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析工作，讓數(shù)據(jù)分析脫離“專業(yè)高門(mén)檻”缰犁，更加“大眾化”淳地；用戶可以更加專注于深入解讀數(shù)據(jù)，快速獲得目標(biāo)信息帅容；
目前“邦菲云”已經(jīng)搭建了數(shù)十個(gè)工作流颇象，用戶除了可以完成常規(guī)的差異表達(dá)蛋白篩選，聚類(lèi)分析并徘、功能注釋遣钳、GO富集分析、KEGG富集以外麦乞，我們提供了針對(duì)iTRAQ和LabelFree數(shù)據(jù)的一鍵式打包分析工作流蕴茴，客戶可以將傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)分析流程從原來(lái)幾天壓縮到現(xiàn)在的30 分鐘。
“多快好省”
基于云計(jì)算場(chǎng)景姐直，“邦菲云”對(duì)分析流程和計(jì)算資源調(diào)度進(jìn)行了大量?jī)?yōu)化和改進(jìn)倦淀。利用GeneDock提供的生信云基礎(chǔ)架構(gòu)，“邦菲云” 上的蛋白組數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化分析服務(wù)達(dá)到了行業(yè)領(lǐng)先水平声畏，可以低成本高效率地完成大批量蛋白組數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)分析撞叽。
“邦菲云”運(yùn)用了先進(jìn)的分布式計(jì)算技術(shù)，并且針對(duì)蛋白組分析流程進(jìn)行了算法級(jí)優(yōu)化，使得LabelFree樣品從搜庫(kù)到后續(xù)功能分析注釋全過(guò)程在1小時(shí)內(nèi)即可完成能扒。借助GeneDock提供的生信云計(jì)算資源，用戶可以同時(shí)在“邦菲云”平臺(tái)上對(duì)100個(gè)樣本同時(shí)進(jìn)行分析處理辫狼，且僅需承擔(dān)實(shí)際資源耗費(fèi)成本初斑，而無(wú)需再投入硬件和運(yùn)維資源。
目前膨处，“邦菲云”平臺(tái)可以支持約100個(gè)樣本數(shù)據(jù)的并行處理见秤，并可在1個(gè)小時(shí)內(nèi)完成一個(gè)LabelFree樣品從搜庫(kù)到后續(xù)功能分析注釋全過(guò)程。
邦菲生物真椿、GeneDock和pFind團(tuán)隊(duì)在“邦菲云”在線分析平臺(tái)上的合作鹃答，是一次史無(wú)前例的革命性探索！“邦菲云”的誕生更是蛋白質(zhì)組學(xué)行業(yè)的一次里程碑式的創(chuàng)新突硝！以往從沒(méi)有任何一家分析平臺(tái)是專門(mén)針對(duì)蛋白質(zhì)組學(xué)的测摔，“邦菲云”就是為蛋白質(zhì)組學(xué)量身定做的分析平臺(tái)，讓從事蛋白質(zhì)組學(xué)研究的工作者找到了“家”解恰，也為想了解但又被“專業(yè)門(mén)檻“拒之門(mén)外的研究人員打開(kāi)了一扇窗锋八！
關(guān)于邦菲生物
邦菲生物科技有限公司成立于2013年，是一家專業(yè)從事蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)的公司护盈。邦菲生物有自己的研發(fā)團(tuán)隊(duì)和數(shù)據(jù)分析中心挟纱，在生命科學(xué)、農(nóng)林腐宋、水產(chǎn)和醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域?qū)τ诘鞍踪|(zhì)組學(xué)有著豐富的經(jīng)驗(yàn)和積累紊服。同時(shí)其核心團(tuán)隊(duì)成員全部來(lái)源于 Thermo 定制服務(wù)部，在技術(shù)服務(wù)領(lǐng)域有著十余年專業(yè)經(jīng)驗(yàn)和成熟的運(yùn)作模式胸竞。
關(guān)于GeneDock
GeneDock成立于2014年欺嗤，致力于用組學(xué)數(shù)據(jù)技術(shù)，為合作伙伴提供臨床智能決策支持撤师、多中心臨床實(shí)驗(yàn)剂府、組學(xué)科研協(xié)作、工業(yè)生信計(jì)算生產(chǎn)等場(chǎng)景的技術(shù)方案剃盾，支持科研單位腺占、企業(yè)、醫(yī)院等提高組學(xué)數(shù)據(jù)管理應(yīng)用效率痒谴，挖掘組學(xué)數(shù)據(jù)價(jià)值衰伯。通過(guò)滿足不同場(chǎng)景的實(shí)際應(yīng)用需求，GeneDock累積了豐富的組學(xué)數(shù)據(jù)應(yīng)用管理經(jīng)驗(yàn)积蔚，已支持包括三甲醫(yī)院意鲸、科研院所、國(guó)家疾控中心、基因檢測(cè)公司在內(nèi)的合作伙伴們建設(shè)具備組學(xué)數(shù)據(jù)集成怎顾、流程協(xié)作读慎、機(jī)器學(xué)習(xí)等能力的系統(tǒng)和平臺(tái)。
關(guān)于pFind
pFind團(tuán)隊(duì)自2002年成立以來(lái)槐雾，在計(jì)算蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域持續(xù)探索夭委，發(fā)展了一系列海量生物質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析算法，并在此基礎(chǔ)上提出了國(guó)內(nèi)首個(gè)具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的蛋白質(zhì)定性定量分析平臺(tái)pFind Studio募强。目前株灸，pFind系列軟件已在國(guó)內(nèi)外下載超過(guò)2,000套，遍布世界30余個(gè)國(guó)家和地區(qū)擎值，并實(shí)際支持了166項(xiàng)生物質(zhì)譜相關(guān)研究慌烧。
