前言
MaxQuant免費(fèi)不開源惶楼，相對(duì)其他各大廠商壟斷的軟件來說眶痰，實(shí)在是良心軟件茉稠，尤其對(duì)labelfree數(shù)據(jù)準(zhǔn)確性和蛋白鑒定數(shù)都有較好的優(yōu)勢削解。缺點(diǎn)也是很明顯，Linux不友好灵嫌。雖然官方也發(fā)文支持Linux系統(tǒng)MaxQuant goes Linux壹罚，但普遍認(rèn)為體驗(yàn)感不好。
官方關(guān)于這方面的文檔很少寿羞，只是寥寥數(shù)語描述幾句：
- Install Mono Framework 5.4.1 or higher
- Edit mqpar.xml file
- run MaxQuant
有個(gè)小哥看不下去猖凛，更為詳細(xì)的介紹了一下：MaxQuant in Linux，可參考他的倉庫：https://github.com/blahoink/maxquant_linux_guide
安裝
mono源碼安裝：
http://download.mono-project.com/sources/mono
MaxQuant安裝：
下載解壓即可绪穆。
試運(yùn)行
/path/to/bin/mono /path/to/MaxQuant/bin/MaxQuantCmd.exe mqpar.xml
先占坑辨泳，后補(bǔ)充......
