【項(xiàng)目文章篡殷,IF=12.53】基于質(zhì)譜流式研究的軟骨肉瘤免疫細(xì)胞分型,可預(yù)測(cè)免疫治療響應(yīng)人群

對(duì)于可切除的軟骨肉瘤(CHS)患者埋涧,手術(shù)切除是治療的有效手段板辽,但對(duì)于不能通過(guò)手術(shù)切除的軟骨肉瘤患者奇瘦,他們對(duì)放療和化療具有一定的抗性。最近有病例報(bào)道劲弦,PD-1免疫治療能夠?qū)е萝浌橇龅哪[瘤消退和完全反應(yīng)耳标,表明免疫治療對(duì)難治性惡性腫瘤具有一定積極治療作用。因此邑跪,對(duì)軟骨瘤患者進(jìn)行全面的免疫學(xué)評(píng)估次坡,確定的潛在的治療方案,進(jìn)而針對(duì)不同免疫微環(huán)境患者開(kāi)發(fā)針對(duì)性免疫治療方案是非常必要的画畅。

近日砸琅,浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬第二醫(yī)院葉招明和林秾教授團(tuán)隊(duì)基于CyTOF、WES轴踱、FACS症脂、IHC技術(shù),對(duì)98例人軟骨肉瘤樣本淫僻、4例人內(nèi)生軟骨瘤樣本以及4例人軟骨母細(xì)胞瘤樣本進(jìn)行了免疫系統(tǒng)深度剖析诱篷,以期挖掘預(yù)測(cè)免疫治療響應(yīng)的生物標(biāo)志物,其研究成果發(fā)表在《Clinical Cancer Research》(IF=12.53)上嘁傀。CyTOF檢測(cè)和分析服務(wù)由普羅亭完成兴蒸。

文章研究思路

文章研究思路

CyTOF揭示CHS的三種免疫表型

為明確CHS免疫細(xì)胞表型,研究人員利用CyTOF對(duì)22例來(lái)自WHOⅠ級(jí)(n=7)细办、Ⅱ級(jí)(n=14)和Ⅲ級(jí)(n=1)新鮮腫瘤標(biāo)本進(jìn)行分析橙凳。共鑒定出包括T細(xì)胞、CD11c+cDCs和一些髓系細(xì)胞在內(nèi)的11個(gè)CD45+細(xì)胞亞群(Fig.1B/C)笑撞,但未檢測(cè)到巨噬細(xì)胞和單核細(xì)胞岛啸。流式結(jié)果表明,CHS中幾乎沒(méi)有B細(xì)胞茴肥、NK細(xì)胞坚踩、NKT細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和M-MDSCs(Fig.1D-E)瓤狐。

根據(jù)免疫細(xì)胞表型瞬铸,研究人員將CHS腫瘤免疫表型分為I、II础锐、III三個(gè)亞型嗓节。其中III亞型為“冷”型腫瘤,幾乎沒(méi)有免疫細(xì)胞浸潤(rùn)皆警,處于“免疫沙漠”狀態(tài)拦宣;I和II亞型免疫細(xì)胞豐富,I亞型G-MDSCs細(xì)胞富集、II型富集大量的DCs和T細(xì)胞(Fig.1G)鸵隧。

Fig.1? CyTOF構(gòu)建CHS的免疫圖譜

CyTOF揭示不同軟骨腫瘤的免疫圖譜差異

為了進(jìn)一步研究不同類(lèi)型軟骨腫瘤的免疫特征差異绸罗,研究人員剖析研究了內(nèi)生軟骨瘤、軟骨肉瘤以及軟骨母細(xì)胞瘤的免疫細(xì)胞組成豆瘫。在鑒定出的25種CD45+免疫細(xì)胞中珊蟀,M1和M2巨噬細(xì)胞僅在軟骨母細(xì)胞瘤中出現(xiàn),G-MDSCs僅見(jiàn)于CHS中靡羡,對(duì)于CD8+T細(xì)胞系洛,軟骨母細(xì)胞瘤中活化的亞型明顯多于CHS俊性,且CHS中CD8+T細(xì)胞的大部分亞型是耗竭表型(Fig.2B/E)略步。這些結(jié)果表明,“G-MDSC富集”I 型和“免疫衰竭”II 型表型僅見(jiàn)于CHS中定页。

