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這篇教程是我在2019年9月左右分析WGD時的筆記。目前來看踪栋,背景介紹和軟件使用說明都基本沒啥問題焙格。但是現(xiàn)在更建議大家使用wgdi進(jìn)行比較基因組學(xué)中相關(guān)分析,教程見如何用WG...
包括基因成員的序列特征分析(分子量等電點等)基于motif分析成員序列保守特征與可視化(蛋白與核酸夷都,可用于挖掘未知眷唉,尤其是核酸水平-非編碼水平的保守)基于domain分析成員...
相信多倍體(polyploid)對于生信人的讀者來說不會陌生。一般意義上認(rèn)為囤官,多倍體和基因組倍增(whole genome duplication)的涵義是相同的冬阳。這里的重點...
前言 很多關(guān)注我這個專題的朋友都在后臺留言,說想了解更多關(guān)于SNP過濾的東西党饮。是的肝陪,確實這是一個比較重要的問題。第一劫谅,過濾到一些低質(zhì)量的SNP可以防止calling一些假陽性...
趨同進(jìn)化见坑,是指親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的兩個或多個類群由于長期處于相似的生活環(huán)境,受到相似的選擇壓力的影響從而進(jìn)化出相似的功能或表型特征捏检。例如荞驴,鳥類與蝙蝠為了適應(yīng)飛行進(jìn)化出相似的翅膀,鯊...
在常規(guī)的基因組分析中贯城,當(dāng)我們對某一物種的基因組進(jìn)行從頭組裝與注釋獲得其的基本信息后熊楼,通常會想知道該物種與一些其他近源物種之間的進(jìn)化關(guān)系,此時就需要構(gòu)建不同物種之間的系統(tǒng)發(fā)育樹...