來自醫(yī)學(xué)基因組學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室泄隔、上海血液學(xué)研究所副研究員陳冰于2018年發(fā)表在International Journal of Laboratory Hematology的文章Mutation profile and associated clinical features in Chinese patients with cytogenetically normal acute myeloid leukemia
摘要
導(dǎo)言:細(xì)胞遺傳學(xué)正常的急性髓系白血病(CN-AML)占AML患者總數(shù)的近一半噪漾,是AML的高度異質(zhì)性子集驻啤。CN-AML的具體遺傳特征和種族特征值得研究框产。
方法:采用深度測序技術(shù)檢測152例中國CN-AML患者39個(gè)基因的突變模式,并分析其臨床特征悬荣。
結(jié)果:145例(95.4%)患者共檢測到39個(gè)基因的503個(gè)突變菠秒,平均每個(gè)病例3個(gè)突變。9個(gè)基因(NPM1氯迂、CEBPA践叠、DNMT3A、GATA2嚼蚀、NRAS禁灼、TET2、FLT3轿曙、IDH2和WT1)在超過10%的患者中發(fā)生突變弄捕。髓系轉(zhuǎn)錄因子、激活信號和DNA甲基化的功能組受影響最大导帝。復(fù)發(fā)基因的變異等位基因頻率(VAF)在不同功能組中的分布不同守谓。CEBPA和GATA2的高突變率以及FLT3-ITD的低突變率似乎是中國患者的顯著特征。此外您单,發(fā)現(xiàn)CEBPAbi和GATA2在M2亞型中突變最多斋荞,而NPM1和DNMT3A在M4和M5中突變更多。預(yù)后分析確定CEBPAmo突變?yōu)榇我蛩嘏扒亍_x擇FLT3-ITD平酿、TP53、DNMT3A羡疗、CEBPAmo和WT1突變作為高危標(biāo)記物染服,以識(shí)別預(yù)后不良的CN-AML患者。
結(jié)論:本研究為中國CN-AML患者的民族遺傳特征和臨床相關(guān)性提供了有價(jià)值的信息叨恨。
介紹
急性髓系白血病(AML)是一種臨床和生物學(xué)上的異質(zhì)性疾病挖垛。數(shù)十年的細(xì)胞遺傳學(xué)和分子研究揭示了發(fā)病機(jī)制的基因異常痒钝,并產(chǎn)生了分子診斷和預(yù)后評估系統(tǒng),特別是在應(yīng)用下一代測序(NGS)技術(shù)之后痢毒。由于癌癥基因組圖譜(TCGA)小組已通過全基因組(WGS)或全外顯子組測序(WES)在200例AML患者中識(shí)別出23個(gè)顯著突變的基因送矩,在幾個(gè)大型AML隊(duì)列中研究了突變模式和相對預(yù)后評估,進(jìn)一步提高了診斷的準(zhǔn)確性哪替。
突變模式在不同人群中呈現(xiàn)一定的異質(zhì)性栋荸。例如,TP53突變與復(fù)雜的核型和不良預(yù)后高度相關(guān),10例繼發(fā)性AML顯示更多ASXL1突變和IDH2晌块、TET2和DNMT3A突變的發(fā)生率隨年齡增加而增加爱沟。值得注意的是,由于觀察到正常核型(細(xì)胞遺傳學(xué)正常AML匆背,CN-AML)患者中NPM1和DNMT3A等幾個(gè)驅(qū)動(dòng)基因的突變頻率更高呼伸,因此CN-AML中的突變分布可能是特殊的。
對于預(yù)后預(yù)測钝尸,歐洲白血病網(wǎng)絡(luò)(ELN)和國家綜合癌癥網(wǎng)絡(luò)(NCCN)等公認(rèn)的國際風(fēng)險(xiǎn)分層系統(tǒng)更依賴細(xì)胞遺傳學(xué)異常括享,以及NPM1、CEBPAbi珍促、FLT3-ITD和TP53突變來區(qū)分一些低風(fēng)險(xiǎn)或高風(fēng)險(xiǎn)患者铃辖。在ELN和NCCN風(fēng)險(xiǎn)分類中,約50%核型正常(CN-AML)的AML患者被分為中等風(fēng)險(xiǎn)組猪叙,這實(shí)際上包括缺乏精確預(yù)后指導(dǎo)的高度異質(zhì)性患者澳叉。因此,CN-AML的突變模式以及精細(xì)的臨床和預(yù)后相關(guān)性需要闡明沐悦。
此外成洗,血液系統(tǒng)惡性腫瘤中分子標(biāo)記分布的種族差異;例如藏否,與西方人群相比瓶殃,中國B細(xì)胞急性淋巴細(xì)胞白血病患者的t(9;22)/BCR-ABL1的頻率更高,t(12;21)/ETV6-RUNX1的頻率更低副签,亞洲慢性淋巴細(xì)胞白血病患者的3q和18q gain更為常見遥椿。CN-AML突變譜的種族差異也值得研究。
利用target深度測序策略淆储,我們在這里報(bào)道了對152例中國CN-AML患者基因突變的綜合研究冠场,旨在深入了解獨(dú)特的基因圖譜和更好的風(fēng)險(xiǎn)咨詢,并為臨床實(shí)踐提供有價(jià)值的信息本砰。