Date: 27th september 2019
-本章內(nèi)容較多，其相對(duì)較難邪乍，因此降狠，我們將會(huì)分為幾部分進(jìn)行記錄。
5.1 簡介（略）
5.2 圖層疊加的總體策略
圖層有三種用途
1）用以展示數(shù)據(jù)本身
2）用以展示數(shù)據(jù)的統(tǒng)計(jì)摘要
3）用以添加額外的元數(shù)據(jù)
5.3 基本圖形類型
geom_area() 用于繪制面積圖
geom_bar() 用于繪制條形圖
geom_line() 用于繪制線條圖
geom_point() 用于繪制散點(diǎn)圖
geom_polygon() 用于繪制多邊圖
geom_text() 可以指定點(diǎn)添加標(biāo)簽庇楞。他是唯一一個(gè)額外圖形屬性的：它需指定label參數(shù)榜配。可以通過設(shè)置可選的圖形屬性hjust和vjust來控制文本的橫縱位置吕晌。
geom_tile() 用來繪制色深圖（image plot)或水平圖（level plot)
繪制以上幾種幾何圖形
df <- data.frame(
x = c(3,1,5),
y = c(2,4,6),
label = c("a", "b", "c")
)
p <- ggplot(df, aes(x,y)) + xlab(NULL) + ylab(NULL)
p + geom_point() + labs(title = "geom_point") #散點(diǎn)圖
p + geom_bar(stat = "identity") + labs(title = "geom_bar(stat=\"identity\")") #直方圖
p + geom_line() + labs(title = "geom_line") #線性圖
p + geom_area() + labs(title = "geom_area") #面積
p + geom_path() + labs(title = "geom_path") #路徑圖
p + geom_text(aes(label =label)) + labs(title = "geom_text") #添加標(biāo)簽
p + geom_tile() + labs(title = "geom_tile") #深色圖
p + geom_polygon() + labs(title = "geom_polygon") #多邊形
5. 4 展示數(shù)據(jù)分布
改變組距寬度（binwidth)或顯示精確指定切分位置（breadks)
有多種方式可以用來進(jìn)行分布的跨組比較：同時(shí)繪制多個(gè)小的直方圖蛋褥，facets = . ~var；使用頻率多邊形（frequency polygon）睛驳，geom = "freqploly"烙心；或者使用條件密度圖， position = "fill"
depth_dist <- ggplot(diamonds, aes(depth)) + xlim(58,58)
depth_dist + geom_histogram(aes(y = ..densitiy..), binwidth = 0.1) +
facet_grid(cut ~.)
depth_dist +geom_histogram(aes(fill = cut ), binwidth = 0.1, position = "fill")
depth_dist + geom_freqpoly(aes(y = ..dendity.., colour = cut),
binwidth = 0.1)
作為幾何對(duì)象的直方圖和頻率多邊形均使用stat_bin統(tǒng)計(jì)變換乏沸。次統(tǒng)計(jì)變換生成了兩個(gè)輸出變量count和density淫茵。變量count為默認(rèn)值
geom_boxplot = stat_boxplot +geom_boxplot #箱線圖，即一個(gè)連續(xù)型變量針對(duì)一個(gè)類別變量條件所得的圖形
箱線圖也可以對(duì)連續(xù)變量取條件蹬跃，前提是數(shù)據(jù)預(yù)先經(jīng)過巧妙的封箱（binning)處理
箱線圖
library(plyr)
qplot(cut, deoth, data = diamonds, geom = "boxplot")
qplot(carat, depth, data = diamonds, geom = "boxplot",
group = round_any(carat, 0.1,floor), xlim = c(0,3))
#圖解釋：對(duì)于連續(xù)型變量痘昌，必須設(shè)置group圖形屬性以得到多個(gè)箱線圖。此處使用了group = round_any(carat, 0.1, floor)
####來獲得針對(duì)變量carat以0,1單位為大小封箱后的箱線圖
geom_jitter = position_jitter + geom_jitter :通過在離散型分布 上添加隨機(jī)噪聲以避免遮蓋繪制完問題，這是一種較為粗糙的方法辆苔。
qplot(class, cty, data = mpg, geom = "jitter")
qplot(class, drv, data = mpg, geom = "jitter")
geom_density = stat_density + geom_area ##基于核平滑方法進(jìn)行平滑后得到頻率多邊形算灸。 僅在已知潛在的密度分布為平滑、連續(xù)且無界的時(shí)候使用這種密度圖驻啤。
qplot(depth, data = diamonds, geom = "density", xlim = c(54, 70)) #變量depth的密度圖
qplot(depth, data = diamonds, geom = "density", xlim = c(54, 70),
fill = cut, alpha = I(0.2)) #按照變量cut的不同取值上色
5.5 處理遮蓋繪制問題
散點(diǎn)圖是研究兩個(gè)連續(xù)型變量間關(guān)系的重要工具菲驴， 但是數(shù)據(jù)量很大時(shí)，這些點(diǎn)出現(xiàn)重疊問題骑冗，從而掩蓋真實(shí)關(guān)系赊瞬，這種為為“遮蓋繪制（overplotting)”
#下圖所用數(shù)據(jù)從兩個(gè)獨(dú)立的正態(tài)分布中所得的2000個(gè)點(diǎn)，
df <- data.frame(x = rnorm(2000), y = rnorm(2000))
nrom <- ggplot(df, aes(x, y))
norm + geom_point()
norm + geom_point(shaoe = 1)
norm + geom_point(shape = ".")
###使用"alpha"進(jìn)行透明度的設(shè)置
norm + geom_point(colour = "black", alpha = 1/3)
##數(shù)據(jù)離散性 設(shè)置兩個(gè)連續(xù)整數(shù)間距的一半（0.5）作為打散的寬度
td <- ggplot(diamonds, aes(table, depth)) +
xlim(50, 70) + ylim(50, 70)
td + geom_point()
td + geom_jitter()
td +geom_jitter(width = 0.5, alpha = 1/10) ##alpha 參數(shù)調(diào)節(jié)透明度
td + geom_jitter(position = jit)
td + geom_jitter(position = jit, colour = "black", alpha = 1/10) #調(diào)節(jié)透明度
第五章的后半部分內(nèi)容將在一節(jié)進(jìn)行描述
ggplot2: 第二章 -全網(wǎng)最全的教程
ggplot2:第三章-語法突破
ggplot2:第四章-用圖層構(gòu)建圖像
ggplot2：第五章-工具箱(一）
