題目

ACE2 correlated with immune infiltration serves as a prognostic biomarker in endometrial carcinoma and renal papillary cell carcinoma: implication for COVID-19

摘要

血管緊張素轉(zhuǎn)換酶2（ACE2）是腎素血管緊張素系統(tǒng)的成員张肾，但是袖牙，ACE2與UCEC（子宮內(nèi)膜癌）和KIRP（腎乳頭狀細(xì)胞癌）的預(yù)后之間的相關(guān)性尚不清楚。我們分析了Oncomine和TIMER數(shù)據(jù)庫中ACE2的表達(dá)水平，以及PrognoScan矮湘，GEPIA和Kaplan-Meier繪圖儀數(shù)據(jù)庫中ACE2與總體生存率的相關(guān)性凡橱。在TIMER數(shù)據(jù)庫中研究了ACE2與免疫浸潤水平和免疫細(xì)胞類型標(biāo)志物之間的相關(guān)性。在相關(guān)的免疫細(xì)胞亞組中進(jìn)一步進(jìn)行了基于ACE2表達(dá)水平的預(yù)后分析恒序。 ACE2啟動子甲基化配置文件已在UALCAN數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行了測試衷咽。此外鸽扁，我們使用GSE30589和GSE52920數(shù)據(jù)庫闡明了SARS-CoV感染后體內(nèi)和體外ACE2表達(dá)的變化。 UCEC和KIRP中ACE2升高镶骗，高ACE2預(yù)后良好桶现。 ACE2的表達(dá)與UCEC中KIRP，B細(xì)胞鼎姊，CD4 + T細(xì)胞骡和，中性粒細(xì)胞和樹突細(xì)胞免疫浸潤水平的巨噬細(xì)胞免疫浸潤水平呈正相關(guān)。 UCEC中相寇，ACE2與B細(xì)胞和嗜中性粒細(xì)胞慰于，巨噬細(xì)胞的類型標(biāo)志物呈顯著正相關(guān)，而KIRP中的ACE2與巨噬細(xì)胞的類型標(biāo)志物呈正相關(guān)裆赵。在UCEC和KIRP中东囚，高濃度的ACE2表達(dá)在不同的富集免疫細(xì)胞亞組中具有良好的預(yù)后。 UCEC和KIRP中ACE2的啟動子甲基化水平顯著降低战授。此外，我們發(fā)現(xiàn)SAR2-CoV感染后桨嫁，體內(nèi)和體外ACE2的表達(dá)均降低植兰。總之璃吧，ACE2在UCEC和KIRP中的表達(dá)顯著增加楣导，而ACE2的升高與免疫浸潤和預(yù)后呈正相關(guān)。此外畜挨，在UCEC和KIRP的COVID-19患者中筒繁，腫瘤組織可能更容易受到SARS-CoV-2感染噩凹，這可能會使預(yù)后惡化。

方法和材料

Oncomine數(shù)據(jù)庫分析

在Oncomine數(shù)據(jù)庫（https://www.oncomine.org/resource/main.html）中鑒定了ACE2在不同腫瘤中的表達(dá)毡咏。

PrognoScan驮宴，GEPIA和Kaplan-Meier數(shù)據(jù)庫中的生存分析。

為了分析各種腫瘤中ACE2表達(dá)的預(yù)后呕缭，PrognoScan（http://dna00.bio.kyutech.ac.jp/ PrognoScan / index.html）堵泽，GEPIA（http：// gepia。Cancer-pku.cn） /）和Kaplan-Meier（http://kmplot.com/）數(shù)據(jù)庫分別使用.

TIMER數(shù)據(jù)庫分析

TIMER是一個綜合的數(shù)據(jù)庫恢总，可以分析不同腫瘤的免疫侵襲水平以及不同腫瘤的基因表達(dá)差異（https://cistrome.shinyapps.io/timer/）迎罗。 我們使用TIMER數(shù)據(jù)庫確認(rèn)了ACE2在各種腫瘤中的表達(dá)。 然后使用TIMER算法估算ACE2與腫瘤中免疫浸潤（B細(xì)胞片仿，CD4 + T細(xì)胞纹安，CD8 + T細(xì)胞，嗜中性粒細(xì)胞砂豌，巨噬細(xì)胞和樹突細(xì)胞）的相關(guān)性钻蔑。

UALCAN數(shù)據(jù)庫分析

UALCAN是用于分析癌癥OMICS數(shù)據(jù)的全面的交互式Web資源（http：// ualcan。path.uab.edu/index.html）[32]奸鸯。 它基于PERL-CGI構(gòu)建咪笑，可用于評估不同基因的甲基化水平。 因此娄涩，在UALCAN數(shù)據(jù)庫中分析了ACE2啟動子甲基化窗怒。

微陣列數(shù)據(jù)收集

GEO（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）是公開的可以存檔微陣列和其他形式的存儲庫高通量功能基因組學(xué)數(shù)據(jù)，以及GSE30589和GSE52920的表達(dá)譜為在GEO數(shù)據(jù)庫中獲得蓄拣。

結(jié)果

image.png

圖1.ACE2在不同癌癥中的表達(dá)水平扬虚。 （A）ACE2在不同癌癥中與正常組織相比Oncomine數(shù)據(jù)庫。 （B）用TIMER檢測TCGA數(shù)據(jù)庫中不同腫瘤類型的ACE2表達(dá)水平

image.png

圖2.不同癌癥中ACE2高表達(dá)和低表達(dá)的Kaplan-Meier生存曲線比較

image.png

圖3. TIMER數(shù)據(jù)庫中UCEC和KIRP中ACE2表達(dá)與免疫浸潤之間的相關(guān)性球恤。

image.png

圖4.基于免疫細(xì)胞亞組的UCEC和KIRP中ACE2高表達(dá)和低表達(dá)的Kaplan-Meier生存曲線比較辜昵。

image.png

圖5. UCEC和KIRP中ACE2的啟動子甲基化水平。

image.png

圖6. SARS-CoV感染后ACE2的變化咽斧。 SARS-CoV降低了（A）Vero E6細(xì)胞和（B）小鼠中ACE2的表達(dá)水平肺