Fig.2? 軟骨肉瘤趟薄、內(nèi)生軟骨瘤和軟骨母細(xì)胞瘤瘤內(nèi)免疫細(xì)胞的比較

WES&CyTOF&FACS探究異檸檬酸脫氫酶(IDH)突變與免疫應(yīng)答和趨化因子水平相關(guān)性

由于基因突變可能會(huì)影響免疫細(xì)胞的功能,為了進(jìn)一步找出與CHS免疫亞型有關(guān)的潛在標(biāo)志物典徊,研究人員對(duì)22例經(jīng)過(guò)CyTOF免疫剖析的樣本進(jìn)行了全外顯子組測(cè)序(WES)杭煎,與其它突變相比,IDH1/2突變頻率最高(Fig.3A)卒落。將突變與CyTOF數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)羡铲,相比于野生型IDH1/2,IDH1/2突變型軟骨肉瘤免疫細(xì)胞富集(Fig.3D/E)儡毕。

隨后研究人員對(duì)瘤內(nèi)細(xì)胞的趨化因子進(jìn)行評(píng)估以探究為什么IDH1/2突變腫瘤具有更多的免疫細(xì)胞也切。研究發(fā)現(xiàn)IDH1/2突變型腫瘤微環(huán)境表達(dá)更高水平的CXCL9和CXCL12。此外腰湾,高表達(dá)水平的腫瘤代謝物D-2-羥基戊二酸(D-2-HG)僅在IDH1/2突變的CHS中存在雷恃,且其表達(dá)水平與在免疫識(shí)別抗原呈遞中起重要作用的cDCs以及趨化因子CXCL12水平呈正相關(guān)(Fig. 3H/I)。

Fig.3? 軟骨肉瘤基因突變及其與免疫細(xì)胞的關(guān)系

免疫細(xì)胞表型臨床特征關(guān)聯(lián)性分析

研究人員進(jìn)一步研究了腫瘤分級(jí)费坊、瘤周水腫和粘液樣變?nèi)齻€(gè)臨床特征倒槐,以探究這些特征能否幫助預(yù)測(cè)腫瘤患者的免疫狀態(tài)。研究發(fā)現(xiàn)高分化級(jí)別以及瘤周水腫患者附井,免疫細(xì)胞浸潤(rùn)更多讨越,尤其是CD8+T細(xì)胞和cDCs(Fig.4C/F)。此外永毅,粘液樣變樣本幾乎沒(méi)有免疫細(xì)胞浸潤(rùn)把跨。

前面的研究證明這三個(gè)臨床特征能夠小隊(duì)列預(yù)測(cè)免疫狀態(tài),那在大隊(duì)列研究中是否也成立呢卷雕?通過(guò)對(duì)77例樣本的研究發(fā)現(xiàn)节猿,具有更高級(jí)別、瘤周水腫或粘液樣轉(zhuǎn)化的病例具有更多的T細(xì)胞和PD-1+TIM-3+Tex細(xì)胞富集(Fig.4L)。

Fig.4? 臨床表現(xiàn)與免疫細(xì)胞的相關(guān)性

通過(guò)與CHS的三種免疫亞型與臨床特征匹配研究滨嘱,免疫細(xì)胞浸潤(rùn)亞型(Ⅰ峰鄙、Ⅱ亞型)病例均為高級(jí)別腫瘤,廣泛的瘤周水腫僅見(jiàn)于免疫反應(yīng)性個(gè)體太雨,I型G-MDSC以黏液樣變?yōu)樘卣饕髁瘛4送猓跓o(wú)粘液樣變的病例中囊扳,IDH突變和高度分化級(jí)別患者具有耗竭型免疫微環(huán)境(亞型II)(Fig.5)吩翻。

Fig.5? 臨床特征的生物標(biāo)志物有助于CHS的免疫分型

PD-1免疫療法僅在II型患者中顯示出疾病控制

研究人員進(jìn)一步分析了免疫系統(tǒng)的分類(lèi)是否可以幫助預(yù)測(cè)免疫治療響應(yīng)。研究人員入組了12例不可切除的CHS患者锥咸,并通過(guò)臨床特征狭瞎、基因組信息等進(jìn)行了患者的免疫分型,研究了免疫治療后的疾病進(jìn)展搏予。研究發(fā)現(xiàn)免疫治療后得到控制的三個(gè)患者都屬于II型"免疫衰竭“類(lèi)型熊锭,而I型或III亞型病例均未觀察到腫瘤控制(Fig.6)。

Fig.6? 三例CHS病例受益于免疫療法

IDH突變誘導(dǎo)的免疫應(yīng)答具有CXCL2依賴(lài)性

最后研究人員通過(guò)小鼠癌細(xì)胞系構(gòu)建的小鼠同質(zhì)模型評(píng)估了基于PD-1免疫治療的免疫依賴(lài)性雪侥。研究發(fā)現(xiàn)小鼠腫瘤組織中CXCL12表達(dá)水平顯著升高碗殷,CXCL12基因敲除能夠減弱IDH突變對(duì)瘤內(nèi)免疫細(xì)胞的富集,且腫瘤浸潤(rùn)DC(TIDC)輸注和PD-1抗體免疫療法以及聯(lián)合治療不能延緩CXCL12小鼠敲除模型的存活期速缨。此外锌妻,OVA特異性O(shè)T-I細(xì)胞研究發(fā)現(xiàn)過(guò)繼細(xì)胞免疫治療顯著延長(zhǎng)了小鼠存活時(shí)間,但CXCL12拮抗劑部分消除了抗腫瘤作用旬牲。

Fig.7? IDH突變介導(dǎo)的免疫應(yīng)答具有趨化因子依賴(lài)性

文章總結(jié)

該研究中仿粹,研究人員基于CyTOF和流式細(xì)胞技術(shù),將CHS腫瘤免疫微環(huán)境分為三種表型:I型引谜,“G-MDSC細(xì)胞富集”型牍陌,其HLA-DR-CD14-髓系細(xì)胞富集;Ⅱ型:“免疫耗竭”型员咽,耗竭性T細(xì)胞和樹(shù)突狀細(xì)胞浸潤(rùn)毒涧;Ⅲ型:“免疫沙漠”型,幾乎無(wú)免疫細(xì)胞浸潤(rùn)贝室。將臨床特征與免疫細(xì)胞分型關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn)契讲,免疫細(xì)胞豐富的亞型(亞型I和亞型II)以IDH突變、病理高度分級(jí)和瘤周水腫為特征滑频,且亞型I特異性表現(xiàn)為黏液樣變捡偏。在接受抗PD-1免疫治療并癥狀緩解患者的免疫表型為II亞型。此外峡迷,對(duì)其機(jī)制進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)IDH突變顯著提高了免疫失活腫瘤中趨化因子表達(dá)水平和免疫細(xì)胞浸潤(rùn)银伟。

該研究繪制了軟骨肉瘤全面綜合的免疫圖譜你虹,為基于軟骨瘤免疫分型用于預(yù)測(cè)免疫狀態(tài)和免疫治療響應(yīng)預(yù)測(cè)提供了重要的理論參考。

【參考文獻(xiàn)】

Li B,?et al. Fresh Tissue Multi-omics Profiling Reveals Immune Classification and Suggests Immunotherapy Candidates for Conventional Chondrosarcoma. Clin Cancer Res. 2021?.

原文鏈接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34426437/

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